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Lista de obras de Andrés Moya

A Sliding Window-Based Method to Detect Selective Constraints in Protein-Coding Genes and Its Application to RNA Viruses

article

A genetic background with low mutational robustness is associated with increased adaptability to a novel host in an RNA virus

artículo científico publicado en 2009

A membrane computing simulator of trans-hierarchical antibiotic resistance evolution dynamics in nested ecological compartments (ARES).

artículo científico publicado en 2015

A new subtype of hepatitis C virus genotype 1: complete genome and phylogenetic relationships of an Equatorial Guinea isolate.

artículo científico publicado en 2006

A novel intracellular mutualistic bacterium in the invasive ant Cardiocondyla obscurior ⬇️

artículo científico publicado en 2015

A small microbial genome: the end of a long symbiotic relationship?

artículo científico publicado en 2006

Abundance and distribution of the highly iterated palindrome 1 (HIP1) among prokaryotes

artículo científico publicado en 2011

Active and Secretory IgA-Coated Bacterial Fractions Elucidate Dysbiosis in Clostridium difficile Infection

artículo científico publicado en 2016

Active and secreted IgA-coated bacterial fractions from the human gut reveal an under-represented microbiota core

artículo científico publicado en 2013

Adaptive evolution in GroEL from distantly related endosymbiotic bacteria of insects.

artículo científico publicado en 2005

Aequorin-expressing yeast emits light under electric control

artículo científico publicado en 2011

Aggregated Distribution as an Explanation for the Paradox of Plankton and Collective Animal Behavior

artículo científico publicado en 2022

Altered metabolism of gut microbiota contributes to chronic immune activation in HIV-infected individuals.

artículo científico publicado en 2014

An in-depth study of HD 174966 with CoRoT photometry and HARPS spectroscopy

scientific article published in Astronomy and Astrophysics

Analysis of and function predictions for previously conserved hypothetical or putative proteins in Blochmannia floridanus

artículo científico publicado en 2006

Analysis of the overdispersed clock in the short-term evolution of hepatitis C virus: Using the E1/E2 gene sequences to infer infection dates in a single source outbreak

artículo científico publicado en 2006

Antibiotic use and microbiome function

artículo científico publicado en 2016

Assessing gut microbial diversity from feces and rectal mucosa

artículo científico publicado en 2010

Assessing the nucleotide diversity of three aphid species by RAPD

article

Assortative mating and fertility in two Drosophila subobscura strains with different mitochondrial DNA haplotypes.

artículo científico publicado en 2003

Author Correction: On the thermodynamic origin of metabolic scaling

artículo científico publicado en 2018

Bacterial endosymbionts of insects: insights from comparative genomics

artículo científico publicado en 2004

Bayesian Hierarchical Compositional Models for Analysing Longitudinal Abundance Data from Microbiome Studies

artículo científico publicado en 2022

Bioinformatic flowchart and database to investigate the origins and diversity of clan AA peptidases

scientific article published on 27 January 2009

Blattabacteria, the endosymbionts of cockroaches, have small genome sizes and high genome copy numbers.

artículo científico publicado en 2008

Blueprint for a minimal photoautotrophic cell: conserved and variable genes in Synechococcus elongatus PCC 7942.

artículo científico publicado en 2011

Bronchial microbiome of severe COPD patients colonised by Pseudomonas aeruginosa

artículo científico publicado en 2014

Bronchial microbiome, PA biofilm-forming capacity and exacerbation in severe COPD patients colonized by P. aeruginosa

artículo científico publicado en 2017

CROC: finding chromosomal clusters in eukaryotic genomes

artículo científico publicado en 2009

Carriage of Enterobacteria Producing Extended-Spectrum β-Lactamases and Composition of the Gut Microbiota in an Amerindian Community

artículo científico publicado en 2015

Characterization and control of microbial black spot spoilage in dry-cured Iberian ham

Chromosomal stasis versus plasmid plasticity in aphid endosymbiont Buchnera aphidicola.

artículo científico publicado en 2005

Clonal interference and the evolution of RNA viruses.

artículo científico publicado en 1999

Clostridium difficile heterogeneously impacts intestinal community architecture but drives stable metabolome responses

artículo científico publicado en 2015

Coexistence of Wolbachia with Buchnera aphidicola and a secondary symbiont in the aphid Cinara cedri

artículo científico publicado en 2004

Colonization Resistance of the Gut Microbiota against Clostridium difficile

artículo científico publicado en 2015

Combined therapy of interferon plus ribavirin promotes multiple adaptive solutions in hepatitis C virus.

artículo científico publicado en 2009

Comparative Mitogenomics of Leeches (Annelida: Clitellata): Genome Conservation and Placobdella-Specific trnD Gene Duplication

artículo científico publicado en 2016

Comparative analysis of two genomic regions among four strains of Buchnera aphidicola, primary endosymbiont of aphids

artículo científico publicado en 2004

Comparative genomics of Blattabacterium cuenoti: the frozen legacy of an ancient endosymbiont genome

artículo científico publicado en 2013

Comparative genomics of Serratia spp.: two paths towards endosymbiotic life.

