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Lista de obras de Barbara Wold

18-P012 The muscle gene regulatory network

article

A comparative encyclopedia of DNA elements in the mouse genome

artículo científico publicado en 2014

A highly conserved molecular switch binds MSY-3 to regulate myogenin repression in postnatal muscle

scientific journal article

A mathematical and computational framework for quantitative comparison and integration of large-scale gene expression data

artículo científico publicado en 2005

A ratiometric-based measure of gene co-expression

artículo científico publicado en 2014

Altering genotype and phenotype by DNA-mediated gene transfer

artículo científico publicado en 1980

An encyclopedia of mouse DNA elements (Mouse ENCODE).

artículo científico publicado en 2012

Analysis of promoter-specific repression by triple-helical DNA complexes in a eukaryotic cell-free transcription system ⬇️

artículo científico publicado el 14 de enero de 1992

Appearance and persistence of maternal RNA sequences in sea urchin development ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 1977

ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia

artículo científico publicado en 2012

Comparative genomics modeling of the NRSF/REST repressor network: from single conserved sites to genome-wide repertoire

artículo científico publicado en 2006

Computation for ChIP-seq and RNA-seq studies

artículo científico publicado en 2009

Connectivity in the yeast cell cycle transcription network: inferences from neural networks

artículo científico publicado en 2006

Defining functional DNA elements in the human genome

artículo científico publicado en 2014

DifferentMRF4Knockout Alleles Differentially Disrupt Myf-5 Expression:cis-Regulatory Interactions at theMRF4/Myf-5Locus ⬇️

artículo científico publicado el 15 de agosto de 1997

Differentiation and fiber type-specific activity of a muscle creatine kinase intronic enhancer

artículo científico publicado en 2011

Disruption of the mouse MRF4 gene identifies multiple waves of myogenesis in the myotome ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 1995

Dissecting the regulatory activity and sequence content of loci with exceptional numbers of transcription factor associations

artículo científico publicado en 2020

Dynamic DNA methylation across diverse human cell lines and tissues

artículo científico publicado en 2013

Dynamic transformations of genome-wide epigenetic marking and transcriptional control establish T cell identity

artículo científico publicado en 2012

Dynamics of microRNA expression during mouse prenatal development

artículo científico publicado en 2019

Effects of sequence variation on differential allelic transcription factor occupancy and gene expression

artículo científico publicado en 2012

Enhanced signals and fast nucleic acid hybridization by microfluidic chaotic mixing

artículo científico publicado en 2006

Evidence for site-specific occupancy of the mitochondrial genome by nuclear transcription factors

artículo científico publicado en 2014

Expanded encyclopaedias of DNA elements in the human and mouse genomes

artículo científico publicado en 2020

Expression of transfected vimentin genes in differentiating murine erythroleukemia cells reveals divergent cis-acting regulation of avian and mammalian vimentin sequences

artículo científico publicado en 1987

Extensive Promoter-Centered Chromatin Interactions Provide a Topological Basis for Transcription Regulation ⬇️

artículo científico publicado el 20 de enero de 2012

From single-cell to cell-pool transcriptomes: stochasticity in gene expression and RNA splicing.

artículo científico publicado en 2013

Fully automated high-throughput chromatin immunoprecipitation for ChIP-seq: identifying ChIP-quality p300 monoclonal antibodies

artículo científico publicado en 2014

GA4GH: International policies and standards for data sharing across genomic research and healthcare

artículo científico publicado en 2021

Gene expression changes in a tumor xenograft by a pyrrole-imidazole polyamide

artículo científico publicado en 2012

Genome-wide analysis reveals coating of the mitochondrial genome by TFAM.

artículo científico publicado en 2013

Genome-wide mapping of in vivo protein-DNA interactions

artículo científico publicado en 2007

Genomic DNA as a cohybridization standard for mammalian microarray measurements

artículo científico publicado en 2004

Genomic DNA as a general cohybridization standard for ratiometric microarrays

artículo científico publicado en 2006

Herculin, a fourth member of the MyoD family of myogenic regulatory genes

artículo científico publicado en 1990

High resolution mapping of Twist to DNA in Drosophila embryos: Efficient functional analysis and evolutionary conservation

artículo científico publicado en 2011

INFORMATION ACCESS: Building A "GenBank" of the Published Literature

artículo científico publicado en 2001

Identification and confirmation of a module of coexpressed genes

artículo científico publicado en 2002

Inhibition of DNA binding proteins by oligonucleotide-directed triple helix formation

artículo científico publicado en 1989

Inhibition of Klenow fragment DNA polymerase on double-helical templates by oligonucleotide-directed triple-helix formation

artículo científico

Integrating and mining the chromatin landscape of cell-type specificity using self-organizing maps

artículo científico

Interleukin-2 transcription is regulated in vivo at the level of coordinated binding of both constitutive and regulated factors.

artículo científico publicado en 1994

Introduction and expression of a rabbit beta-globin gene in mouse fibroblasts ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 1979

