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Lista de obras de Markus Göker

1,003 reference genomes of bacterial and archaeal isolates expand coverage of the tree of life

artículo científico

100-year-old enigma solved: identification, genomic characterization and biogeography of the yet uncultured Planctomyces bekefii

artículo científico publicado en 2019

16S-rRNA-based analysis of bacterial diversity in the gut of fungus-cultivating termites (Microtermes and Odontotermes species).

artículo científico publicado en 2013

A Clustering Optimization Strategy for Molecular Taxonomy Applied to Planktonic Foraminifera SSU rDNA

artículo científico publicado en 2010

A clustering optimization strategy to estimate species richness of Sebacinales in the tropical Andes based on molecular sequences from distinct DNA regions

article

A publicly accessible database for Clostridioides difficile genome sequences supports tracing of transmission chains and epidemics

artículo científico publicado en 2020

A revision of Bremia graminicola

artículo científico publicado en 2006

A revision of Plasmopara penniseti, with implications for the host range of the downy mildews with pyriform haustoria

artículo científico publicado en 2007

A taxonomic framework for emerging groups of ecologically important marine gammaproteobacteria based on the reconstruction of evolutionary relationships using genome-scale data

artículo científico publicado en 2015

Analysis of 1,000 Type-Strain Genomes Improves Taxonomic Classification of Bacteroidetes

artículo científico publicado en 2019

Analysis of 1,000+ Type-Strain Genomes Substantially Improves Taxonomic Classification of Alphaproteobacteria

artículo científico publicado en 2020

Ancestral regulatory mechanisms specify conserved midbrain circuitry in arthropods and vertebrates

artículo científico publicado en 2020

Anther smuts of Caryophyllaceae: Molecular characters indicate host-dependent species delimitation

article

AxPcoords & parallel AxParafit: statistical co-phylogenetic analyses on thousands of taxa

artículo científico publicado en 2007

Belliella kenyensis sp. nov., isolated from an alkaline lake

artículo científico publicado en 2014

Biofilm plasmids with a rhamnose operon are widely distributed determinants of the 'swim-or-stick' lifestyle in roseobacters

artículo científico publicado en 2016

COPYCAT : cophylogenetic analysis tool

article

Charcoal filter paper improves the viability of cryopreserved filamentous ectomycorrhizal and saprotrophic Basidiomycota and Ascomycota

article

Choosing one name for pleomorphic fungi: The example of Aspergillus versus Eurotium, Neosartorya and Emericella

artículo científico publicado en 2016

Chryseobacterium hispalense sp. nov., a plant-growth-promoting bacterium isolated from a rainwater pond in an olive plant nursery, and emended descriptions of Chryseobacterium defluvii, Chryseobacterium indologenes, Chryseobacterium wanjuense and Ch

artículo científico publicado en 2013

Chryseobacterium oleae sp. nov., an efficient plant growth promoting bacterium in the rooting induction of olive tree (Olea europaea L.) cuttings and emended descriptions of the genus Chryseobacterium, C. daecheongense, C. gambrini, C. gleum, C. joo

artículo científico publicado en 2014

Cobaviruses – a new globally distributed phage group infecting Rhodobacteraceae in marine ecosystems

artículo científico publicado en 2019

Codivergence of mycoviruses with their hosts

artículo científico publicado en 2011

Comparative genomics of biotechnologically important yeasts

artículo científico publicado en 2016

Comparing polysaccharide decomposition between the type strains Gramella echinicola KMM 6050(T) (DSM 19838(T)) and Gramella portivictoriae UST040801-001(T) (DSM 23547(T)), and emended description of Gramella echinicola Nedashkovskaya et al. 2005 eme

artículo científico publicado en 2016

Complete genome sequence of 'Thermobaculum terrenum' type strain (YNP1).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Acetohalobium arabaticum type strain (Z-7288)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Acidaminococcus fermentans type strain (VR4).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Acidimicrobium ferrooxidans type strain (ICP).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Actinosynnema mirum type strain (101).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Alicyclobacillus acidocaldarius type strain (104-IA)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Aminobacterium colombiense type strain (ALA-1).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Anaerococcus prevotii type strain (PC1).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Arcanobacterium haemolyticum type strain (11018)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Archaeoglobus profundus type strain (AV18)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Arcobacter nitrofigilis type strain (CI)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Atopobium parvulum type strain (IPP 1246)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Bacteroides helcogenes type strain (P 36-108).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Bacteroides salanitronis type strain (BL78).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Beutenbergia cavernae type strain (HKI 0122).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Brachybacterium faecium type strain (Schefferle 6-10).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Brachyspira murdochii type strain (56-150)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Calditerrivibrio nitroreducens type strain (Yu37-1)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Capnocytophaga ochracea type strain (VPI 2845).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Catenulispora acidiphila type strain (ID 139908).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Cellulomonas flavigena type strain (134).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Cellulophaga algicola type strain (IC166)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Cellulophaga lytica type strain (LIM-21).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Chitinophaga pinensis type strain (UQM 2034).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Conexibacter woesei type strain (ID131577).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Coraliomargarita akajimensis type strain (04OKA010-24).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Coriobacterium glomerans type strain (PW2(T)) from the midgut of Pyrrhocoris apterus L. (red soldier bug).