artículo científico publicado en 2012

Comparative molecular evolution of primary (Buchnera) and secondary symbionts of aphids based on two protein-coding genes.

artículo científico publicado en 2002

Comparison of different assembly and annotation tools on analysis of simulated viral metagenomic communities in the gut.

artículo científico publicado en 2014

Comparison of vaccine strains and the virus causing the 1986 foot-and-mouth disease outbreak in Spain: epizootiological analysis

artículo científico publicado en 1990

Complete genome sequence of "Candidatus Portiera aleyrodidarum" BT-QVLC, an obligate symbiont that supplies amino acids and carotenoids to Bemisia tabaci

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of "Candidatus Tremblaya princeps" strain PCVAL, an intriguing translational machine below the living-cell status

artículo científico

Complete genome sequence of Acidaminococcus intestini RYC-MR95, a Gram-negative bacterium from the phylum Firmicutes.

artículo científico publicado en 2011

Contribution of insertions and deletions to the variability of hepatitis C virus populations.

artículo científico publicado en 2007

DNA barcodes reveal the presence of the introduced freshwater leech Helobdella europaea in Spain

artículo científico publicado en 2013

Daily follow-up of bacterial communities in the human gut reveals stable composition and host-specific patterns of interaction

artículo científico publicado en 2012

Detecting Changes in the Functional Constraints of Paralogous Genes

article

Detection of mixed-strain infections by FACS and ultra-low input genome sequencing

article

Determination of the core of a minimal bacterial gene set

artículo científico publicado en 2004

Diet shapes the gut microbiota of the omnivorous cockroach Blattella germanica

artículo científico publicado en 2015

Different mechanisms generating sequence variability are revealed in distinct regions of the hydroxyproline-rich glycoprotein gene from maize and related species

artículo científico publicado en 1992

Differential effects of antibiotic therapy on the structure and function of human gut microbiota

artículo científico publicado en 2013

Diminishing returns of population size in the rate of RNA virus adaptation

artículo científico publicado en 2000

Direct sequencing of human gut virome fractions obtained by flow cytometry

artículo científico publicado en 2015

Direct squencing from the minimal number of DNA molecules needed to fill a 454 picotiterplate

artículo científico publicado en 2014

ECA, a Python tool to study the evolution of life

artículo científico publicado en 2024

EVOLUTIONARY DYNAMICS OF FITNESS RECOVERY FROM THE DEBILITATING EFFECTS OF MULLER'S RATCHET.

artículo científico publicado en 1998

Early progress in aphid genomics and consequences for plant-aphid interactions studies

artículo científico publicado en 2008

Effect of Ribavirin on the Mutation Rate and Spectrum of Hepatitis C Virus In Vivo

artículo científico publicado en 2009

Effect of a Nutritional Intervention on the Intestinal Microbiota of Vertically HIV-Infected Children: The Pediabiota Study

scientific article published on 16 July 2020

Effect of antiviral treatment and host susceptibility on positive selection in hepatitis C virus (HCV).

artículo científico publicado en 2007

Effect of daily intake of pomegranate juice on fecal microbiota and feces metabolites from healthy volunteers.

artículo científico publicado en 2015

Effect of oligonucleotide primers in determining viral variability within hosts

artículo científico publicado en 2004

Effect of population patchiness and migration rates on the adaptation and divergence of vesicular stomatitis virus quasispecies populations.

artículo científico publicado en 1999

Effects of HIV, ART and prebiotics on the active fraction of the gut microbiota.

artículo científico publicado en 2018

Effects of Immunonutrition in Advanced HIV Disease: a Randomized Placebo Controlled Clinical Trial (Promaltia Study).

artículo científico publicado en 2018

Elevated circulating levels of succinate in human obesity are linked to specific gut microbiota.

artículo científico publicado en 2018

Endosymbiotic bacteria: groEL buffers against deleterious mutations

artículo científico publicado en 2002

Enhanced adaptation of vesicular stomatitis virus in cells infected with vaccinia virus

artículo científico publicado en 2008

EnvDB, a database for describing the environmental distribution of prokaryotic taxa.

artículo científico publicado en 2009

Environmental distribution of prokaryotic taxa

artículo científico publicado en 2010

Epidemic dynamics of two coexisting hepatitis C virus subtypes

artículo científico publicado en 2007

Epistasis and the adaptability of an RNA virus

artículo científico publicado en 2005

Estimating the extent of horizontal gene transfer in metagenomic sequences

artículo científico publicado en 2008

Evaluating the fidelity of de novo short read metagenomic assembly using simulated data

artículo científico publicado en 2011

Evidence for Succession and Putative Metabolic Roles of Fungi and Bacteria in the Farming Mutualism of the Ambrosia Beetle Xyleborus affinis

scientific article published on 15 September 2020

Evidence of Recombination in Intrapatient Populations of Hepatitis C Virus

artículo científico publicado en 2008

Evidence of the Red-Queen Hypothesis from Accelerated Rates of Evolution of Genes Involved in Biotic Interactions in Pneumocystis.

