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Lista de obras de Miroslaw Cygler

1.8 A refined structure of the lipase from Geotrichum candidum

artículo científico publicado en 1993

1H, 13C and 15N resonance assignments of human 5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase

artículo científico publicado en 2004

A case study on the treatment of protein SIRAS data

artículo científico publicado en 2014

A data management system for structural genomics

artículo científico publicado en 2004

Active site of chondroitin AC lyase revealed by the structure of enzyme-oligosaccharide complexes and mutagenesis

artículo científico publicado en 2001

An atypical approach identifies TYR234 as the key base catalyst in chondroitin AC lyase

artículo científico publicado en 2006

Analogs of reaction intermediates identify a unique substrate binding site in Candida rugosa lipase

artículo científico publicado en 1994

Application of Dynamic Light Scattering in Protein Crystallization

artículo científico publicado el 1 de agosto de 2010

Application of the molecular replacement method to multidomain proteins. 1. Determination of the orientation of an immunoglobulin Fab fragment

scientific article published on 01 January 1988

Application of the molecular replacement method to multidomain proteins. 2. Comparison of various methods for positioning an oriented fragment in the unit cell

artículo científico publicado en 1988

Asparagine 405 of heparin lyase II prevents the cleavage of glycosidic linkages proximate to a 3‐O‐sulfoglucosamine residue

artículo científico publicado el 6 de julio de 2011

Bacillus thuringiensis CryIA(a) insecticidal toxin: crystal structure and channel formation

artículo científico publicado en 1995

Bacterial polysaccharide co-polymerases share a common framework for control of polymer length

artículo científico publicado en 2008

Bacterial structural genomics initiative: overview of methods and technologies applied to the process of structure determination

artículo científico publicado en 2008

Binding the atypical RA domain of Ste50p to the unfolded Opy2p cytoplasmic tail is essential for the high-osmolarity glycerol pathway.

artículo científico publicado en 2009

Biochemical and crystallographic studies reveal a specific interaction between TRAPP subunits Trs33p and Bet3p

artículo científico publicado en 2005

CS lyases: structure, activity, and applications in analysis and the treatment of diseases

artículo científico publicado en 2006

Catalytic Mechanism of Heparinase II Investigated by Site-directed Mutagenesis and the Crystal Structure with Its Substrate

artículo científico publicado en 2010

Channeling efficiency in the bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase domain: the effects of site-directed mutagenesis of NADP binding residues

article

Characterization of chondroitin sulfate lyase ABC from Bacteroides thetaiotaomicron WAL2926.

artículo científico publicado en 2008

Characterization of interactions between LPS transport proteins of the Lpt system

artículo científico publicado en 2010

Cloning, Baeyer-Villiger Biooxidations, and Structures of the Camphor Pathway 2-Oxo-Δ 3 -4,5,5-Trimethylcyclopentenylacetyl-Coenzyme A Monooxygenase of Pseudomonas putida ATCC 17453

artículo científico publicado el 20 de enero de 2012

Coiled-coil helix rotation selects repressing or activating state of transcriptional regulator DhaR

artículo científico publicado en 2014

Comparison of solid state and solution conformations of R and S epimers of 8,5'-cycloadenosine and their relevance to some enzymatic reactions

scientific article published on 01 May 1981

Composite active site of chondroitin lyase ABC accepting both epimers of uronic acid

artículo científico publicado en 2008

Computer modeling studies of the structure of a repressor

Conformational flexibility of PL12 family heparinases: structure and substrate specificity of heparinase III from Bacteroides thetaiotaomicron (BT4657)

artículo científico publicado en 2016

Contribution of structural genomics to understanding the biology of Escherichia coli

artículo científico publicado en 2003

Coverage of protein sequence space by current structural genomics targets

artículo científico publicado en 2003

Crystal Structure of Proteus vulgaris Chondroitin Sulfate ABC Lyase I at 1.9Å Resolution

artículo científico publicado el 2 de mayo de 2003

Crystal Structure of the Salmonella Typhimurium Effector GtgE.

