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Lista de obras de Laura Landweber

<mds_ies_db>: a database of ciliate genome rearrangements

artículo científico publicado en 2015

A Chimeric Chromosome in the Ciliate Oxytricha Resulting from Duplication ⬇️

artículo científico publicado el 22 de octubre de 2011

A community experiment with fully open and published peer review

artículo científico publicado en 2006

A functional role for transposases in a large eukaryotic genome

artículo científico publicado en 2009

A genome-wide study of dual coding regions in human alternatively spliced genes

artículo científico publicado en 2005

A micronuclear locus containing three protein-coding genes remains linked during macronuclear development in the spirotrichous ciliate Holosticha

artículo científico publicado en 2004

A new scrambled gene in the ciliate Uroleptus

scientific article published on 28 November 2005

A simple model based on mutation and selection explains trends in codon and amino-acid usage and GC composition within and across genomes

artículo científico publicado en 2001

A strategy for producing single-stranded DNA in the polymerase chain reaction. A direct method for genomic sequencing.

artículo científico publicado en 1989

Are stop codons recognized by base triplets in the large ribosomal RNA subunit?

artículo científico publicado en 2005

BLASTO: a tool for searching orthologous groups

artículo científico publicado en 2007

Biology Direct: celebrating 7 years of open, published peer review

artículo científico publicado en 2013

Capture of complete ciliate chromosomes in single sequencing reads reveals widespread chromosome isoforms

artículo científico publicado en 2019

Characterization and taxonomic validity of the ciliate Oxytricha trifallax (Class Spirotrichea) based on multiple gene sequences: limitations in identifying genera solely by morphology

artículo científico publicado en 2012

Characterization of novel sequences from distantly related taxa by walking PCR.

artículo científico publicado en 2000

Chess games: a model for RNA based computation

artículo científico publicado en 1999

Chromosome fusions triggered by noncoding RNA.

artículo científico publicado en 2016

Coding properties of Oxytricha trifallax (Sterkiella histriomuscorum) macronuclear chromosomes: analysis of a pilot genome project

scientific article published on 16 July 2004

Combinatorial DNA Rearrangement Facilitates the Origin of New Genes in Ciliates

artículo científico publicado en 2015

Complex germline architecture: two genes intertwined on two loci

artículo científico publicado en 2005

Computer science and meta-evolution. Evolution as computation, the Center for Discrete Mathematics and Theoretical Computer Science (DIMACS), Princeton, University, Princeton, NJ, USA, 11-12 January 1999.

artículo científico publicado en 1999

Computer science and the evolution of genetic information

artículo científico publicado en 2002

Computing with DNA

artículo científico publicado en 2000

Conservation of tandem stop codons in yeasts

artículo científico publicado en 2005

Conserved linkage of two genes on the same macronuclear chromosome in spirotrichous ciliates

scientific article published on 07 March 2006

Counting DNA: estimating the complexity of a test tube of DNA.

artículo científico publicado en 1999

Custom codons come in threes, fours, and fives

artículo científico publicado en 2002

Cytosine methylation and hydroxymethylation mark DNA for elimination in

Cytosine methylation and hydroxymethylation mark DNA for elimination in Oxytricha trifallax

artículo científico publicado en 2012

DNA-guided establishment of nucleosome patterns within coding regions of a eukaryotic genome

artículo científico publicado en 2015

Decoding the decoding region: analysis of eukaryotic release factor (eRF1) stop codon-binding residues

artículo científico publicado en 2005

Detection of a common chimeric transcript between human chromosomes 7 and 16.

artículo científico publicado en 2012

Do proteins predate DNA?

scientific article published in Science

Early fixation of an optimal genetic code

artículo científico publicado en 2000

Emergence of a dual-catalytic RNA with metal-specific cleavage and ligase activities: the spandrels of RNA evolution

artículo científico publicado en 1999

Epigenetic inheritance in ciliates

artículo científico publicado en 2009

Evolution and assembly of an extremely scrambled gene

artículo científico publicado en 2000

Evolution of four types of RNA editing in myxomycetes

artículo científico publicado en 2000

Evolution of gene scrambling in ciliate micronuclear genes

artículo científico publicado en 1999

Evolution of programmed DNA rearrangements in a scrambled gene

artículo científico publicado en 2006

Evolution: Lost worlds

artículo científico publicado en 1998

Experimental RNA evolution

artículo científico publicado en 1999

Exploiting Oxytricha trifallax nanochromosomes to screen for non-coding RNA genes

artículo científico publicado en 2011

Fidelity of enzymatic ligation for DNA computing

artículo científico publicado en 2000

Fully controllable microfluidics for molecular computers

article

Gene Unscrambler for detangling scrambled genes in ciliates

artículo científico publicado en 2004

Genetic Code: What Nature Missed ⬇️

artículo científico publicado el 11 de noviembre de 2003

Genetic code

artículo científico publicado en 2004

Genetics. Why genomes in pieces?