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of Cryptobacterium curtum type strain (12-3)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of DSM 30083(T), the type strain (U5/41(T)) of Escherichia coli, and a proposal for delineating subspecies in microbial taxonomy

artículo científico publicado en 2014

Complete genome sequence of Deinococcus maricopensis type strain (LB-34). ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Denitrovibrio acetiphilus type strain (N2460)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Desulfarculus baarsii type strain (2st14).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Desulfobulbus propionicus type strain (1pr3)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Desulfohalobium retbaense type strain (HR(100)).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Desulfomicrobium baculatum type strain (X)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Desulfotomaculum acetoxidans type strain (5575)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Desulfurococcus mucosus type strain (O7/1). ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Dyadobacter fermentans type strain (NS114)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Eggerthella lenta type strain (IPP VPI 0255).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Ferrimonas balearica type strain (PAT).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Geodermatophilus obscurus type strain (G-20)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Gordonia bronchialis type strain (3410).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Haliangium ochraceum type strain (SMP-2)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Haliscomenobacter hydrossis type strain (O)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Halogeometricum borinquense type strain (PR3)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Halomicrobium mukohataei type strain (arg-2)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Halorhabdus utahensis type strain (AX-2)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Haloterrigena turkmenica type strain (4k)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Hirschia baltica type strain (IFAM 1418(T))

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Hydrogenobacter thermophilus type strain (TK-6)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Ignisphaera aggregans type strain (AQ1.S1)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Ilyobacter polytropus type strain (CuHbu1). ⬇️

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Intrasporangium calvum type strain (7 KIP).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Isosphaera pallida type strain (IS1B).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Jiangella gansuensis strain YIM 002T (DSM 44835T), the type species of the genus Jiangella and source of new antibiotic compounds

artículo científico publicado en 2017

Complete genome sequence of Jonesia denitrificans type strain (Prevot 55134)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Kangiella koreensis type strain (SW-125).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Kribbella flavida type strain (IFO 14399).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Kytococcus sedentarius type strain (541).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Leadbetterella byssophila type strain (4M15).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Leptotrichia buccalis type strain (C-1013-b).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Mahella australiensis type strain (50-1 BON).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Marivirga tractuosa type strain (H-43) ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Meiothermus ruber type strain (21)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Meiothermus silvanus type strain (VI-R2)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Methanoplanus petrolearius type strain (SEBR 4847)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Methanothermus fervidus type strain (V24S)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Nakamurella multipartita type strain (Y-104).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Nitratifractor salsuginis type strain (E9I37-1).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Nocardiopsis dassonvillei type strain (IMRU 509).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Oceanithermus profundus type strain (506) ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Odoribacter splanchnicus type strain (1651/6). ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Olsenella uli type strain (VPI D76D-27C)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Paludibacter propionicigenes type strain (WB4).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Pedobacter heparinus type strain (HIM 762-3).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Pirellula staleyi type strain (ATCC 27377)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Planctomyces brasiliensis type strain (DSM 5305(T)), phylogenomic analysis and reclassification of Planctomycetes including the descriptions of Gimesia gen. nov., Planctopirus gen. nov. and Rubinisphaera gen. nov. and eme

artículo científico publicado en 2014

Complete genome sequence of Planctomyces limnophilus type strain (Mü 290).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus type strain (QLW-P1DMWA-1(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of Rhodospirillum rubrum type strain (S1).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Rhodothermus marinus type strain (R-10).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Riemerella anatipestifer type strain (ATCC 11845).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Riemerella anatipestifer type strain (ATCC 11845T)

article

Complete genome sequence of Saccharomonospora viridis type strain (P101).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Sanguibacter keddieii type strain (ST-74)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Sebaldella termitidis type strain (NCTC 11300).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Segniliparus rotundus type strain (CDC 1076)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Slackia heliotrinireducens type strain (RHS 1)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Sphaerobacter thermophilus type strain (S 6022)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Spirochaeta smaragdinae type strain (SEBR 4228).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Spirosoma linguale type strain (1)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Stackebrandtia nassauensis type strain (LLR-40K-21).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Streptobacillus moniliformis type strain (9901)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Streptosporangium roseum type strain (NI 9100).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Sulfurimonas autotrophica type strain (OK10).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Sulfurospirillum deleyianum type strain (5175).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Syntrophobotulus glycolicus type strain (FlGlyR).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Syntrophobotulus glycolicus type strain (FlGlyRT)