artículo científico publicado en 2016

Crystal Structures of Apo and Metal-Bound Forms of the UreE Protein from Helicobacter pylori: Role of Multiple Metal Binding Sites,

artículo científico publicado el 24 de agosto de 2010

Crystal structure of D-ribose-5-phosphate isomerase (RpiA) from Escherichia coli

artículo científico publicado en 2002

Crystal structure of Escherichia coli PdxA, an enzyme involved in the pyridoxal phosphate biosynthesis pathway

artículo científico publicado en 2003

Crystal structure of Escherichia coli crotonobetainyl-CoA: carnitine CoA-transferase (CaiB) and its complexes with CoA and carnitinyl-CoA.

artículo científico publicado en 2005

Crystal structure of Escherichia coli glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (RffH) complexed with dTTP and Mg2+

artículo científico publicado en 2002

Crystal structure of Methanobacterium thermoautotrophicum phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase HisI.

artículo científico publicado en 2005

Crystal structure of StaL, a glycopeptide antibiotic sulfotransferase from Streptomyces toyocaensis

artículo científico publicado en 2007

Crystal structure of a peptidyl pyridinium methyl ketone inhibitor with thrombin

artículo científico publicado en 1995

Crystal structure of a trimeric form of dephosphocoenzyme A kinase from Escherichia coli

artículo científico publicado en 2003

Crystal structure of chondroitin AC lyase, a representative of a family of glycosaminoglycan degrading enzymes

artículo científico publicado en 1999

Crystal structure of chondroitinase B from Flavobacterium heparinum and its complex with a disaccharide product at 1.7 A resolution

artículo científico publicado en 1999

Crystal structure of histidinol phosphate aminotransferase (HisC) from Escherichia coli, and its covalent complex with pyridoxal-5'-phosphate and l-histidinol phosphate

artículo científico publicado en 2001

Crystal structure of human grancalcin, a member of the penta-EF-hand protein family

artículo científico publicado en 2000

Crystal structure of human procathepsin X: a cysteine protease with the proregion covalently linked to the active site cysteine

artículo científico publicado en 2000

Crystal structure of the RluD pseudouridine synthase catalytic module, an enzyme that modifies 23S rRNA and is essential for normal cell growth of Escherichia coli

artículo científico publicado en 2004

Crystal structure of the YciO protein from Escherichia coli

artículo científico publicado en 2002

Crystal structure of the bb' domains of the protein disulfide isomerase ERp57

artículo científico publicado en 2006

Crystal structure of the complex of human alpha-thrombin and nonhydrolyzable bifunctional inhibitors, hirutonin-2 and hirutonin-6

artículo científico publicado en 1993

Crystal structure of two new bifunctional nonsubstrate type thrombin inhibitors complexed with human alpha-thrombin

artículo científico publicado en 1996

Crystal structure of ureidoglycolate hydrolase (AllA) from Escherichia coli O157:H7.

artículo científico publicado en 2005

Crystal structures of Escherichia coli ATP-dependent glucokinase and its complex with glucose

artículo científico publicado en 2004

Crystallization and preliminary X-ray analysis of PaaAC, the main component of the hydroxylase of the Escherichia coli phenylacetyl-coenzyme A oxygenase complex

artículo científico publicado el 26 de agosto de 2010

Crystallization and preliminary X-ray analysis of chondroitin sulfate ABC lyases I and II from Proteus vulgaris

scientific article published on 01 July 2000

Crystallization and preliminary X-ray analysis of chondroitinase B from Flavobacterium heparinum

artículo científico publicado en 1999

Crystallization and preliminary X-ray analysis of heparinase II from Pedobacter heparinus

artículo científico publicado en 2004

Crystallization and preliminary X-ray analysis of human grancalcin, a novel cytosolic Ca2+-binding protein present in leukocytes

artículo científico publicado en 2000

Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of human procathepsin L

artículo científico publicado en 1996

Crystallization and preliminary analysis of chondroitinase AC fromFlavobacterium heparinum

artículo científico publicado el 1 de marzo de 1998

Crystallization and structural details of Ca(2+)-induced conformational changes in the EF-hand domain VI of calpain

artículo científico publicado en 2002

Crystallographic trapping of the glutamyl-CoA thioester intermediate of family I CoA transferases.