artículo científico publicado en 2018

Evolution of Prokaryote-Animal Symbiosis from a Genomics Perspective

Evolution of RNA virus in spatially structured heterogeneous environments

artículo científico publicado en 2003

Evolution of mitochondrial DNA in Drosophila subobscura.

artículo científico publicado en 1986

Evolution of reduced prokaryotic genomes and the minimal cell concept: variations on a theme

artículo científico publicado en 2010

Evolution of small prokaryotic genomes

artículo científico publicado en 2014

Evolution of the leucine gene cluster in Buchnera aphidicola: insights from chromosomal versions of the cluster

artículo científico publicado en 2004

Evolution of the secondary symbiont "Candidatus serratia symbiotica" in aphid species of the subfamily lachninae

artículo científico publicado en 2008

Evolutionary analysis of genetic variation observed in citrus tristeza virus (CTV) after host passage.

artículo científico publicado en 2005

Evolutionary convergence and nitrogen metabolism in Blattabacterium strain Bge, primary endosymbiont of the cockroach Blattella germanica

artículo científico publicado en 2009

Evolutionary trajectories of beta-lactamase CTX-M-1 cluster enzymes: predicting antibiotic resistance

artículo científico publicado en 2010

Experimental Epidemiology of Antibiotic Resistance: Looking for an Appropriate Animal Model System.

artículo científico publicado en 2018

Exploring the human microbiome from multiple perspectives: factors altering its composition and function.

artículo científico publicado en 2017

Exponential increases of RNA virus fitness during large population transmissions

artículo científico publicado en 1995

Extreme genome reduction in Buchnera spp.: toward the minimal genome needed for symbiotic life

artículo científico publicado en 2002

FREQUENCY-DEPENDENT SELECTION IN A MAMMALIAN RNA VIRUS.

artículo científico publicado en 1997

Fertility and viability at the Sod locus in Drosophila melanogaster: non-additive and asymmetric selection

artículo científico publicado en 1991

Filosofía, ciencia y biología sintética

Fitness and life-history traits of the two major mitochondrial DNA haplotypes of Drosophila subobscura

artículo científico publicado en 2004

Fixation of mutations at the VP1 gene of foot-and-mouth disease virus. Can quasispecies define a transient molecular clock?

artículo científico publicado en 1991

Following the very initial growth of biological RNA viral clones.

artículo científico publicado en 2005

Founder-effect speciation theory: failure of experimental corroboration

artículo científico publicado en 1995

Fragmentation and Coverage Variation in Viral Metagenome Assemblies, and Their Effect in Diversity Calculations

artículo científico publicado en 2015

Frequency-dependent selection in human immunodeficiency virus type 1.

artículo científico publicado en 2002

From phylogenetics to phylogenomics: the evolutionary relationships of insect endosymbiotic gamma-Proteobacteria as a test case.

artículo científico publicado en 2007

Functional Metagenomics of the Bronchial Microbiome in COPD.

artículo científico publicado en 2015

Functional Redundancy-Induced Stability of Gut Microbiota Subjected to Disturbance

artículo científico publicado en 2016

Functional consequences of microbial shifts in the human gastrointestinal tract linked to antibiotic treatment and obesity

artículo científico publicado en 2013

Functional microbiome deficits associated with ageing: Chronological age threshold

artículo científico publicado en 2019

Gene expression levels influence amino acid usage and evolutionary rates in endosymbiotic bacteria

artículo científico publicado en 2005

Generalized Linear Model (GLM) framework for the association of host variables and viral strains with liver fibrosis in HCV/HIV coinfected patients.

artículo científico publicado en 2012

Genetic Variability of Hepatitis C Virus before and after Combined Therapy of Interferon plus Ribavirin

artículo científico publicado en 2008

Genetic characterization of influenza viruses from influenza-related hospital admissions in the St. Petersburg and Valencia sites of the Global Influenza Hospital Surveillance Network during the 2013/14 influenza season

artículo científico publicado en 2016

Genetic differentiation in the striped dolphin Stenella coeruleoalba from European waters according to mitochondrial DNA (mtDNA) restriction analysis

scientific article published on 01 June 1999

Genetic diversity of Iberian populations of Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae) based on random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction.

artículo científico publicado en 2001

Genetic lesions associated with Muller's ratchet in an RNA virus.

artículo científico publicado en 1996

Genetic similarity of hepatitis C virus and fibrosis progression in chronic and recurrent infection after liver transplantation.

artículo científico publicado en 2006

Genetic variability in hepatitis C virus and its role in antiviral treatment response.

artículo científico publicado en 2008

Genome Sequence of Lactobacillus plantarum 19L3, a Strain Proposed as a Starter Culture for Slovenska Bryndza Ovine Cheese.