Investigating ChIP-seq derived candidate cis-regulatory regions in two different developmental systems

scholarly article by Katherine Fisher published in August 2010

Inviability of aDNA2deletion mutant is due to the DNA damage checkpoint ⬇️

artículo científico publicado el 15 de mayo de 2011

Isolated sequences from the linked Myf-5 and MRF4 genes drive distinct patterns of muscle-specific expression in transgenic mice.

artículo científico publicado en 1993

Kinetic analysis of oligodeoxyribonucleotide-directed triple-helix formation on DNA.

artículo científico publicado en 1990

Landscape of transcription in human cells

artículo científico publicado en 2012

Large-scale quality analysis of published ChIP-seq data

artículo científico publicado en 2014

Ligation-mediated PCR for genomic sequencing and footprinting

artículo científico publicado en 2001

Mapping a multiplexed zoo of mRNA expression

artículo científico publicado en 2016

Mapping and quantifying mammalian transcriptomes by RNA-Seq

artículo científico publicado en 2008

Microglia in the Cerebral Cortex in Autism ⬇️

artículo científico publicado el 1 de diciembre de 2012

Mining gene expression data by interpreting principal components

artículo científico publicado en 2006

Multigenome DNA sequence conservation identifies Hox cis-regulatory elements

artículo científico publicado en 2008

MyoD(-/-) satellite cells in single-fiber culture are differentiation defective and MRF4 deficient

artículo científico publicado en 2000

New computational approaches for analysis of cis-regulatory networks.

artículo científico publicado en 2002

Nucleolar Localization of myc Transcripts ⬇️

artículo científico publicado el 1 de junio de 1993

Occupancy maps of 208 chromatin-associated proteins in one human cell type

artículo científico publicado en 2020

Oligonucleotide-Directed DNA Triple-Helix Formation: An Approach to Artificial Repressors? ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1991

Phosphorothioate oligonucleotide-directed triple helix formation.

artículo científico publicado en 1994

Pitfalls of mapping high-throughput sequencing data to repetitive sequences: Piwi's genomic targets still not identified.

artículo científico publicado en 2015

Poly-L-ornithine-mediated transformation of mammalian cells

artículo científico publicado en 1987

RNA editing in the human ENCODE RNA-seq data

artículo científico publicado en 2012

Reconstructing a metazoan genetic pathway with transcriptome-wide epistasis measurements.

artículo científico publicado en 2018

Reply to Brunet and Doolittle: Both selected effect and causal role elements can influence human biology and disease

artículo científico publicado en 2014

Scaffolding a Caenorhabditis nematode genome with RNA-seq

artículo científico publicado en 2010

Sea urchin embryo mRNA sequences expressed in the nuclear RNA of adult tissues

artículo científico publicado en 1978

Sequence census methods for functional genomics

scientific article published on 19 December 2007

Significance and statistical errors in the analysis of DNA microarray data

artículo científico publicado en 2002

Single-Cell Analysis Reveals Regulatory Gene Expression Dynamics Leading to Lineage Commitment in Early T Cell Development

artículo científico publicado en 2019

Single-Cell Analysis of Regulatory Gene Expression in Quiescent and Activated Mouse Skeletal Muscle Satellite Cells ⬇️

artículo científico publicado el 15 de noviembre de 1997

Single-cell transcriptome analysis reveals dynamic changes in lncRNA expression during reprogramming

artículo científico publicado en 2015

Skeletal muscle phenotypes initiated by ectopic MyoD in transgenic mouse heart.

artículo científico publicado en 1992

Structural gene sets active in embryos and adult tissues of the sea urchin

artículo científico publicado el 1 de abril de 1976

Systematic evaluation of factors influencing ChIP-seq fidelity

artículo científico publicado en 2012

The Human Cell Atlas

artículo científico publicado en 2017

The Human Cell Atlas

The Human Cell Atlas White Paper ⬇️

artículo científico publicado en 2018

The NIH BD2K center for big data in translational genomics

artículo científico publicado en 2015

The bHLH class protein pMesogenin1 can specify paraxial mesoderm phenotypes.

artículo científico publicado en 2000

The changing mouse embryo transcriptome at whole tissue and single-cell resolution

artículo científico publicado en 2020

Tissue-specific expression of distinct spectrin and ankyrin transcripts in erythroid and nonerythroid cells

artículo científico publicado en 1985

Transcript assembly and quantification by RNA-Seq reveals unannotated transcripts and isoform switching during cell differentiation

artículo científico publicado en 2010

Transcription factor redundancy and tissue-specific regulation: evidence from functional and physical network connectivity

artículo científico publicado en 2012

Transcriptional regulation by nicotine in dopaminergic neurons ⬇️

artículo científico publicado el 9 de agosto de 2013

Transformation of mammalian cells with genes from procaryotes and eucaryotes ⬇️

artículo científico publicado el 1 de abril de 1979

Transformation of mammalian cells with genes from prokaryotes and eukaryotes. 1979.

artículo científico publicado en 1992

p62 overexpression in breast tumors and regulation by prostate-derived Ets factor in breast cancer cells

artículo científico publicado en 2003

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