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Lista de obras de Jasper Koehorst

A FAIR approach to genomics ⬇️

PhD thesis

A chromosome-level assembly of the black tiger shrimp (Penaeus monodon) genome facilitates the identification of growth-associated genes

artículo científico publicado en 2021

A genomic view on syntrophic versus non-syntrophic lifestyle in anaerobic fatty acid degrading communities

artículo científico publicado en 2014

A protocol for adding knowledge to Wikidata, a case report

scientific article published on 07 April 2020

A protocol for adding knowledge to Wikidata: aligning resources on human coronaviruses ⬇️

artículo científico publicado en 2021

Assembly and Comparison of Ca. Neoehrlichia mikurensis Genomes

artículo científico publicado en 2022

Assessing the Metabolic Diversity of Streptococcus from a Protein Domain Point of View

artículo científico publicado en 2015

Author Correction: A protocol for adding knowledge to Wikidata: aligning resources on human coronaviruses

artículo científico publicado en 2023

Capturing the biofuel wellhead and powerhouse: the chloroplast and mitochondrial genomes of the leguminous feedstock tree Pongamia pinnata

artículo científico publicado en 2012

Comparative genomics highlights symbiotic capacities and high metabolic flexibility of the marine genus Pseudovibrio

artículo científico publicado en 2018

Comparative genomics of Streptococcus pyogenes M1 isolates differing in virulence and propensity to cause systemic infection in mice

artículo científico publicado en 2015

Comparison of 432 Pseudomonas strains through integration of genomic, functional, metabolic and expression data

artículo científico publicado en 2016

Complete Genome Sequence of Akkermansia glycaniphila Strain PytT, a Mucin-Degrading Specialist of the Reticulated Python Gut.

artículo científico publicado en 2017

Complete genome sequence of thermophilic Bacillus smithii type strain DSM 4216(T).

artículo científico publicado en 2016

Concurrent Haloalkanoate Degradation and Chlorate Reduction by Pseudomonas chloritidismutans AW-1T.

artículo científico publicado en 2017

Differential translation tunes uneven production of operon-encoded proteins

artículo científico publicado en 2013

Diversity of tryptophan halogenases in sponges of the genus Aplysina

artículo científico publicado en 2019

Effects of Argonaute on Gene Expression in Thermus thermophilus

artículo científico publicado en 2015

FAIR data station for lightweight metadata management and validation of omics studies

artículo científico publicado en 2022

Galactocerebroside biosynthesis pathways of Mycoplasma species: an antigen triggering Guillain-Barré-Stohl syndrome

artículo científico publicado en 2021

Genome analyses of the carboxydotrophic sulfate-reducers Desulfotomaculum nigrificans and Desulfotomaculum carboxydivorans and reclassification of Desulfotomaculum caboxydivorans as a later synonym of Desulfotomaculum nigrificans

artículo científico publicado en 2014

Genome and proteome analysis of Pseudomonas chloritidismutans AW-1T that grows on n-decane with chlorate or oxygen as electron acceptor

artículo científico publicado en 2015

Genomic convergence between Akkermansia muciniphila in different mammalian hosts

artículo científico publicado en 2021

Interoperable genome annotation with GBOL, an extendable infrastructure for functional data mining

MEMOTE for standardized genome-scale metabolic model testing

artículo científico publicado en 2020

Machine learning approaches to predict the Plant-associated phenotype of Xanthomonas strains

artículo científico publicado en 2021

Memote: A community-driven effort towards a standardized genome-scale metabolic model test suite

Metabolic shift induced by synthetic co-cultivation promotes high yield of chain elongated acids from syngas

scientific article published on 02 December 2019

NG-Tax 2.0: A Semantic Framework for High-Throughput Amplicon Analysis

artículo científico publicado en 2019

Organohalide-respiring Desulfoluna species isolated from marine environments

artículo científico publicado en 2020

Persistence of Functional Protein Domains in Mycoplasma Species and their Role in Host Specificity and Synthetic Minimal Life.

artículo científico publicado en 2017

Protein domain architectures provide a fast, efficient and scalable alternative to sequence-based methods for comparative functional genomics.

artículo científico publicado en 2016

Publisher Correction: MEMOTE for standardized genome-scale metabolic model testing

artículo científico publicado en 2020

RDF2Graph a tool to recover, understand and validate the ontology of an RDF resource

artículo científico publicado en 2015

RNA targeting by the type III-A CRISPR-Cas Csm complex of Thermus thermophilus

artículo científico publicado en 2014

RO-Crate Metadata Specification 1.1.1

artículo científico

Reverse Methanogenesis and Respiration in Methanotrophic Archaea

artículo científico publicado en 2017

SALARECON connects the Atlantic salmon genome to growth and feed efficiency

artículo científico publicado en 2022

SAPP: functional genome annotation and analysis through a semantic framework using FAIR principles

artículo científico publicado en 2017

Structure and activity of the RNA-targeting Type III-B CRISPR-Cas complex of Thermus thermophilus

artículo científico publicado en 2013

Systems Biology in ELIXIR: modelling in the spotlight

artículo científico publicado en 2024

The Constructor: a web application optimizing cloning strategies based on modules from the registry of standard biological parts

artículo científico publicado en 2012

The Empusa code generator and its application to GBOL, an extendable ontology for genome annotation

scientific article published on 04 November 2019

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