article

Complete genome sequence of Syntrophothermus lipocalidus type strain (TGB-C1)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermaerobacter marianensis type strain (7p75a)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermanaerovibrio acidaminovorans type strain (Su883).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Thermobispora bispora type strain (R51).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermocrinis albus type strain (HI 11/12)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermomonospora curvata type strain (B9).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Thermosediminibacter oceani type strain (JW/IW-1228P)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermosphaera aggregans type strain (M11TL)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Tolumonas auensis type strain (TA 4)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Treponema succinifaciens type strain (6091).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Truepera radiovictrix type strain (RQ-24)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Tsukamurella paurometabola type strain (no. 33).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Veillonella parvula type strain (Te3)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Vulcanisaeta distributa type strain (IC-017)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Weeksella virosa type strain (9751).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Xylanimonas cellulosilytica type strain (XIL07)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of the Phaeobacter gallaeciensis type strain CIP 105210(T) (= DSM 26640(T) = BS107(T)).

artículo científico publicado en 2014

Complete genome sequence of the acetate-degrading sulfate reducer Desulfobacca acetoxidans type strain (ASRB2).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the aerobic, heterotroph Marinithermus hydrothermalis type strain (T1(T)) from a deep-sea hydrothermal vent chimney

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the aquatic bacterium Runella slithyformis type strain (LSU 4(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the bacteriochlorophyll a-containing Roseibacterium elongatum type strain (DSM 19469(T)), a representative of the Roseobacter group isolated from Australian coast sand

artículo científico publicado en 2014

Complete genome sequence of the bile-resistant pigment-producing anaerobe Alistipes finegoldii type strain (AHN2437(T)).

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of the extremely halophilic Halanaerobium praevalens type strain (GSL)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the facultatively anaerobic, appendaged bacterium Muricauda ruestringensis type strain (B1(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the facultatively chemolithoautotrophic and methylotrophic alpha Proteobacterium Starkeya novella type strain (ATCC 8093(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the facultatively chemolithoautotrophic and methylotrophic alpha Proteobacterium Starkeya novella type strain (ATCC 8093T)

Complete genome sequence of the filamentous gliding predatory bacterium Herpetosiphon aurantiacus type strain (114-95(T)).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the gliding freshwater bacterium Fluviicola taffensis type strain (RW262).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the gliding, heparinolytic Pedobacter saltans type strain (113)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the haloalkaliphilic, obligately chemolithoautotrophic thiosulfate and sulfide-oxidizing γ-proteobacterium Thioalkalimicrobium cyclicum type strain ALM 1 (DSM 14477(T)).

artículo científico publicado en 2016

Complete genome sequence of the halophilic and highly halotolerant Chromohalobacter salexigens type strain (1H11(T)).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the halophilic bacterium Spirochaeta africana type strain (Z-7692(T)) from the alkaline Lake Magadi in the East African Rift

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of the hyperthermophilic chemolithoautotroph Pyrolobus fumarii type strain (1A)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the marine methyl-halide oxidizing Leisingera methylohalidivorans type strain (DSM 14336(T)), a representative of the Roseobacter clade

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of the moderate thermophile Anaerobaculum mobile type strain (NGA(T)).

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of the moderately thermophilic mineral-sulfide-oxidizing firmicute Sulfobacillus acidophilus type strain (NAL(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the orange-red pigmented, radioresistant Deinococcus proteolyticus type strain (MRP(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the sulfate-reducing firmicute Desulfotomaculum ruminis type strain (DL(T))

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the sulfur compounds oxidizing chemolithoautotroph Sulfuricurvum kujiense type strain (YK-1(T))

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the termite hindgut bacterium Spirochaeta coccoides type strain (SPN1(T)), reclassification in the genus Sphaerochaeta as Sphaerochaeta coccoides comb. nov. and emendations of the family Spirochaetaceae and the genus Spha

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the thermophilic sulfate-reducing ocean bacterium Thermodesulfatator indicus type strain (CIR29812(T))

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the thermophilic sulfur-reducer Desulfurobacterium thermolithotrophum type strain (BSA(T)) from a deep-sea hydrothermal vent

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the thermophilic sulfur-reducer Hippea maritima type strain (MH(2))

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the thermophilic, hydrogen-oxidizing Bacillus tusciae type strain (T2) and reclassification in the new genus, Kyrpidia gen. nov. as Kyrpidia tusciae comb. nov. and emendation of the family Alicyclobacillaceae da Costa and

artículo científico publicado en 2011

Controlling false discoveries in high-dimensional situations: boosting with stability selection.