artículo científico publicado en 2014

Genome degeneration and adaptation in a nascent stage of symbiosis

artículo científico publicado en 2014

Genome economization in the endosymbiont of the wood roach Cryptocercus punctulatus due to drastic loss of amino acid synthesis capabilities

artículo científico publicado en 2011

Genome evolution in the primary endosymbiont of whiteflies sheds light on their divergence

artículo científico publicado en 2015

Genome rearrangement distances and gene order phylogeny in gamma-Proteobacteria

artículo científico publicado en 2005

Genome reduction and potential metabolic complementation of the dual endosymbionts in the whitefly Bemisia tabaci

artículo científico publicado en 2015

Genome sequence of Lactococcus garvieae UNIUD074, isolated in Italy from a lactococcosis outbreak.

artículo científico publicado en 2011

Genome size reduction through multiple events of gene disintegration in Buchnera APS.

artículo científico publicado en 2001

Genomic Signature in Evolutionary Biology: A Review

artículo científico publicado en 2023

Genomic determinants of protein folding thermodynamics in prokaryotic organisms.

artículo científico publicado en 2004

Genomics of intracellular symbionts in insects.

artículo científico publicado en 2010

Geographic distribution and seasonal variation of mitochondrial DNA haplotypes in the aphid Rhopalosiphum padi (Hemiptera: Aphididae)

Goethe's dream. Challenges and opportunities for synthetic biology

artículo científico publicado en 2009

GroEL and the maintenance of bacterial endosymbiosis

artículo científico publicado en 2004

Gut Bacteria Metabolism Impacts Immune Recovery in HIV-infected Individuals

artículo científico publicado en 2016

Gut Microbiota Is Not Essential for Survival and Development in Blattella germanica, but Affects Uric Acid Storage

artículo científico publicado en 2024

Gut microbiota disturbance during antibiotic therapy: a multi-omic approach

artículo científico publicado en 2013

Gut microbiota disturbance during antibiotic therapy: a multi-omic approach

Gut microbiota in children vaccinated with rotavirus vaccine

artículo científico publicado en 2012

GyDB mobilomics: LTR retroelements and integrase-related transposons of the pea aphid Acyrthosiphon pisum genome.

artículo científico publicado en 2011

HD 172189, a Cluster Member Binary System with a δ Scuti Component in the Field of View of COROT

HD 173977: An ellipsoidal δ Scuti star variable

scientific article published in Astronomy and Astrophysics

HIV infection results in metabolic alterations in the gut microbiota different from those induced by other diseases

artículo científico publicado en 2016

HIV, HPV, and microbiota: partners in crime?

artículo científico publicado en 2016

Harassment charges: Injustice done?:

artículo científico publicado en 2018

Health and Disease Imprinted in the Time Variability of the Human Microbiome

artículo científico publicado en 2017

Hepatitis C virus and the controversial role of the interferon sensitivity determining region in the response to interferon treatment.

artículo científico publicado en 2008

High diversity of the viral community from an Antarctic lake

artículo científico publicado en 2009

High genetic stability in natural populations of the plant RNA virus tobacco mild green mosaic virus

article

How does Tremblaya princeps get essential proteins from its nested partner Moranella endobia in the Mealybug Planoccocus citri?

artículo científico publicado en 2013

Hybrid sequencing approach applied to human fecal metagenomic clone libraries revealed clones with potential biotechnological applications

artículo científico publicado en 2012

Identification of Xenologs and Their Characteristic Low Expression Levels in the Cyanobacterium Synechococcus elongatus.

artículo científico publicado en 2015

Identification of a gene overexpressed in aphids reared under short photoperiod

artículo científico publicado en 2003

Identification of the weevil immune genes and their expression in the bacteriome tissue

artículo científico publicado en 2008

Immunity and other defenses in pea aphids, Acyrthosiphon pisum ⬇️

artículo científico publicado en 2010

Impact of Rearing Conditions on the Ambrosia Beetle's Microbiome

artículo científico publicado en 2018

Impact of probiotic Saccharomyces boulardii on the gut microbiome composition in HIV-treated patients: A double-blind, randomised, placebo-controlled trial

artículo científico publicado en 2017

Instability of the faecal microbiota in diarrhoea-predominant irritable bowel syndrome

artículo científico publicado en 2013

Intelligibility in microbial complex systems: Wittgenstein and the score of life

artículo científico publicado en 2012

Interplay between gut microbiota metabolism and inflammation in HIV infection

article

Intra- and intergenotypic competition in Drosophila melanogaster: effects of density on larval survival and rate of development

article

Irradiation-resistance conferred by superoxide dismutase: possible adaptive role of a natural polymorphism in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 1986

Is group selection a factor modulating the virulence of RNA viruses?

artículo científico publicado en 1997

Is the quasispecies concept relevant to RNA viruses?

artículo científico publicado en 2002

Isolation in small populations of Wayampi Amerindians promotes endemicity and homogenization of their faecal virome, but its distribution is not entirely random

artículo científico publicado en 2017

JANE: efficient mapping of prokaryotic ESTs and variable length sequence reads on related template genomes

artículo científico publicado en 2009

Larval Competition in Drosophila melanogaster: The Model of the Bands of Density

article

Larval competition in Drosophila melanogaster: effects on development time.

