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Lista de obras de Haim Wolfson

A comparative study of amyloid fibril formation by residues 15-19 of the human calcitonin hormone: a single beta-sheet model with a small hydrophobic core

artículo científico publicado en 2004

A computer vision based technique for 3-D sequence-independent structural comparison of proteins

artículo científico publicado en 1993

A hierarchical protein folding scheme based on the building block folding model.

artículo científico publicado en 2007

A method for simultaneous alignment of multiple protein structures

artículo científico publicado en 2004

A new, structurally nonredundant, diverse data set of protein-protein interfaces and its implications

artículo científico publicado en 2004

A permissive secondary structure-guided superposition tool for clustering of protein fragments toward protein structure prediction via fragment assembly.

artículo científico publicado en 2006

ARTS: alignment of RNA tertiary structures

artículo científico publicado en 2005

Algorithms for multiple protein structure alignment and structure-derived multiple sequence alignment.

artículo científico publicado en 2008

Allosteric regulation of glycogen synthase kinase 3β: a theoretical study

artículo científico publicado en 2010

An integrated suite of fast docking algorithms

artículo científico publicado en 2010

Analysis and classification of RNA tertiary structures

artículo científico publicado en 2008

Approaching the CAPRI challenge with an efficient geometry-based docking

artículo científico publicado en 2005

Automatic prediction of protein interactions with large scale motion

artículo científico publicado en 2007

Beta2-microglobulin amyloidosis: insights from conservation analysis and fibril modelling by protein docking techniques

artículo científico publicado en 2003

BioInfo3D: a suite of tools for structural bioinformatics

artículo científico publicado en 2004

Blind prediction of interfacial water positions in CAPRI

artículo científico publicado en 2013

Changing the charge distribution of beta-helical-based nanostructures can provide the conditions for charge transfer

artículo científico publicado en 2007

Combinatorial docking approach for structure prediction of large proteins and multi-molecular assemblies

artículo científico publicado en 2005

Computational validation of protein nanotubes

artículo científico publicado en 2009

Computer-Based Identification of a Novel LIMK1/2 Inhibitor that Synergizes with Salirasib to Destabilize the Actin Cytoskeleton ⬇️

artículo científico publicado el 1 de junio de 2012

Concepts and schemes for the re-engineering of physical protein modules: generating nanodevices via targeted replacements with constrained amino acids

artículo científico publicado en 2006

Conformational transitions in human translin enable nucleic acid binding.

artículo científico publicado en 2013

Conservation and amyloid formation: a study of the gelsolin-like family

artículo científico publicado en 2003

Conservation of polar residues as hot spots at protein interfaces

scholarly article by Zengjian Hu published in June 2000

Constructing templates for protein structure prediction by simulation of protein folding pathways.

artículo científico publicado en 2008

Correlated mutations: advances and limitations. A study on fusion proteins and on the Cohesin-Dockerin families

artículo científico publicado en 2006

De novo tubular nanostructure design based on self-assembly of beta-helical protein motifs

artículo científico publicado en 2006

Design of Disruptors of the Hsp90-Cdc37 Interface

scientific article published on 15 January 2020

Determining macromolecular assembly structures by molecular docking and fitting into an electron density map ⬇️

artículo científico publicado el 15 de noviembre de 2010

Deterministic pharmacophore detection via multiple flexible alignment of drug-like molecules

artículo científico publicado en 2008

Diameter-selective dispersion of carbon nanotubes by β-lactoglobulin whey protein ⬇️

artículo científico publicado el 16 de julio de 2013

DockStar: a novel ILP-based integrative method for structural modeling of multimolecular protein complexes

artículo científico publicado en 2015

EMatch: an efficient method for aligning atomic resolution subunits into intermediate-resolution cryo-EM maps of large macromolecular assemblies

artículo científico publicado en 2006

EMatch: discovery of high resolution structural homologues of protein domains in intermediate resolution cryo-EM maps