artículo científico publicado en 2007

Genome-wide analysis of chromatin architecture in Oxytricha trifallax: a single-celled eukaryote with 16,000 tiny chromosomes.

artículo científico publicado en 2013

Genomes on the edge: programmed genome instability in ciliates

artículo científico publicado en 2013

Genview and Gencode : a pair of programs to test theories of genetic code evolution

artículo científico publicado en 2001

Guilt by association: the arginine case revisited

artículo científico publicado en 2000

How Mitochondria Redefine the Code

How to Compute with DNA

Hypothesis: RNA editing of microRNA target sites in humans?

artículo científico publicado en 2007

Identification of a DNA N6-Adenine Methyltransferase Complex and Its Impact on Chromatin Organization

scientific article published on 16 May 2019

Interconversion of germline-limited and somatic DNA in a scrambled gene

artículo científico publicado en 2006

Intron Evolution and Information processing in the DNA polymerase alpha gene in spirotrichous ciliates: a hypothesis for interconversion between DNA and RNA deletion

artículo científico publicado en 2007

Inviscid analysis of two-dimensional airfoils in unsteady motion using conformal mapping

Is the Genetic Code Really a Frozen Accident? New Evidence from in Vitro Selection

article

LUCApedia: a database for the study of ancient life

artículo científico publicado en 2013

Ligation activity of fragmented ribozymes in frozen solution: implications for the RNA world

artículo científico publicado en 2004

Ligation module for in vitro selection in DNA computing

MDS_IES_DB: a database of macronuclear and micronuclear genes in spirotrichous ciliates

artículo científico publicado en 2005

Macronuclear genome structure of the ciliate Nyctotherus ovalis: single-gene chromosomes and tiny introns

artículo científico publicado en 2008

Measuring adaptation within the genetic code

scientific article published on 01 February 2000

Meeting report: XIIIth meeting of the International Society for Evolutionary Protistology, Ceské Budejovice, Czech Republic, July 31-August 4, 2000.

artículo científico publicado en 2000

Mitochondrial RNAs of myxomycetes terminate with non-encoded 3' poly(U) tails

artículo científico publicado en 2000

Molecular computation: RNA solutions to chess problems

artículo científico publicado en 2000

Molecular computing revisited: a Moore's Law?

artículo científico publicado en 2003

Molecular mimicry: quantitative methods to study structural similarity between protein and RNA

artículo científico publicado en 2005

NT-seq: a chemical-based sequencing method for genomic methylome profiling

scientific article published on 30 May 2022

Non-model model organisms.

artículo científico publicado en 2017

On the paucity of duplicated genes in Caenorhabditis elegans operons

artículo científico publicado en 2006

Oxytricha as a modern analog of ancient genome evolution

artículo científico publicado en 2012

Phylogenetic analysis of RNA editing: a primitive genetic phenomenon

artículo científico publicado en 1994

Phylogenetic invariants and geometry

artículo científico publicado en 2000

Phylogenomic analysis reveals genome-wide purifying selection on TBE transposons in the ciliate Oxytricha

artículo científico publicado en 2016

Piwi-interacting RNAs protect DNA against loss during Oxytricha genome rearrangement

artículo científico publicado en 2012

Polymorphism, recombination and alternative unscrambling in the DNA polymerase alpha gene of the ciliate Stylonychia lemnae (Alveolata; class Spirotrichea).

artículo científico publicado en 2003

Producing single-stranded DNA in polymerase chain reaction for direct genomic sequencing.

artículo científico publicado en 1993

Programmed Chromosome Deletion in the Ciliate Oxytricha trifallax

artículo científico publicado en 2019

Programmed Genome Rearrangements in the Ciliate Oxytricha

artículo científico publicado en 2014

Programmed genome rearrangements in Oxytricha produce transcriptionally active extrachromosomal circular DNA

scientific article published on 01 October 2019

RNA catalysis in frozen solutions

artículo científico publicado en 2005

RNA editing as a source of genetic variation

artículo científico publicado en 1993

RNA editing missing in mitochondria.