artículo científico publicado en 2015

Correction: Genomic and Genetic Diversity within the Pseudomonas fluorescens Complex

artículo científico publicado en 2016

Corrigendum: Genome-Based Taxonomic Classification of Bacteroidetes

artículo científico publicado en 2018

Critical Assessment of Metagenome Interpretation-a benchmark of metagenomics software.

artículo científico publicado en 2017

Cutaneotropic Human β-/γ-Papillomaviruses Are Rarely Shared between Family Members

artículo científico publicado en 2009

Description of Geodermatophilus amargosae sp. nov., to accommodate the not validly named Geodermatophilus obscurus subsp. amargosae (Luedemann, 1968).

artículo científico publicado en 2013

Description of Trichococcus ilyis sp. nov. by combined physiological and in silico genome hybridization analyses

artículo científico publicado en 2016

Description of gamma radiation-resistant Geodermatophilus dictyosporus sp. nov. to accommodate the not validly named Geodermatophilus obscurus subsp. dictyosporus (Luedemann, 1968).

artículo científico publicado en 2014

Digital DNA-DNA hybridization for microbial species delineation by means of genome-to-genome sequence comparison

artículo científico publicado en 2010

Diversity of Termitomyces associated with fungus-farming termites assessed by cultural and culture-independent methods

artículo científico publicado en 2013

Draft Genome Sequence of Frankia Strain G2, a Nitrogen-Fixing Actinobacterium Isolated from Casuarina equisetifolia and Able To Nodulate Actinorhizal Plants of the Order Rhamnales

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequences of Six Type Strains of the Genus Massilia

artículo científico publicado en 2020

Draft genome sequence of Marinobacterium rhizophilum CL-YJ9T (DSM 18822T), isolated from the rhizosphere of the coastal tidal-flat plant Suaeda japonica

artículo científico publicado en 2017

Dual function of tropodithietic acid as antibiotic and signaling molecule in global gene regulation of the probiotic bacterium Phaeobacter inhibens

artículo científico publicado en 2017

En route to a genome-based classification of Archaea and Bacteria?

artículo científico publicado en 2010

Erratum to: Complete genome sequence of Atopobium parvulum type strain (IPP 1246).

artículo científico publicado en 2010

Erratum to: Complete genome sequence of Pirellula staleyi type strain (ATCC 27377)

artículo científico publicado en 2010

Erratum to: Description of Geodermatophilus amargosae sp. nov., to Accommodate the Not Validly Named Geodermatophilus obscurus subsp. amargosae (Luedemann, 1968)

scholarly article published in Current Microbiology

Erratum: 1,003 reference genomes of bacterial and archaeal isolates expand coverage of the tree of life

scholarly article published in Nature Biotechnology

Expanding the genomic encyclopedia of Actinobacteria with 824 isolate reference genomes

artículo científico publicado en 2022

Extrachromosomal, extraordinary and essential--the plasmids of the Roseobacter clade

artículo científico

Filling the gaps: missing taxon names at the ranks of class, order and family ⬇️

artículo científico publicado en 2022

Fine-structured multi-scaling long-range correlations in completely sequenced genomes--features, origin, and classification

scientific article published on 17 June 2009

Genea mexicana, sp. nov., and Geopora tolucana, sp. nov., new hypogeous Pyronemataceae from Mexico, and the taxonomy of Geopora reevaluated ⬇️

article

General functions to transform associate data to host data, and their use in phylogenetic inference from sequences with intra-individual variability

artículo científico publicado en 2008

Genome BLAST distance phylogenies inferred from whole plastid and whole mitochondrion genome sequences

artículo científico publicado en 2006

Genome Sequence of Gammaproteobacterial Pseudohaliea rubra Type Strain DSM 19751, Isolated from Coastal Seawater of the Mediterranean Sea.

artículo científico publicado en 2014

Genome analysis of the marine bacterium Kiloniella laminariae and first insights into comparative genomics with related Kiloniella species

scientific article published on 16 December 2019

Genome of the R-body producing marine alphaproteobacterium Labrenzia alexandrii type strain (DFL-11(T))

artículo científico publicado en 2013

Genome of the marine alphaproteobacterium Hoeflea phototrophica type strain (DFL-43(T)).