artículo científico publicado en 2005

Defining substrate characteristics from 3D structure; perspective on EstA structure

artículo científico publicado en 2004

Design of P1' and P3' residues of trivalent thrombin inhibitors and their crystal structures

artículo científico publicado en 2000

Design of a data model for developing laboratory information management and analysis systems for protein production

artículo científico publicado en 2005

Design of a linker for trivalent thrombin inhibitors: interaction of the main chain of the linker with thrombin

scientific article published on 01 April 1993

Design of noncovalent inhibitors of human cathepsin L. From the 96-residue proregion to optimized tripeptides

artículo científico publicado en 2002

Domain organization and crystal structure of the catalytic domain of E.coli RluF, a pseudouridine synthase that acts on 23S rRNA.

artículo científico publicado en 2006

Essential roles of zinc ligation and enzyme dimerization for catalysis in the aminoacylase-1/M20 family

artículo científico publicado en 2003

Expression and characterization of Geotrichum candidum lipase I gene. Comparison of specificity profile with lipase II.

artículo científico publicado en 1995

Family of phenylacetyl-CoA monooxygenases differs in subunit organization from other monooxygenases

artículo científico publicado en 2013

Genetic selection designed to stabilize proteins uncovers a chaperone called Spy

artículo científico publicado el 13 de febrero de 2011

High-Level Production of RecombinantGeotrichum candidumLipases in YeastPichia pastoris

artículo científico publicado el 1 de octubre de 1997

High-resolution crystal structure of Arthrobacter aurescens chondroitin AC lyase: an enzyme-substrate complex defines the catalytic mechanism

artículo científico publicado en 2004

Identification of Residues Essential for Differential Fatty Acyl Specificity of Geotrichum candidum Lipases I and II

artículo científico publicado el 2 de diciembre de 1997

Identification of an Escherichia coli O157:H7 heme oxygenase with tandem functional repeats

artículo científico publicado en 2005

Improvement of the Thermostability and Activity of a Pectate Lyase by Single Amino Acid Substitutions, Using a Strategy Based on Melting-Temperature-Guided Sequence Alignment

artículo científico publicado en 2008

Insights from protein-protein interaction studies on bacterial pathogenesis.

artículo científico publicado en 2017

Insights into function of PSI domains from structure of the Met receptor PSI domain

artículo científico publicado en 2004

Insights into interfacial activation from an open structure of Candida rugosa lipase

artículo científico publicado en 1993

Insights into the biology of Escherichia coli through structural proteomics.

artículo científico publicado en 2007

Interaction of the Ankyrin H Core Effector of Legionella with the Host LARP7 Component of the 7SK snRNP Complex

artículo científico publicado en 2019

Interactions between Kinase Scaffold MP1/p14 and Its Endosomal Anchoring Protein p18

artículo científico publicado el 15 de abril de 2011

Lectin control of protein folding and sorting in the secretory pathway

scientific journal article

Legionella pneumophila effector Lem4 is a membrane-associated protein tyrosine phosphatase

artículo científico publicado en 2018

Liquid chromatography-mass spectrometry to study chondroitin lyase action pattern

artículo científico publicado en 2008

Lysine-based structure responsible for selective mannose phosphorylation of cathepsin D and cathepsin L defines a common structural motif for lysosomal enzyme targeting.

artículo científico publicado en 1998

Mechanism of action and NAD+-binding mode revealed by the crystal structure of L-histidinol dehydrogenase

artículo científico publicado en 2002

Molecular basis for the binding and modulation of V-ATPase by a bacterial effector protein.

artículo científico publicado en 2017

Molecular dynamics-solvated interaction energy studies of protein-protein interactions: the MP1-p14 scaffolding complex

artículo científico publicado en 2008

Molecules of Escherichia coli MobB assemble into densely packed hollow cylinders in a crystal lattice with 75% solvent content

artículo científico publicado en 2003

NMR structure of YcgL, a conserved protein from Escherichia coli representing the DUF709 family, with a novel alpha/beta/alpha sandwich fold

artículo científico publicado en 2007

New Ulvan-Degrading Polysaccharide Lyase Family: Structure and Catalytic Mechanism Suggests Convergent Evolution of Active Site Architecture.