artículo científico publicado en 1990

Larval competition in Drosophila melanogaster: frequency-dependence of viability

article

Larval stop, delayed development and survival in overcrowded cultures of Drosophila melanogaster: Effect of urea and uric acid

article

Learning how to live together: genomic insights into prokaryote-animal symbioses

artículo científico publicado en 2008

Legionella pneumophila pangenome reveals strain-specific virulence factors.

artículo científico publicado en 2010

Lessons in Evolution from Genome Reduction in Endosymbionts

Linkage disequilibria between mtDNA haplotypes and chromosomal arrangements in a natural population of Drosophila subobscura

artículo científico publicado en 2002

Live genomics for pathogen monitoring in public health.

artículo científico publicado en 2014

Mealybugs nested endosymbiosis: going into the 'matryoshka' system in Planococcus citri in depth

artículo científico publicado en 2013

Meconium microbiota types dominated by lactic acid or enteric bacteria are differentially associated with maternal eczema and respiratory problems in infants

artículo científico publicado en 2013

Metabolic networks of Sodalis glossinidius: a systems biology approach to reductive evolution

artículo científico publicado en 2012

Metabolic stasis in an ancient symbiosis: genome-scale metabolic networks from two Blattabacterium cuenoti strains, primary endosymbionts of cockroaches

artículo científico publicado en 2012

Metagenomic Analysis of Crohn's Disease Patients Identifies Changes in the Virome and Microbiome Related to Disease Status and Therapy, and Detects Potential Interactions and Biomarkers

artículo científico publicado en 2015

Metagenomics of human microbiome: beyond 16s rDNA.

artículo científico publicado en 2012

Metagenomics reveals our incomplete knowledge of global diversity

artículo científico publicado en 2008

Metatranscriptomic approach to analyze the functional human gut microbiota

artículo científico publicado en 2011

Microbial diversity in the midguts of field and lab-reared populations of the European corn borer Ostrinia nubilalis

artículo científico publicado en 2011

Microbiome diversity in the bronchial tracts of patients with chronic obstructive pulmonary disease

artículo científico publicado en 2012

Microbiota of sliced cooked ham packaged in modified atmosphere throughout the shelf life

artículo científico publicado en 2018

Minimal Genomes and Reducible Complexity

Mining metagenomic whole genome sequences revealed subdominant but constantLactobacilluspopulation in the human gut microbiota

Mining virulence genes using metagenomics

artículo científico publicado en 2011

Mitochondrial DNA Divergence Suggests That Podarcis hispanica atrata (Squamata: Lacertidae) from the Columbretes Islands Merits Specific Distinction

Mitochondrial DNA effects on fitness in Drosophila subobscura

artículo científico publicado en 2011

Mitochondrial DNA evolution in experimental populations of Drosophila subobscura

artículo científico publicado en 1990

Mitochondrial DNA variability in three Mediterranean populations of Aphanius iberus

Mitochondrial Dna Variation in Rhopalosiphum padi (Homoptera: Aphididae) Populations from four Spanish Localities

article

Mobile genetic element proliferation and gene inactivation impact over the genome structure and metabolic capabilities of Sodalis glossinidius, the secondary endosymbiont of tsetse flies

artículo científico publicado en 2010

Mode of selection and experimental evolution of antiviral drugs resistance in vesicular stomatitis virus

artículo científico publicado en 2005

Modular organization in the reductive evolution of protein-protein interaction networks

artículo científico publicado en 2007

Modulation of Saliva Microbiota through Prebiotic Intervention in HIV-Infected Individuals

artículo científico publicado en 2019

Molecular characterization and cytonuclear disequilibria of two Drosophila subobscura mitochondrial haplotypes.

artículo científico publicado en 1993

Molecular characterization of cyclic and obligate parthenogens in the aphid Rhopalosiphum padi (L.).

artículo científico publicado en 1996

Molecular diversity and evolutionary processes of Alternaria solani in Brazil inferred using genealogical and coalescent approaches

artículo científico publicado en 2009

Molecular epidemiology and evolution in an outbreak of fulminant hepatitis B virus.

artículo científico publicado en 2006

Molecular epidemiology and forensic genetics: application to a hepatitis C virus transmission event at a hemodialysis unit.

artículo científico publicado en 2003

Molecular epidemiology of a hepatitis C virus outbreak in a hemodialysis unit

artículo científico publicado en 2005

Molecular evidence for ongoing complementarity and horizontal gene transfer in endosymbiotic systems of mealybugs

artículo científico publicado en 2014

Molecular evolution in court: analysis of a large hepatitis C virus outbreak from an evolving source

artículo científico publicado en 2013

Molecular systematics of aphids (Homoptera: Aphididae): new insights from the long-wavelength opsin gene

artículo científico publicado en 2004

Molecular systematics of aphids and their primary endosymbionts

artículo científico publicado en 2001

Multiple infection dynamics has pronounced effects on the fitness of RNA viruses

article

Mutational and selective pressures on codon and amino acid usage in Buchnera, endosymbiotic bacteria of aphids.