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence and emended description of Leisingera nanhaiensis strain DSM 24252(T) isolated from marine sediment

artículo científico publicado en 2014

Genome sequence of Frateuria aurantia type strain (Kondô 67(T)), a xanthomonade isolated from Lilium auratium Lindl

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of Phaeobacter caeruleus type strain (DSM 24564(T)), a surface-associated member of the marine Roseobacter clade

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of Phaeobacter daeponensis type strain (DSM 23529(T)), a facultatively anaerobic bacterium isolated from marine sediment, and emendation of Phaeobacter daeponensis

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of Phaeobacter inhibens type strain (T5(T)), a secondary metabolite producing representative of the marine Roseobacter clade, and emendation of the species description of Phaeobacter inhibens

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of Shimia str. SK013, a representative of the Roseobacter group isolated from marine sediment

artículo científico publicado en 2016

Genome sequence of the Antarctic rhodopsins-containing flavobacterium Gillisia limnaea type strain (R-8282(T)).

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the Leisingera aquimarina type strain (DSM 24565(T)), a member of the marine Roseobacter clade rich in extrachromosomal elements

scientific article published on 30 July 2013

Genome sequence of the Litoreibacter arenae type strain (DSM 19593(T)), a member of the Roseobacter clade isolated from sea sand

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of the Roseovarius mucosus type strain (DSM 17069(T)), a bacteriochlorophyll a-containing representative of the marine Roseobacter group isolated from the dinoflagellate Alexandrium ostenfeldii

artículo científico publicado en 2015

Genome sequence of the Thermotoga thermarum type strain (LA3(T)) from an African solfataric spring

artículo científico publicado en 2014

Genome sequence of the Wenxinia marina type strain (DSM 24838(T)), a representative of the Roseobacter group isolated from oilfield sediments

artículo científico publicado en 2014

Genome sequence of the chemoheterotrophic soil bacterium Saccharomonospora cyanea type strain (NA-134(T)).

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of the exopolysaccharide-producing Salipiger mucosus type strain (DSM 16094(T)), a moderately halophilic member of the Roseobacter clade

artículo científico publicado en 2014

Genome sequence of the filamentous, gliding Thiothrix nivea neotype strain (JP2(T))

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of the flexirubin-pigmented soil bacterium Niabella soli type strain (JS13-8(T))

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the free-living aerobic spirochete Turneriella parva type strain (H(T)), and emendation of the species Turneriella parva

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of the homoacetogenic bacterium Holophaga foetida type strain (TMBS4(T)).

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the moderately thermophilic halophile Flexistipes sinusarabici strain (MAS10)

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of the moderately thermophilic sulfur-reducing bacterium Thermanaerovibrio velox type strain (Z-9701(T)) and emended description of the genus Thermanaerovibrio

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of the moderately thermophilic, amino-acid-degrading and sulfur-reducing bacterium Thermovirga lienii type strain (Cas60314(T)).

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the mud-dwelling archaeon Methanoplanus limicola type strain (DSM 2279(T)), reclassification of Methanoplanus petrolearius as Methanolacinia petrolearia and emended descriptions of the genera Methanoplanus and Methanolacinia

artículo científico publicado en 2014

Genome sequence of the ocean sediment bacterium Saccharomonospora marina type strain (XMU15(T))

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the orange-pigmented seawater bacterium Owenweeksia hongkongensis type strain (UST20020801(T)).

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the phage-gene rich marine Phaeobacter arcticus type strain DSM 23566(T.).

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of the phylogenetically isolated spirochete Leptonema illini type strain (3055(T)).

scientific article published on 25 May 2013

Genome sequence of the pink to light reddish-pigmented Rubellimicrobium mesophilum type strain (DSM 19309(T)), a representative of the Roseobacter group isolated from soil, and emended description of the species

artículo científico publicado en 2014

Genome sequence of the pink-pigmented marine bacterium Loktanella hongkongensis type strain (UST950701-009P(T)), a representative of the Roseobacter group

artículo científico publicado en 2015

Genome sequence of the reddish-pigmented Rubellimicrobium thermophilum type strain (DSM 16684(T)), a member of the Roseobacter clade

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of the soil bacterium Saccharomonospora azurea type strain (NA-128(T)).

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the thermophilic fresh-water bacterium Spirochaeta caldaria type strain (H1(T)), reclassification of Spirochaeta caldaria, Spirochaeta stenostrepta, and Spirochaeta zuelzerae in the genus Treponema as Treponema caldaria comb. nov.

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence-based species delimitation with confidence intervals and improved distance functions

artículo científico publicado en 2013

Genome-Based Taxonomic Classification of Bacteroidetes

artículo científico publicado en 2016

Genome-Based Taxonomic Classification of the Phylum

article published in 2018

Genome-Based Taxonomic Classification of the Phylum Actinobacteria ⬇️

artículo científico

Genome-Scale Data Call for a Taxonomic Rearrangement of Geodermatophilaceae

artículo científico publicado en 2017

Genome-based classification of micromonosporae with a focus on their biotechnological and ecological potential

artículo científico publicado en 2018

Genome-guided analysis allows the identification of novel physiological traits in Trichococcus species

scientific article published on 08 January 2020

Genome-scale data suggest reclassifications in the Leisingera-Phaeobacter cluster including proposals for Sedimentitalea gen. nov. and Pseudophaeobacter gen. nov.