artículo científico publicado en 2007

Examination of shape complementarity in docking ofUnbound proteins

article by Raquel Norel et al published 15 August 1999 in Proteins

FiberDock: Flexible induced-fit backbone refinement in molecular docking

artículo científico publicado en 2010

FiberDock: a web server for flexible induced-fit backbone refinement in molecular docking

artículo científico publicado en 2010

Fibril modelling by sequence and structure conservation analysis combined with protein docking techniques: beta(2)-microglobulin amyloidosis

artículo científico publicado en 2005

FireDock: a web server for fast interaction refinement in molecular docking

artículo científico publicado en 2008

FireDock: fast interaction refinement in molecular docking

artículo científico publicado en 2007

FlexProt: alignment of flexible protein structures without a predefinition of hinge regions

artículo científico publicado en 2004

Flexible protein alignment and hinge detection

artículo científico publicado en 2002

From structure to function: methods and applications

artículo científico publicado en 2005

Generation and analysis of a protein-protein interface data set with similar chemical and spatial patterns of interactions

artículo científico publicado en 2005

Geometry-based flexible and symmetric protein docking

artículo científico publicado en 2005

Hierarchical protein folding pathways: a computational study of protein fragments.

artículo científico publicado en 2003

HingeProt: automated prediction of hinges in protein structures

artículo científico publicado en 2008

How does the reductase help to regulate the catalytic cycle of cytochrome P450 3A4 using the conserved water channel?

artículo científico publicado en 2010

Identification of the N-terminal peptide binding site of glucose-regulated protein 94.

artículo científico publicado en 2004

Inferential optimization for simultaneous fitting of multiple components into a CryoEM map of their assembly

artículo científico publicado en 2009

Interaction of c(60)-fullerene and carboxyfullerene with proteins: docking and binding site alignment

artículo científico publicado en 2006

Mechanism of two classes of cancer mutations in the phosphoinositide 3-kinase catalytic subunit

artículo científico publicado en 2007

Memdock: an α-helical membrane protein docking algorithm

artículo científico publicado en 2016

Metabolic stereoselectivity of cytochrome P450 3A4 towards deoxypodophyllotoxin: In silico predictions and experimental validation

artículo científico publicado en 2007

Modeling of Multimolecular Complexes

artículo científico publicado en 2020

MolAxis: a server for identification of channels in macromolecules

artículo científico publicado en 2008

MolAxis: efficient and accurate identification of channels in macromolecules

artículo científico publicado en 2008

Molecular surface representations by sparse critical points

artículo científico publicado en 1994

MultiBind and MAPPIS: webservers for multiple alignment of protein 3D-binding sites and their interactions

artículo científico publicado en 2008

MultiFit: a web server for fitting multiple protein structures into their electron microscopy density map ⬇️

artículo científico publicado el 1 de julio de 2011

Multiple diverse ligands binding at a single protein site: a matter of pre-existing populations

artículo científico publicado en 2002

Multiple structural alignment by secondary structures: algorithm and applications

artículo científico publicado en 2003

Novel LIMK2 Inhibitor Blocks Panc-1 Tumor Growth in a mouse xenograft model

artículo científico publicado en 2014

Novel approach for efficient pharmacophore-based virtual screening: method and applications

artículo científico publicado en 2009

On type of metric spaces

scientific article published in 1986

Optimization of multiple-sequence alignment based on multiple-structure alignment

artículo científico publicado en 2006

ParaDock: a flexible non-specific DNA--rigid protein docking algorithm ⬇️

artículo científico publicado el 10 de agosto de 2011

PatchDock and SymmDock: servers for rigid and symmetric docking

artículo científico publicado en 2005

PepCrawler: a fast RRT-based algorithm for high-resolution refinement and binding affinity estimation of peptide inhibitors ⬇️