artículo científico publicado en 2003

Mutational events in cefotaximase extended-spectrum beta-lactamases of the CTX-M-1 cluster involved in ceftazidime resistance.

artículo científico publicado en 2008

Natural populations of Trypanosoma cruzi, the agent of Chagas disease, have a complex multiclonal structure.

artículo científico publicado en 1986

Natural selection and the organ-specific differentiation of HIV-1 V3 hypervariable region

artículo científico publicado en 2004

Naturally-occurring hepatitis C virus protease variants: implications for resistance to new antivirals

Network dynamics of eukaryotic LTR retroelements beyond phylogenetic trees

artículo científico publicado en 2009

New Insights on the Evolutionary History of Aphids and Their Primary Endosymbiont Buchnera aphidicola

artículo científico publicado en 2011

New clues about the evolutionary history of metabolic losses in bacterial endosymbionts, provided by the genome of Buchnera aphidicola from the aphid Cinara tujafilina

artículo científico publicado en 2011

No exception to the rule: Candidatus Portiera aleyrodidarum cell wall revisited.

artículo científico publicado en 2014

Non-adiabatic theoretical observables inδScuti stars

artículo científico publicado en 2004

Nucleotide diversity of a ND5 fragment confirms that population expansion is the most suitable explanation for the mtDNA haplotype polymorphism of Drosophila subobscura.

artículo científico publicado en 2010

Obsolescence and intervention: on synthetic-biological entities

artículo científico publicado en 2014

On the thermodynamic origin of metabolic scaling.

artículo científico publicado en 2018

On the transposon origins of mammalian SCAND3 and KRBA2, two zinc-finger genes carrying an integrase/transposase domain

artículo científico publicado en 2012

Overcompensation as a mechanism for maintaining polymorphism: egg-to-adult viability in Drosophila

artículo científico publicado en 1990

Paving the way for synthetic biology‐based bioremediation in Europe ⬇️

artículo científico publicado el 29 de diciembre de 2009

Pear Blister Canker Viroid is a Member of the Apple Scar Skin Subgroup (apscaviroids) and also has Sequence Homology with Viroids from other Subgroups

article by C. Hernandez et al published 1 October 1992 in Journal of General Virology

Phylogenetic analysis of the isopenicillin-N-synthetase horizontal gene transfer

artículo científico publicado en 1996

Phylogenetic signal and functional categories in Proteobacteria genomes

artículo científico publicado en 2007

Phylogenomic Evidence for the Presence of a Flagellum and cbb3 Oxidase in the Free-Living Mitochondrial Ancestor

artículo científico publicado en 2011

Phylogeny of viroids, viroidlike satellite RNAs, and the viroidlike domain of hepatitis delta virus RNA

artículo científico publicado en 1991

Plasmid conjugation from proteobacteria as evidence for the origin of xenologous genes in cyanobacteria.

artículo científico publicado en 2014

Population dynamics of the 2 major mitochondrial DNA haplotypes in experimental populations of Drosophila subobscura.

artículo científico publicado en 2005

Postsymbiotic plasmid acquisition and evolution of the repA1-replicon in Buchnera aphidicola.

artículo científico publicado en 2000

Presence of Blastocystis in gut microbiota is associated with cognitive traits and decreased executive function

artículo científico publicado en 2022

Protective effect of Bifidobacterium pseudocatenulatum CECT7765 against induced bacterial antigen translocation in experimental cirrhosis.

artículo científico publicado en 2013

Putative evolutionary origin of plasmids carrying the genes involved in leucine biosynthesis in Buchnera aphidicola (endosymbiont of aphids).

artículo científico publicado en 1997

Ranking the impact of human health disorders on gut metabolism: systemic lupus erythematosus and obesity as study cases

artículo científico publicado en 2015

Rapid acclimation of juvenile corals to CO2 -mediated acidification by upregulation of heat shock protein and Bcl-2 genes.

artículo científico publicado en 2015

Rapid fitness losses in mammalian RNA virus clones due to Muller's ratchet

artículo científico publicado en 1992

Reductive genome evolution in Buchnera aphidicola

artículo científico publicado en 2003

Refined analysis of genetic variability parameters in hepatitis C virus and the ability to predict antiviral treatment response.

artículo científico publicado en 2008

Relating the liver damage with hepatitis C virus polymorphism in core region and human variables in HIV-1-coinfected patients.

artículo científico publicado en 2010

Relating the outcome of HCV infection and different host SNP polymorphisms in a Majorcan population coinfected with HCV-HIV and treated with pegIFN-RBV.

artículo científico publicado en 2014

Relationship between within-host fitness and virulence in the vesicular stomatitis virus: correlation with partial decoupling

artículo científico publicado en 2012

Repeated transfer of small RNA virus populations leading to balanced fitness with infrequent stochastic drift

artículo científico publicado en 1996

Repeated transfer of small RNA virus populations leading to balanced fitness with infrequent stochastic drift