artículo científico publicado en 2014

Genomic Analysis of Caldithrix abyssi, the Thermophilic Anaerobic Bacterium of the Novel Bacterial Phylum Calditrichaeota

artículo científico publicado en 2017

Genomic and Genetic Diversity within the Pseudomonas fluorescens Complex

artículo científico publicado en 2016

Genomic encyclopedia of bacteria and archaea: sequencing a myriad of type strains

artículo científico publicado en 2014

Genomic insights into the taxonomic status of the Bacillus cereus group

artículo científico publicado en 2015

Genomics and physiology of a marine flavobacterium encoding a proteorhodopsin and a xanthorhodopsin-like protein

artículo científico publicado en 2013

Genomik: Grundlage zum Verständnis des Erfolgs von Roseobacter-Gruppe

Geodermatophilus africanus sp. nov., a halotolerant actinomycete isolated from Saharan desert sand

artículo científico publicado en 2013

Geodermatophilus arenarius sp. nov., a xerophilic actinomycete isolated from Saharan desert sand in Chad

artículo científico publicado en 2012

Geodermatophilus normandii sp. nov., isolated from Saharan desert sand

artículo científico publicado en 2013

Geodermatophilus poikilotrophi sp. nov.: a multitolerant actinomycete isolated from dolomitic marble

artículo científico publicado en 2014

Geodermatophilus saharensis sp. nov., isolated from sand of the Saharan desert in Chad.

artículo científico publicado en 2012

Geodermatophilus siccatus sp. nov., isolated from arid sand of the Saharan desert in Chad

artículo científico publicado en 2012

Geodermatophilus telluris sp. nov., an actinomycete isolated from Saharan desert sand

artículo científico publicado en 2012

Geodermatophilus tzadiensis sp. nov., a UV radiation-resistant bacterium isolated from sand of the Saharan desert

artículo científico publicado en 2013

Guidelines for interpreting the International Code of Nomenclature of Prokaryotes and for preparing a Request for an Opinion

scientific article published in 2023

Haloplasma

artículo científico publicado en 2019

Hidden diversity in the non‐caryophyllaceous plant‐parasitic members ofMicrobotryum(Pucciniomycotina: Microbotryales)

article

High quality draft genome of Nakamurella lactea type strain, a rock actinobacterium, and emended description of Nakamurella lactea

artículo científico publicado en 2017

High quality draft genome sequence and analysis of Pontibacter roseus type strain SRC-1(T) (DSM 17521(T)) isolated from muddy waters of a drainage system in Chandigarh, India

artículo científico publicado en 2015

High quality draft genome sequence of Flavobacterium rivuli type strain WB 3.3-2(T) (DSM 21788(T)), a valuable source of polysaccharide decomposing enzymes

artículo científico publicado en 2015

High quality draft genome sequences of Pseudomonas fulva DSM 17717(T), Pseudomonas parafulva DSM 17004(T) and Pseudomonas cremoricolorata DSM 17059(T) type strains

artículo científico publicado en 2016

High quality permanent draft genome sequence of Chryseobacterium bovis DSM 19482T, isolated from raw cow milk

artículo científico publicado en 2017

High quality permanent draft genome sequence of Phaseolibacter flectens ATCC 12775(T), a plant pathogen of French bean pods

artículo científico publicado en 2016

High-quality draft genome sequence of Flavobacterium suncheonense GH29-5(T) (DSM 17707(T)) isolated from greenhouse soil in South Korea, and emended description of Flavobacterium suncheonense GH29-5(T)

artículo científico publicado en 2016

High-quality draft genome sequence of Gracilimonas tropica CL-CB462(T) (DSM 19535(T)), isolated from a Synechococcus culture

artículo científico publicado en 2015

High-quality draft genome sequence of Sedimenticola selenatireducens strain AK4OH1T, a gammaproteobacterium isolated from estuarine sediment

artículo científico publicado en 2016

High-quality draft genome sequences of Pseudomonas monteilii DSM 14164T, Pseudomonas mosselii DSM 17497T, Pseudomonas plecoglossicida DSM 15088T, Pseudomonas taiwanensis DSM 21245T and Pseudomonas vranovensis DSM 16006T: taxonomic considerations

scientific article published on 29 October 2019

High-quality-draft genome sequence of the yellow-pigmented flavobacterium Joostella marina type strain (En5(T)).

artículo científico publicado en 2013

Highly parallelized inference of large genome-based phylogenies

scholarly article by Jan P Meier-Kolthoff et al published 7 August 2013 in Concurrency and Computation: Practice and Experience