artículo científico publicado el 31 de agosto de 2011

PharmaGist: a webserver for ligand-based pharmacophore detection

artículo científico publicado en 2008

PinaColada: peptide-inhibitor ant colony ad-hoc design algorithm

artículo científico publicado en 2016

Potential folding-function interrelationship in proteins

artículo científico publicado en 2004

Predicting molecular interactions in silico: I. A guide to pharmacophore identification and its applications to drug design

artículo científico publicado en 2004

Predicting molecular interactions in silico: II. Protein-protein and protein-drug docking

artículo científico publicado en 2004

Prediction of interacting single-stranded RNA bases by protein-binding patterns

artículo científico publicado en 2008

Prediction of multimolecular assemblies by multiple docking

artículo científico publicado en 2005

Principles of docking: An overview of search algorithms and a guide to scoring functions

artículo científico publicado en 2002

Principles of docking: An overview of search algorithms and a guide to scoring functions

scholarly article by Inbal Halperin published in May 2002

Principles of flexible protein-protein docking

artículo científico publicado en 2008

Principles of nanostructure design with protein building blocks

artículo científico publicado en 2007

Protein structure fitting and refinement guided by cryo-EM density

artículo científico publicado en 2008

Protein structure prediction using a docking-based hierarchical folding scheme

artículo científico publicado en 2011

Protein structure prediction via combinatorial assembly of sub-structural units.

artículo científico publicado en 2003

Protein-Peptide Interaction Design: PepCrawler and PinaColada

artículo científico publicado en 2017

Protein-protein interactions: structurally conserved residues distinguish between binding sites and exposed protein surfaces

artículo científico publicado en 2003

Protein-protein interactions; coupling of structurally conserved residues and of hot spots across interfaces. Implications for docking

artículo científico publicado en 2004

QM/MM study of the active species of the human cytochrome P450 3A4, and the influence thereof of the multiple substrate binding

artículo científico publicado en 2007

Recognition of functional sites in protein structures.

artículo científico publicado en 2004

Reducing the computational complexity of protein folding via fragment folding and assembly

artículo científico publicado en 2003

RsiteDB: a database of protein binding pockets that interact with RNA nucleotide bases

artículo científico publicado en 2008

Self-assembly of fused homo-oligomers to create nanotubes

artículo científico publicado en 2008

Side chain interactions determine the amyloid organization: a single layer beta-sheet molecular structure of the calcitonin peptide segment 15-19.

artículo científico publicado en 2004

SiteEngines: recognition and comparison of binding sites and protein-protein interfaces

artículo científico publicado en 2005

SiteLight: binding-site prediction using phage display libraries

artículo científico publicado en 2003

SnapDock-template-based docking by Geometric Hashing

artículo científico publicado en 2017

Spatial chemical conservation of hot spot interactions in protein-protein complexes

artículo científico publicado en 2007

Structural dynamics of the cooperative binding of organic molecules in the human cytochrome P450 3A4.

artículo científico publicado en 2007

Structural similarity of genetically interacting proteins

artículo científico publicado en 2008

Structure-based in silico identification of ubiquitin-binding domains provides insights into the ALIX-V:ubiquitin complex and retrovirus budding ⬇️

artículo científico publicado el 29 de enero de 2013

SymmRef: a flexible refinement method for symmetric multimers

artículo científico publicado en 2011

Symmetry-based self-assembled nanotubes constructed using native protein structures: the key role of flexible linkers

artículo científico publicado en 2011

Taking geometry to its edge: fast unbound rigid (and hinge-bent) docking

artículo científico publicado en 2003

The ARTS web server for aligning RNA tertiary structures

artículo científico publicado en 2006

The multiple common point set problem and its application to molecule binding pattern detection

artículo científico publicado en 2006

Theoretical characterization of substrate access/exit channels in the human cytochrome P450 3A4 enzyme: involvement of phenylalanine residues in the gating mechanism

artículo científico publicado en 2009

Using DelPhi to compute electrostatic potentials and assess their contribution to interactions

artículo científico publicado en 2003

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