Repetitive nucleotide sequencing of a dispensable DNA segment in a clonal population of African swine fever virus

artículo científico publicado en 1991

Reply to "chronic obstructive pulmonary disease lung microbiota diversity may be mediated by age or inhaled corticosteroid use".

artículo científico publicado en 2015

Retrospective case-control study of viral pathogen screening in proliferative verrucous leukoplakia lesions

artículo científico publicado en 2014

Rifampicin treatment of Blattella germanica evidences a fecal transmission route of their gut microbiota

artículo científico publicado en 2018

Sampling and repeatability in the evaluation of hepatitis C virus genetic variability.

artículo científico publicado en 2003

Scanty microbes, the 'symbionelle' concept.

artículo científico publicado en 2013

Selection for robustness in mutagenized RNA viruses

artículo científico publicado en 2007

Selection on coding regions determined Hox7 genes evolution

artículo científico publicado en 2003

Selective growth-inhibitory effect of 8-hydroxyquinoline towards Clostridium difficile and Bifidobacterium longum subsp. longum in co-culture analysed by flow cytometry.

artículo científico publicado en 2014

Sequence analysis of the polymerase domain of HIV-1 reverse transcriptase in naive and zidovudine-treated individuals reveals a higher polymorphism in alpha-helices as compared with beta-strands.

artículo científico publicado en 1999

Sequences of isopenicillin N synthetase genes suggest horizontal gene transfer from prokaryotes to eukaryotes

article

Serratia symbiotica from the aphid Cinara cedri: a missing link from facultative to obligate insect endosymbiont

artículo científico publicado en 2011

Severity-related changes of bronchial microbiome in chronic obstructive pulmonary disease.

artículo científico publicado en 2014

Sex versus parthenogenesis: a transcriptomic approach of photoperiod response in the model aphid Acyrthosiphon pisum (Hemiptera: Aphididae).

artículo científico publicado en 2007

Side-stepping secondary symbionts: widespread horizontal transfer across and beyond the Aphidoidea.

artículo científico publicado en 2003

Simbiosis y parasitismo

Simulating Multilevel Dynamics of Antimicrobial Resistance in a Membrane Computing Model

artículo científico publicado en 2019

Small but powerful, the primary endosymbiont of moss bugs, Candidatus Evansia muelleri, holds a reduced genome with large biosynthetic capabilities

artículo científico publicado en 2014

Solving a Bloody Mess: B-Vitamin Independent Metabolic Convergence among Gammaproteobacterial Obligate Endosymbionts from Blood-Feeding Arthropods and the Leech Haementeria officinalis.

artículo científico publicado en 2015

Structural alterations of faecal and mucosa-associated bacterial communities in irritable bowel syndrome.

artículo científico publicado en 2012

Structural analyses of a hypothetical minimal metabolism

artículo científico publicado en 2007

Structural and functional changes in the gut microbiota associated to Clostridium difficile infection

artículo científico publicado en 2014

Study of the viral and microbial communities associated with Crohn's disease: a metagenomic approach.

artículo científico publicado en 2013

Succession of the gut microbiota in the cockroach Blattella germanica

artículo científico publicado en 2014

SymbioGenomesDB: a database for the integration and access to knowledge on host-symbiont relationships.

artículo científico publicado en 2015

Symbionts and pathogens: what is the difference?

artículo científico

Tempo and mode of early gene loss in endosymbiotic bacteria from insects

artículo científico publicado en 2006

Testing the Domino Theory of Gene Loss in : The Relevance of Epistatic Interactions

article

The Endobiota Study: Comparison of Vaginal, Cervical and Gut Microbiota Between Women with Stage 3/4 Endometriosis and Healthy Controls

artículo científico publicado en 2019

The Evolutionary Origin of Xanthomonadales Genomes and the Nature of the Horizontal Gene Transfer Process

article

The Gut Metagenome Changes in Parallel to Waist Circumference, Brain Iron Deposition, and Cognitive Function

artículo científico publicado en 2017

The Gut Microbiota Composition of the Moth Brithys crini Reflects Insect Metamorphosis

scientific article published on 03 December 2019

The Gypsy Database (GyDB) of mobile genetic elements

artículo científico publicado en 2007

The Metabolic Building Blocks of a Minimal Cell

artículo científico publicado en 2020

The active human gut microbiota differs from the total microbiota

artículo científico publicado en 2011

The analysis of the oral DNA virome reveals which viruses are widespread and rare among healthy young adults in Valencia (Spain).

artículo científico publicado en 2018

The calculus of Life: Contingency vs. necessity

artículo científico publicado en 2022

The cockroach Blattella germanica obtains nitrogen from uric acid through a metabolic pathway shared with its bacterial endosymbiont.