Hoffmannoscypha, a novel genus of brightly coloured, cupulate Pyronemataceae closely related to Tricharina and Geopora

article by Benjamin Stielow et al published 13 December 2012 in Mycological Progress

Horizontal operon transfer, plasmids, and the evolution of photosynthesis in Rhodobacteraceae

scholarly article by Henner Brinkmann et al published August 2018 in The ISME Journal

How do obligate parasites evolve? A multi-gene phylogenetic analysis of downy mildews

artículo científico publicado en 2007

ICSP response to ‘Regulating access can restrict participation in reporting new species and taxa’

scientific article published in 2022

Impacts of pr-10a overexpression at the molecular and the phenotypic level

artículo científico publicado en 2013

Implications of molecular characters for the phylogeny of the Microbotryaceae (Basidiomycota: Urediniomycetes)

artículo científico publicado en 2006

Improving Phylogeny Reconstruction at the Strain Level Using Peptidome Datasets

artículo científico publicado en 2016

Intraspecific Relationship of Plasmopara halstedii Isolates Differing in Pathogenicity and Geographic Origin Based on ITS Sequence Data

article

Judicial Opinion 128

scientific article published in 2023

Judicial Opinions 112–122 ⬇️

artículo científico publicado en 2022

Kribbella shirazensis sp. nov., isolated from Iranian soil

artículo científico publicado en 2013

Large-Scale Co-Phylogenetic Analysis on the Grid

scholarly article published January 2009

Large-Scale Co-Phylogenetic Analysis on the Grid

scholarly article

List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ

scientific article published on 23 July 2020

Maximum Likelihood Analyses of 3,490 rbcL Sequences: Scalability of Comprehensive Inference versus Group-Specific Taxon Sampling

artículo científico publicado en 2010

Metabolic traits of an uncultured archaeal lineage--MSBL1--from brine pools of the Red Sea.

artículo científico publicado en 2016

Molecular Phylogenetic Reconstruction

scholarly article published 2011

Molecular and phenotypic analyses reveal the non-identity of the Phaeobacter gallaeciensis type strain deposits CIP 105210T and DSM 17395.

artículo científico publicado en 2013

Molecular taxonomy of phytopathogenic fungi: a case study in Peronospora

artículo científico publicado en 2009

Morphology and phylogeny of Hyaloperonospora erophilae and H. praecox sp. nov., two downy mildew species co-occurring on Draba verna sensu lato

article

Nocardiopsis arvandica sp. nov., isolated from sandy soil

artículo científico publicado en 2010

Nocardiopsis mwathae sp. nov., isolated from the haloalkaline Lake Elmenteita in the African Rift Valley

artículo científico publicado en 2016

Non-contiguous finished genome sequence and contextual data of the filamentous soil bacterium Ktedonobacter racemifer type strain (SOSP1-21).

artículo científico publicado en 2011

Non-contiguous finished genome sequence of Aminomonas paucivorans type strain (GLU-3).

artículo científico publicado en 2010

Non-contiguous finished genome sequence of Bacteroides coprosuis type strain (PC139). ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Non-contiguous finished genome sequence of the opportunistic oral pathogen Prevotella multisaccharivorax type strain (PPPA20).

artículo científico publicado en 2011

Notification of changes in taxonomic opinion previously published outside the IJSEM. List of Changes in Taxonomic Opinion no. 39

artículo científico publicado en 2024

Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 73, part 10 of the IJSEM

artículo científico publicado en 2024

Novel genera and species of coniothyrium-like fungi in Montagnulaceae (Ascomycota). ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Novel insights into the diversity of catabolic metabolism from ten haloarchaeal genomes

artículo científico publicado en 2011

Ocean's Twelve: flagellar and biofilm chromids in the multipartite genome of Marinovum algicola DG898 exemplify functional compartmentalization

artículo científico publicado en 2015

Pathways and substrate-specific regulation of amino acid degradation in Phaeobacter inhibens DSM 17395 (archetype of the marine Roseobacter clade).

artículo científico publicado en 2013

Permanent draft genome sequence of Dethiosulfovibrio peptidovorans type strain (SEBR 4207)

artículo científico publicado en 2010

Permanent draft genome sequence of the gliding predator Saprospira grandis strain Sa g1 (= HR1).

artículo científico publicado en 2012

Phylogenetic classification of yeasts and related taxa within Pucciniomycotina

artículo científico publicado en 2015

Phylogenetic relationships of Plasmopara, Bremia and other genera of downy mildew pathogens with pyriform haustoria based on Bayesian analysis of partial LSU rDNA sequence data

artículo científico publicado en 2004

Phylogenetic relationships of graminicolous downy mildews based on cox2 sequence data.

