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Lista de obras de Dmitri A. Petrov

A Novel Method Distinguishes Between Mutation Rates and Fixation Biases in Patterns of Single-Nucleotide Substitution

article

A combined molecular and cytogenetic approach to genome evolution in Drosophila using large-fragment DNA cloning.

artículo científico publicado en 1993

A recent adaptive transposable element insertion near highly conserved developmental loci in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2009

A spatio-temporal assessment of simian/human immunodeficiency virus (SHIV) evolution reveals a highly dynamic process within the host.

artículo científico publicado en 2017

Accurate Allele Frequencies from Ultra-low Coverage Pool-Seq Samples in Evolve-and-Resequence Experiments

scientific article published on 03 December 2019

An Intrinsically Disordered Region of the DNA Repair Protein Nbs1 Is a Species-Specific Barrier to Herpes Simplex Virus 1 in Primates

artículo científico publicado en 2016

Ancient RNA virus epidemics through the lens of recent adaptation in human genomes

scientific article published on 20 March 2020

Broad geographic sampling reveals the shared basis and environmental correlates of seasonal adaptation in Drosophila

artículo científico publicado en 2021

Broker genes in human disease

artículo científico publicado en 2010

Codon bias and noncoding GC content correlate negatively with recombination rate on the Drosophila X chromosome

artículo científico publicado en 2005

Common variants spanning PLK4 are associated with mitotic-origin aneuploidy in human embryos

artículo científico publicado en 2015

Comparative population genomics of latitudinal variation in Drosophila simulans and Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2015

Comparative population genomics: power and principles for the inference of functionality

artículo científico

Correction: Highly contiguous assemblies of 101 drosophilid genomes

artículo científico publicado en 2022

Development of a Comprehensive Genotype-to-Fitness Map of Adaptation-Driving Mutations in Yeast

artículo científico publicado en 2016

Diverse transposable elements are mobilized in hybrid dysgenesis in Drosophila virilis

artículo científico publicado el 15 de agosto de 1995

Do disparate mechanisms of duplication add similar genes to the genome?

artículo científico publicado en 2005

Drosophila melanogaster recombination rate calculator.

artículo científico publicado en 2010

Effects of maternal age on euploidy rates in a large cohort of embryos analyzed with 24-chromosome single-nucleotide polymorphism-based preimplantation genetic screening

artículo científico publicado en 2016

Elevated Linkage Disequilibrium and Signatures of Soft Sweeps Are Common in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2016

Empirical validation of pooled whole genome population re-sequencing in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2012

Enhancer choice in cis and in trans in Drosophila melanogaster: role of the promoter

artículo científico publicado en 2004

Evidence for DNA Loss as a Determinant of Genome Size

artículo científico publicado en 2000

Evidence of Selection against Complex Mitotic-Origin Aneuploidy during Preimplantation Development

artículo científico publicado en 2015

Evidence that adaptation in Drosophila is not limited by mutation at single sites

artículo científico publicado en 2010

Evidence that mutation is universally biased towards AT in bacteria

artículo científico publicado en 2010

Evolution of genome content: population dynamics of transposable elements in flies and humans.

artículo científico

Evolution of genome size: new approaches to an old problem

artículo científico publicado en 2001

Evolutionary Dynamics in Structured Populations Under Strong Population Genetic Forces

scientific article published on 07 October 2019

Evolutionary biology for the 21st century

artículo científico publicado en 2013

Extremely Rare Polymorphisms in Saccharomyces cerevisiae Allow Inference of the Mutational Spectrum

artículo científico publicado en 2017

Faster than neutral evolution of constrained sequences: the complex interplay of mutational biases and weak selection.

artículo científico publicado en 2011

Fitness variation across subtle environmental perturbations reveals local modularity and global pleiotropy of adaptation

artículo científico publicado en 2020

Frequent adaptation and the McDonald-Kreitman test.

artículo científico publicado en 2013

General rules for optimal codon choice

artículo científico publicado en 2009

Genome patterns of selection and introgression of haplotypes in natural populations of the house mouse (Mus musculus).

artículo científico publicado en 2012

Genome size as a mutation-selection-drift process

artículo científico publicado en 1999

Genome-wide patterns of adaptation to temperate environments associated with transposable elements in Drosophila

artículo científico publicado en 2010

Genome-wide signals of positive selection in human evolution

artículo científico publicado en 2014

Genomewide spatial correspondence between nonsynonymous divergence and neutral polymorphism reveals extensive adaptation in Drosophila

artículo científico publicado en 2007

Genomic evidence of rapid and stable adaptive oscillations over seasonal time scales in Drosophila

artículo científico publicado en 2014

Genomic gigantism: DNA loss is slow in mountain grasshoppers

artículo científico publicado en 2001

Genomic heterogeneity of background substitutional patterns in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2004

Genomic inference accurately predicts the timing and severity of a recent bottleneck in a nonmodel insect population

artículo científico publicado en 2014

Genomic regulation of transposable elements in Drosophila.

artículo científico publicado en 1995

Global Transcriptional Profiling of Diapause and Climatic Adaptation in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2015

Heterozygote Advantage Is a Common Outcome of Adaptation in Saccharomyces cerevisiae.

artículo científico publicado en 2016

Heterozygote advantage as a natural consequence of adaptation in diploids

artículo científico publicado en 2011

High functional diversity in Mycobacterium tuberculosis driven by genetic drift and human demography

artículo científico publicado en 2008

High intrinsic rate of DNA loss in Drosophila

artículo científico publicado en 1996

High rate of DNA loss in the Drosophila melanogaster and Drosophila virilis species groups

artículo científico publicado el 1 de marzo de 1998

High rate of recent transposable element-induced adaptation in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2008