artículo científico publicado en 1997

RNA-Mediated Epigenetic Programming of Genome Rearrangements

artículo científico

RNA-guided DNA assembly

artículo científico publicado en 2007

RNA-mediated epigenetic programming of a genome-rearrangement pathway

artículo científico publicado en 2007

RNA-mediated epigenetic regulation of DNA copy number

artículo científico publicado en 2010

RNA-mediated genome rearrangement: hypotheses and evidence

artículo científico publicado en 2012

Reciprocal fusions of two genes in the formaldehyde detoxification pathway in ciliates and diatoms

artículo científico publicado en 2005

Recurring patterns among scrambled genes in the encrypted genome of the ciliate Oxytricha trifallax

artículo científico publicado en 2016

Reviewer acknowledgement

Rewiring the keyboard: evolvability of the genetic code

artículo científico publicado en 2001

Rewriting the information in DNA: RNA editing in kinetoplastids and myxomycetes

artículo científico publicado en 2002

Rhyme or reason: RNA-arginine interactions and the genetic code

artículo científico publicado en 1998

Russian Doll Genes and Complex Chromosome Rearrangements in Oxytricha trifallax.

artículo científico publicado en 2018

SIGAR: Inferring features of genome architecture and DNA rearrangements by split read mapping

scientific article published on 13 August 2020

SWAKK: a web server for detecting positive selection in proteins using a sliding window substitution rate analysis.

artículo científico publicado en 2006

Selection, history and chemistry: the three faces of the genetic code.

artículo científico publicado en 1999

Sequence features of Oxytricha trifallax (class Spirotrichea) macronuclear telomeric and subtelomeric sequences.

artículo científico publicado en 2004

Sequencing the Oxytricha trifallax macronuclear genome: a pilot project

artículo científico publicado en 2003

Small RNA-mediated regulation of DNA dosage in the ciliate Oxytricha

artículo científico publicado en 2017

Testing a biosynthetic theory of the genetic code: fact or artifact?

artículo científico publicado en 2000

Testing ancient RNA-protein interactions

artículo científico publicado en 1999

The Oxytricha trifallax macronuclear genome: a complex eukaryotic genome with 16,000 tiny chromosomes

artículo científico publicado en 2013

The Oxytricha trifallax mitochondrial genome

artículo científico publicado en 2011

The Physarum polycephalum Genome Reveals Extensive Use of Prokaryotic Two-Component and Metazoan-Type Tyrosine Kinase Signaling

artículo científico publicado en 2015

The RNA world on ice: a new scenario for the emergence of RNA information

artículo científico publicado en 2005

The TIM Barrel Architecture Facilitated the Early Evolution of Protein-Mediated Metabolism

artículo científico publicado en 2016

The architecture of a scrambled genome reveals massive levels of genomic rearrangement during development

artículo científico publicado en 2014

The boundaries of partially edited transcripts are not conserved in kinetoplastids: implications for the guide RNA model of editing

artículo científico publicado en 1993

The early evolution of the genetic code

artículo científico publicado en 2000

The evolution of RNA editing in kinetoplastid protozoa

artículo científico publicado el 1 de enero de 1992

The evolution of cellular computing

artículo científico publicado en 1999

The evolution of cellular computing: nature's solution to a computational problem

artículo científico publicado en 1999

The evolutionary origin of a complex scrambled gene

artículo científico publicado en 2005

The molecular basis of nuclear genetic code change in ciliates.

artículo científico publicado en 2001

The past, present and future of molecular computing

artículo científico publicado en 2000

The pathway to detangle a scrambled gene

artículo científico publicado en 2008

Thousands of RNA-cached copies of whole chromosomes are present in the ciliate Oxytricha during development

artículo científico publicado en 2017

Towards a Re-programmable DNA Computer

Towards a re-programmable DNA computer

Transcription-independent functions of an RNA polymerase II subunit, Rpb2, during genome rearrangement in the ciliate, Oxytricha trifallax.

artículo científico publicado en 2014

Transformation with Artificial Chromosomes in Oxytricha trifallax and Their Applications

artículo científico publicado en 2019

Transposon domestication versus mutualism in ciliate genome rearrangements

artículo científico publicado en 2013

Use of engineered<i>Escherichia coli</i>cells to detect estrogenicity in everyday consumer products

artículo científico publicado en 2009

What Is a Genome?

artículo científico publicado en 2016

Where Next for Genetics and Genomics?

artículo científico publicado en 2015

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