artículo científico publicado en 2007

Phylogenomics of Rhodobacteraceae reveals evolutionary adaptation to marine and non-marine habitats

artículo científico publicado en 2017

Phylogeny of Hyaloperonospora based on nuclear ribosomal internal transcribed spacer sequences

artículo científico publicado en 2004

Phylogeny of Peronospora, parasitic on Fabaceae, based on ITS sequences

scholarly article by Gema García-Blázquez et al published May 2008 in Mycological Research

Phylogeny-driven target selection for large-scale genome-sequencing (and other) projects

artículo científico publicado en 2013

Proposal of a type strain for Frankia alni (Woronin 1866) Von Tubeuf 1895, emended description of Frankia alni, and recognition of Frankia casuarinae sp. nov. and Frankia elaeagni sp. nov.

artículo científico publicado en 2016

Proposals to emend Rules 8, 15, 22, 25a, 30(3)(b), 30(4), 34a, and Appendix 7 of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes ⬇️

artículo científico publicado en 2022

Quantifying the phylodynamic forces driving papillomavirus evolution

artículo científico publicado en 2011

Relicts Within the Genus Complex Astragalus/Oxytropis (Fabaceae), and the Comparison of Diversity by Objective Means

Shotgun metagenome data of a defined mock community using Oxford Nanopore, PacBio and Illumina technologies

artículo científico publicado en 2019

Species delimitation in downy mildews: the case of Hyaloperonospora in the light of nuclear ribosomal ITS and LSU sequences

artículo científico publicado en 2009

Species delimitation in taxonomically difficult fungi: the case of Hymenogaster

artículo científico publicado en 2011

Standard operating procedure for calculating genome-to-genome distances based on high-scoring segment pairs

artículo científico publicado en 2010

Status of the SeqCode in the International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology ⬇️

artículo científico publicado en 2022

Streptomyces alkaliphilus sp. nov., isolated from sediments of Lake Elmenteita in the Kenyan Rift Valley

artículo científico publicado en 2015

TYGS and LPSN: a database tandem for fast and reliable genome-based classification and nomenclature of prokaryotes

artículo científico publicado en 2022

TYGS is an automated high-throughput platform for state-of-the-art genome-based taxonomy

Taxonomic use of DNA G+C content and DNA-DNA hybridization in the genomic age.

artículo científico publicado en 2014

The Composite 259-kb Plasmid of Martelella mediterranea DSM 17316T-A Natural Replicon with Functional RepABC Modules from Rhodobacteraceae and Rhizobiaceae

artículo científico publicado en 2017

The Evolution of Ecological Diversity in Acidobacteria

artículo científico publicado en 2022

The Families Erysipelotrichaceae emend., Coprobacillaceae fam. nov., and Turicibacteraceae fam. nov

artículo científico publicado en 2014

The Family Intrasporangiaceae

The genome sequence of Methanohalophilus mahii SLP(T) reveals differences in the energy metabolism among members of the Methanosarcinaceae inhabiting freshwater and saline environments

artículo científico publicado en 2010

The neglected hypogeous fungus Hydnotrya bailii Soehner (1959) is a widespread sister taxon of Hydnotrya tulasnei (Berk.) Berk. & Broome (1846)

artículo científico publicado en 2009

Toward a Novel Multilocus Phylogenetic Taxonomy for the Dermatophytes

artículo científico publicado en 2017

Towards an integrated phylogenetic classification of the Tremellomycetes

artículo científico publicado en 2015

Using the Multiple Analysis Approach to Reconstruct Phylogenetic Relationships among Planktonic Foraminifera from Highly Divergent and Length-polymorphic SSU rDNA Sequences

artículo científico publicado en 2009

VICTOR: genome-based phylogeny and classification of prokaryotic viruses

artículo científico publicado en 2017

Valid publication of names of two domains and seven kingdoms of prokaryotes

artículo científico publicado en 2024

Validation List no. 213. Valid publication of new names and new combinations effectively published outside the IJSEM

artículo científico publicado en 2023

Validation List no. 214. Valid publication of new names and new combinations effectively published outside the IJSEM

artículo científico publicado en 2023

Validation List no. 215. Valid publication of new names and new combinations effectively published outside the IJSEM

artículo científico publicado en 2024

Validation List no. 216. Valid publication of new names and new combinations effectively published outside the IJSEM

artículo científico publicado en 2024

Validation List no. 218. Valid publication of new names and new combinations effectively published outside the IJSEM

artículo científico publicado en 2024

Visualization and curve-parameter estimation strategies for efficient exploration of phenotype microarray kinetics

artículo científico publicado en 2012

When should a DDH experiment be mandatory in microbial taxonomy?

artículo científico publicado en 2013

opm: an R package for analysing OmniLog(R) phenotype microarray data

artículo científico publicado en 2013

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