artículo científico publicado en 2017

NleH defines a new family of bacterial effector kinases

artículo científico publicado en 2014

Polymorphism in the lipase genes of Geotrichum candidum strains

artículo científico publicado en 1994

Polysaccharide co-polymerases: the enigmatic conductors of the O-antigen assembly orchestra.

artículo científico

Preliminary studies on the crystallization of beef heart cytochrome c oxidase by vapor diffusion

artículo científico publicado en 1990

Preparation and characterization of bacterial protein complexes for structural analysis

artículo científico publicado en 2009

Preparation, characterization and crystallization of an antibody Fab fragment that recognizes RNA. Crystal structures of native Fab and three Fab-mononucleotide complexes

artículo científico publicado en 1994

Progress in understanding the assembly process of bacterial O-antigen

artículo científico publicado en 2014

Protein-Protein Interactions in the  -Oxidation Part of the Phenylacetate Utilization Pathway: CRYSTAL STRUCTURE OF THE PaaF-PaaG HYDRATASE-ISOMERASE COMPLEX

artículo científico publicado en 2012

Purification and characterization of a Penicillium sp. lipase which discriminates against diglycerides

artículo científico publicado en 1996

Quantitative continuous assay for hyaluronan synthase

artículo científico publicado en 2006

Quaternary structure of WzzB and WzzE polysaccharide copolymerases

artículo científico publicado en 2014

Recognition of a Cell-Surface Oligosaccharide of Pathogenic Salmonella by an Antibody Fab Fragment

artículo científico publicado el 26 de julio de 1991

Recognition of a carbohydrate antigenic determinant of Salmonella by an antibody

artículo científico publicado el 1 de mayo de 1993

Recognition of carbohydrates by antibodies

artículo científico publicado en 1994

Redesigning the active site of Geotrichum candidum lipase

Regulation of Shigella Effector Kinase OspG through Modulation of Its Dynamic Properties

artículo científico publicado en 2018

Relationship between sequence conservation and three-dimensional structure in a large family of esterases, lipases, and related proteins

artículo científico publicado en 1993

Role of arginine 292 in the catalytic activity of chondroitin AC lyase from Flavobacterium heparinum

artículo científico publicado en 2002

Salmonella Disrupts Host Endocytic Trafficking by SopD2-Mediated Inhibition of Rab7

artículo científico publicado en 2015

Salmonella Effectors SseK1 and SseK3 Target Death Domain Proteins in the TNF and TRAIL Signaling Pathways

artículo científico publicado en 2019

Site-directed mutagenesis of the active site region in the quinate/shikimate 5-dehydrogenase YdiB of Escherichia coli

artículo científico publicado en 2004

Solution structure of a trisaccharide-antibody complex: comparison of NMR measurements with a crystal structure

artículo científico publicado en 1994

Specificity determinants of human cathepsin s revealed by crystal structures of complexes

artículo científico publicado en 2003

Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes

artículo científico publicado en 2009

Structural Basis for Fe–S Cluster Assembly and tRNA Thiolation Mediated by IscS Protein–Protein Interactions

artículo científico publicado en 2010

Structural Characterization of Closely Related O-antigen Lipopolysaccharide (LPS) Chain Length Regulators

artículo científico publicado el 21 de marzo de 2012

Structural Mimicry by a Bacterial F Box Effector Hijacks the Host Ubiquitin-Proteasome System

artículo científico publicado en 2017

Structural Organization of Enzymes of the Phenylacetate Catabolic Hybrid Pathway

artículo científico

Structural Snapshots of Heparin Depolymerization by Heparin Lyase I

artículo científico publicado en 2009

Structural and Functional Analysis of Campylobacter jejuni PseG: A UDP-SUGAR HYDROLASE FROM THE PSEUDAMINIC ACID BIOSYNTHETIC PATHWAY

artículo científico publicado en 2009

Structural and Functional Investigations of the Effector Protein LpiR1 from Legionella pneumophila

artículo científico publicado en 2016

Structural and enzymatic characterization of NanS (YjhS), a 9‐O‐Acetyl N‐acetylneuraminic acid esterase from Escherichia coli O157:H7

artículo científico publicado el 31 de mayo de 2011

Structural and functional characterization of PL28 family ulvan lyase NLR48 from Nonlabens ulvanivorans