artículo científico publicado en 2014

The contribution of epistasis to the architecture of fitness in an RNA virus

scholarly article

The cost of replication fidelity in an RNA virus

artículo científico publicado en 2005

The cost of replication fidelity in human immunodeficiency virus type 1.

artículo científico publicado en 2007

The distribution of fitness effects caused by single-nucleotide substitutions in an RNA virus

artículo científico publicado en 2004

The effect of co- and superinfection on the adaptive dynamics of vesicular stomatitis virus

artículo científico publicado en 2006

The effects of prebiotics on microbial dysbiosis, butyrate production and immunity in HIV-infected subjects

artículo científico publicado en 2016

The evolution of RNA viruses: A population genetics view

artículo científico publicado en 2000

The evolution of the heat-shock protein GroEL from Buchnera, the primary endosymbiont of aphids, is governed by positive selection

artículo científico publicado en 2002

The evolutionary history of Drosophila buzzatii. XXX. Mitochondrial DNA polymorphism in original and colonizing populations.

artículo científico publicado en 1996

The evolutionary history of symbiotic associations among bacteria and their animal hosts: a model

artículo científico publicado en 2009

The frontier between cell and organelle: genome analysis of Candidatus Carsonella ruddii

artículo científico publicado en 2007

The genetic structure of Drosophila subobscura populations from the islands of Majorca and Minorca (Balearic Islands, Spain) based on allozymes and mitochondrial DNA

article

The genome of Cardinium cBtQ1 provides insights into genome reduction, symbiont motility, and its settlement in Bemisia tabaci

artículo científico publicado en 2014

The genome sequence of Blochmannia floridanus: comparative analysis of reduced genomes

artículo científico publicado en 2003

The genomic sequence of Exiguobacterium chiriqhucha str. N139 reveals a species that thrives in cold waters and extreme environmental conditions

artículo científico publicado en 2017

The haplotype distribution of two genes of citrus tristeza virus is altered after host change or aphid transmission.

artículo científico publicado en 1999

The link between independent acquisition of intracellular gamma-endosymbionts and concerted evolution in Tremblaya princeps

artículo científico publicado en 2015

The pea aphid phylome: a complete catalogue of evolutionary histories and arthropod orthology and paralogy relationships for Acyrthosiphon pisum genes.

artículo científico publicado en 2010

The population genetics and evolutionary epidemiology of RNA viruses

artículo científico publicado en 2004

The red queen reigns in the kingdom of RNA viruses

artículo científico publicado en 1994

The respiratory microbiome in bronchial mucosa and secretions from severe IgE-mediated asthma patients

artículo científico publicado en 2017

The role of positive selection in hepatitis C virus

artículo científico publicado en 2009

The role of rotation on Petersen diagrams

artículo científico publicado en 2007

The striking case of tryptophan provision in the cedar aphid Cinara cedri.

artículo científico publicado en 2008

The ten grand challenges of synthetic life

artículo científico publicado en 2011

Time Series Analysis of the Microbiota of Children Suffering From Acute Infectious Diarrhea and Their Recovery After Treatment.

artículo científico publicado en 2018

Time and rate of evolution are the key to establish transmission cases

article

To B or Not to B: Comparative Genomics Suggests as a Source of B Vitamins in Whiteflies

artículo científico publicado en 2018

Toward minimal bacterial cells: evolution vs. design

artículo científico publicado en 2008

Towards a microbial thermoelectric cell

artículo científico publicado en 2013

Transmission of hepatitis C virus by a cardiac surgeon.

artículo científico publicado en 1996

Tremblaya phenacola PPER: an evolutionary beta-gammaproteobacterium collage

artículo científico publicado en 2017

Two host clades, two bacterial arsenals: evolution through gene losses in facultative endosymbionts

artículo científico publicado en 2015

Unequal distribution of RT-PCR artifacts along the E1-E2 region of Hepatitis C virus

artículo científico publicado en 2009

Unravelling the bacterial diversity found in the semi-arid Tablas de Daimiel National Park wetland (central Spain)

article

Using evolutionary tools to refine the new hypervariable region 3 within the envelope 2 protein of hepatitis C virus.

artículo científico publicado en 2007

Validating viral quasispecies with digital organisms: a re-examination of the critical mutation rate

artículo científico publicado en 2005

Variation of haplotype distributions of two genomic regions of Citrus tristeza virus populations from eastern Spain

artículo científico publicado en 2003

Variations in two gene sequences of Citrus tristeza virus after host passage

artículo científico publicado en 2006

Virulence factor rtx in Legionella pneumophila, evidence suggesting it is a modular multifunctional protein

artículo científico publicado en 2008

Weighted fitness theory: an approach to symbiotic communities.

artículo científico publicado en 2017

What Symbionts Teach us about Modularity

artículo científico publicado en 2013

Whole-genome sequence of Stenotrophomonas maltophilia D457, a clinical isolate and a model strain.

artículo científico publicado en 2012

Why are the genomes of endosymbiotic bacteria so stable?

artículo científico publicado en 2003

Yeast cultures with UCP1 uncoupling activity as a heating device

article

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