Host species and environmental effects on bacterial communities associated with Drosophila in the laboratory and in the natural environment

artículo científico publicado en 2013

Illumina TruSeq synthetic long-reads empower de novo assembly and resolve complex, highly-repetitive transposable elements

artículo científico publicado en 2014

Imperfect drug penetration leads to spatial monotherapy and rapid evolution of multidrug resistance

artículo científico publicado en 2015

Inferring the strength of selection in Drosophila under complex demographic models.

artículo científico publicado en 2008

LDx: estimation of linkage disequilibrium from high-throughput pooled resequencing data

artículo científico publicado en 2012

Mapping the in vivo fitness landscape of lung adenocarcinoma tumor suppression in mice.

artículo científico publicado en 2018

Minor shift in background substitutional patterns in the Drosophila saltans and willistoni lineages is insufficient to explain GC content of coding sequences

artículo científico publicado en 2006

Molecular evolution of the testis TAFs of Drosophila

artículo científico publicado en 2009

More effective drugs lead to harder selective sweeps in the evolution of drug resistance in HIV-1

artículo científico publicado en 2016

Multiplexed in vivo homology-directed repair and tumor barcoding enables parallel quantification of Kras variant oncogenicity.

artículo científico publicado en 2017

Mutational equilibrium model of genome size evolution

artículo científico publicado en 2002

Nonadaptive explanations for signatures of partial selective sweeps in Drosophila

artículo científico publicado en 2008

Obstruction of adaptation in diploids by recessive, strongly deleterious alleles

artículo científico publicado en 2015

On the limitations of using ribosomal genes as references for the study of codon usage: a rebuttal

artículo científico publicado en 2012

Parameterizing Pantherinae: de novo mutation rate estimates from Panthera and Neofelis pedigrees

Patterns of nucleotide substitution in Drosophila and mammalian genomes

artículo científico publicado en 1999

Paucity of chimeric gene-transposable element transcripts in the Drosophila melanogaster genome

artículo científico publicado en 2005

Pervasive Strong Selection at the Level of Codon Usage Bias in Drosophila melanogaster

scientific article published on 23 December 2019

Pervasive and persistent redundancy among duplicated genes in yeast

artículo científico publicado en 2008

Pervasive hitchhiking at coding and regulatory sites in humans

artículo científico publicado en 2009

Pervasive natural selection in the Drosophila genome?

artículo científico publicado en 2009

Population genomics of rapid adaptation by soft selective sweeps.

artículo científico

Population genomics of transposable elements in Drosophila melanogaster.

artículo científico publicado en 2010

Precise estimates of mutation rate and spectrum in yeast

artículo científico publicado en 2014

Preferential duplication of conserved proteins in eukaryotic genomes

artículo científico publicado en 2004

Protein evolution in the context of Drosophila development

artículo científico publicado en 2005

Quantitative evolutionary dynamics using high-resolution lineage tracking

artículo científico publicado en 2015

RNA viruses drove adaptive introgressions between Neanderthals and modern humans

Rapid seasonal evolution in innate immunity of wild Drosophila melanogaster.

artículo científico publicado en 2018

Rapid sequence turnover at an intergenic locus in Drosophila

artículo científico publicado en 2004

Rates of DNA Duplication and Mitochondrial DNA Insertion in the Human Genome

artículo científico publicado en 2003

Recent selective sweeps in North American Drosophila melanogaster show signatures of soft sweeps

artículo científico publicado en 2015

Reduced selection leads to accelerated gene loss in Shigella

artículo científico

Relaxed purifying selection and possibly high rate of adaptation in primate lineage-specific genes

artículo científico publicado en 2010

Reply to Chen and Zhang: On interpreting genome-wide trends from yeast mutation accumulation data

artículo científico publicado en 2014

SEGE: A database on 'intron less/single exonic' genes from eukaryotes

artículo científico publicado en 2002

Seeking Goldilocks During Evolution of Drug Resistance

artículo científico publicado en 2017

Similar levels of X-linked and autosomal nucleotide variation in African and non-African populations of Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2007

Similarly strong purifying selection acts on human disease genes of all evolutionary ages

artículo científico publicado en 2009

Size matters: non-LTR retrotransposable elements and ectopic recombination in Drosophila

artículo científico publicado en 2003

Soft Selective Sweeps in Evolutionary Rescue

artículo científico publicado en 2017

Soft selective sweeps in complex demographic scenarios.

artículo científico publicado en 2014

Strong purifying selection at synonymous sites in D. melanogaster

artículo científico publicado en 2013

T-lex2: genotyping, frequency estimation and re-annotation of transposable elements using single or pooled next-generation sequencing data

artículo científico publicado en 2014

T-lex: a program for fast and accurate assessment of transposable element presence using next-generation sequencing data

artículo científico publicado en 2011

The adaptive role of transposable elements in the Drosophila genome

artículo científico publicado en 2009

The cis-regulatory effects of modern human-specific variants

artículo científico publicado en 2021

The large genome constraint hypothesis: evolution, ecology and phenotype

artículo científico publicado en 2005

Tissue-specific cis-regulatory divergence implicates a fatty acid elongase necessary for inhibiting interspecies mating in Drosophila

Trash DNA is what gets thrown away: high rate of DNA loss in Drosophila

artículo científico publicado el 31 de diciembre de 1997

Viruses are a dominant driver of protein adaptation in mammals.

artículo científico publicado en 2016

Whole Genome Analysis of 132 Clinical Saccharomyces cerevisiae Strains Reveals Extensive Ploidy Variation

artículo científico publicado en 2016

X-linked genes evolve higher codon bias in Drosophila and Caenorhabditis

artículo científico publicado en 2005