artículo científico publicado en 2018

Structural and functional characterization of PseC, an aminotransferase involved in the biosynthesis of pseudaminic acid, an essential flagellar modification in Helicobacter pylori

artículo científico publicado en 2006

Structural and functional studies of the Escherichia coli phenylacetyl-CoA monooxygenase complex

artículo científico publicado en 2011

Structural and functional study of Legionella pneumophila effector RavA

scientific article published on 09 March 2021

Structural and mechanistic classification of uronic acid-containing polysaccharide lyases

artículo científico publicado en 2010

Structural and mechanistic insight into covalent substrate binding by Escherichia coli dihydroxyacetone kinase

artículo científico publicado el 5 de enero de 2011

Structural basis for specificity of papain-like cysteine protease proregions toward their cognate enzymes

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 1998

Structural basis for the inhibition of host protein ubiquitination by Shigella effector kinase OspG

artículo científico publicado en 2014

Structural basis of the regulation of the CbpA co-chaperone by its specific modulator CbpM

artículo científico publicado en 2010

Structural context for proteinN-glycosylation in bacteria: The structure of PEB3, an adhesin fromCampylobacter jejuni

artículo científico publicado en 2007

Structural insight into effector proteins of Gram-negative bacterial pathogens that modulate the phosphoproteome of their host

artículo científico

Structural similarity of YbeD protein from Escherichia coli to allosteric regulatory domains

artículo científico publicado en 2004

Structural snapshots of Escherichia coli histidinol phosphate phosphatase along the reaction pathway

artículo científico publicado en 2006

Structurally unique interaction of RBD-like and PH domains is crucial for yeast pheromone signaling

artículo científico publicado el 14 de diciembre de 2012

Structure and active site residues of PglD, an N-acetyltransferase from the bacillosamine synthetic pathway required for N-glycan synthesis in Campylobacter jejuni

artículo científico publicado en 2008

Structure and conformation of the potent antiherpes agent 9-(2-hydroxyethoxymethyl)guanine (acycloguanosine)

artículo científico publicado el 15 de diciembre de 1981

Structure and conformational flexibility of Candida rugosa lipase

artículo científico publicado en 1999

Structure and function of the glycopeptide N-methyltransferase MtfA, a tool for the biosynthesis of modified glycopeptide antibiotics

artículo científico publicado en 2009

Structure and functional dynamics of the mitochondrial Fe/S cluster synthesis complex.

artículo científico publicado en 2017

Structure of Ca2+-loaded human grancalcin

artículo científico publicado el 21 de noviembre de 2001

Structure of CbpA J-domain bound to the regulatory protein Cbpm explains its specificity and suggests evolutionary link between Cbpm and transcriptional regulators

artículo científico publicado en 2014

Structure of GlgS from Escherichia coli suggests a role in protein-protein interactions

artículo científico publicado en 2004

Structure of L-Xylulose-5-Phosphate 3-Epimerase (UlaE) from the Anaerobic L-Ascorbate Utilization Pathway of Escherichia coli: Identification of a Novel Phosphate Binding Motif within a TIM Barrel Fold

artículo científico publicado en 2008

Structure of [NiFe] Hydrogenase Maturation Protein HypE from Escherichia coli and Its Interaction with HypF

artículo científico publicado en 2008

Structure of a calpain Ca2+-binding domain reveals a novel EF-hand and Ca2+-induced conformational changes

artículo científico publicado el 1 de julio de 1997

Structure of a single-chain antibody variable domain (Fv) fragment complexed with a carbohydrate antigen at 1.7-A resolution

artículo científico publicado en 1994

Structure of apoptosis-linked protein ALG-2: insights into Ca2+-induced changes in penta-EF-hand proteins

artículo científico publicado en 2001

Structure of human procathepsin L reveals the molecular basis of inhibition by the prosegment

artículo científico publicado en 1996

Structure of hydrogenase maturation protein HypF with reaction intermediates shows two active sites

artículo científico publicado en 2011

Structure of rat procathepsin B: model for inhibition of cysteine protease activity by the proregion

artículo científico publicado en 1996

Structure of the 16S rRNA pseudouridine synthase RsuA bound to uracil and UMP

artículo científico publicado en 2002

Structure of the N-terminal domain of the effector protein LegC3 from Legionella pneumophila

artículo científico publicado en 2014

Structure of the noncatalytic domains and global fold of the protein disulfide isomerase ERp72

artículo científico publicado en 2009

Structure of the pseudouridine synthase RsuA from Haemophilus influenzae.

artículo científico publicado en 2005

Structure-Function Analysis of Escherichia coli MnmG (GidA), a Highly Conserved tRNA-Modifying Enzyme

artículo científico publicado en 2009

Structure-function analyses of a PL24 family ulvan lyase reveal key features and suggest its catalytic mechanism

artículo científico publicado en 2018

Structure-guided investigation of lipopolysaccharide O-antigen chain length regulators reveals regions critical for modal length control

artículo científico publicado en 2011

Structures of shikimate dehydrogenase AroE and its Paralog YdiB. A common structural framework for different activities

artículo científico publicado en 2003

Structures of three inhibitor complexes provide insight into the reaction mechanism of the human methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase

artículo científico publicado en 2000

Sulfonation of glycopeptide antibiotics by sulfotransferase StaL depends on conformational flexibility of aglycone scaffold

artículo científico publicado en 2012

Synthesis, structural, and biological studies on a pseudodisaccharide containing a bicyclic, bridged carba-sugar

scholarly article by Zsolt Fejes et al published July 2011 in Tetrahedron: Asymmetry

The 3-D structure of a folate-dependent dehydrogenase/cyclohydrolase bifunctional enzyme at 1.5 å resolution

artículo científico publicado el 15 de febrero de 1998

The KH domain facilitates the substrate specificity and unwinding processivity of DDX43 helicase

artículo científico publicado en 2020

The Legionella kinase LegK7 exploits the Hippo pathway scaffold protein MOB1A for allostery and substrate phosphorylation

artículo científico publicado en 2020

The Solution Structure of YbcJ from Escherichia coli Reveals a Recently Discovered L Motif Involved in RNA Binding

artículo científico publicado en 2003

The Structure of calnexin, an ER chaperone involved in quality control of protein folding

artículo científico publicado en 2001

The alpha/beta hydrolase fold

artículo científico publicado el 1 de abril de 1992

The architecture of the multisubunit TRAPP I complex suggests a model for vesicle tethering

artículo científico publicado en 2006

The crystal structure of CREG, a secreted glycoprotein involved in cellular growth and differentiation

artículo científico publicado en 2005

The crystal structure of Escherichia coli MoeA, a protein from the molybdopterin synthesis pathway

artículo científico publicado en 2001

The final player in the coenzyme A biosynthetic pathway

artículo científico publicado en 2003

The open conformation of a Pseudomonas lipase

artículo científico publicado en 1997

The structural genomics experimental pipeline: insights from global target lists.

artículo científico publicado en 2004

The structure of Legionella effector protein LpnE provides insights into its interaction with Oculocerebrorenal syndrome of Lowe (OCRL) protein

scientific article published on 20 December 2018

The structure of chondroitin B lyase complexed with glycosaminoglycan oligosaccharides unravels a calcium-dependent catalytic machinery

artículo científico publicado en 2004

The structure of the MAPK scaffold, MP1, bound to its partner, p14. A complex with a critical role in endosomal map kinase signaling

artículo científico publicado en 2004

The structure of the RlmB 23S rRNA methyltransferase reveals a new methyltransferase fold with a unique knot

artículo científico publicado en 2002

The structure of the exopolyphosphatase (PPX) from Escherichia coli O157:H7 suggests a binding mode for long polyphosphate chains

artículo científico publicado en 2006

Three-dimensional structure of 2-amino-3-ketobutyrate CoA ligase from Escherichia coli complexed with a PLP-substrate intermediate: inferred reaction mechanism

artículo científico publicado en 2001

Trapping open and closed forms of FitE: a group III periplasmic binding protein

artículo científico publicado en 2009

Uronic polysaccharide degrading enzymes

artículo científico publicado en 2014

Crystal structure of wild-type human procathepsin K

artículo científico publicado en 1999