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Lista de obras de Ricard Solé

A Cultural Diffusion Model for the Rise and Fall of Programming Languages

artículo científico publicado en 2015

A Synthetic Multicellular Memory Device.

artículo científico publicado en 2016

A bottom-up characterization of transfer functions for synthetic biology designs: lessons from enzymology

artículo científico publicado en 2014

A morphospace for synthetic organs and organoids: the possible and the actual

artículo científico publicado en 2016

A synthetic microbial Daisyworld: planetary regulation in the test tube

artículo científico publicado en 2024

Abrupt transitions to tumor extinction: a phenotypic quasispecies model

artículo científico publicado en 2016

Adaptive dynamics of unstable cancer populations: The canonical equation.

artículo científico publicado en 2018

Adaptive walks in a gene network model of morphogenesis: insights into the Cambrian explosion.

artículo científico publicado en 2003

Ageing, computation and the evolution of neural regeneration processes

artículo científico publicado en 2020

An error catastrophe in cancer?

artículo científico publicado en 2004

Analytic solution of Hubbell's model of local community dynamics

artículo científico publicado en 2004

Appropriate Formulations for Dispersal in Spatially Structured Models: Reply

artículo científico publicado en 1995

Are critical phenomena relevant to large-scale evolution?

artículo científico publicado en 1996

Are network motifs the spandrels of cellular complexity?

artículo científico publicado en 2006

Are rainforests self-organized in a critical state?

Author Correction: Engineering self-organized criticality in living cells

artículo científico publicado en 2021

Avoiding transcription factor competition at promoter level increases the chances of obtaining oscillation

artículo científico publicado en 2010

Before the endless forms: embodied model of transition from single cells to aggregates to ecosystem engineering

artículo científico publicado en 2013

Bifurcations and phase transitions in spatially extended two-member hypercycles

artículo científico publicado en 2006

Bioengineering the biosphere?

artículo científico publicado en 2015

Biomass-diversity responses and spatial dependencies in disturbed tallgrass prairies

artículo científico publicado en 2002

Bioremediation at a global scale: from the test tube to planet Earth

artículo científico publicado en 2016

Can a minimal replicating construct be identified as the embodiment of cancer?

artículo científico publicado en 2014

Cancer stem cells as the engine of unstable tumor progression.

artículo científico publicado en 2008

Catastrophic shifts and lethal thresholds in a propagating front model of unstable tumor progression ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Cellular heterogeneity results from indirect effects under metabolic tradeoffs

artículo científico publicado en 2019

Chaos, Dispersal and Extinction in Coupled Ecosystems ⬇️

artículo científico publicado el 7 de agosto de 1998

Chaotic Turing structures

Chromatic transitions in the emergence of syntax networks

artículo científico publicado en 2018

Coinfection and superinfection in RNA virus populations: a selection-mutation model

artículo científico publicado en 2003

Complex discrete dynamics from simple continuous population models

artículo científico publicado en 2002

Complexity and fragility in ecological networks.

artículo científico publicado en 2001

Computational implementation of a tunable multicellular memory circuit for engineered eukaryotic consortia

artículo científico publicado en 2015

Control, synchrony and the persistence of chaotic populations

Controlling chaos in discrete neural networks

Controlling chaos in ecology: from deterministic to individual-based models

artículo científico publicado en 1999

Controlling chaos in unidimensional maps using macroevolutionary algorithms

artículo científico publicado en 2002

Cooperation in an RNA world

scientific article published on 01 October 2018

Correction to 'Punctuated equilibrium in the large-scale evolution of programming languages'.

artículo científico publicado en 2016

Corrigendum: Variability in mutational fitness effects prevents full lethal transitions in large quasispecies populations

artículo científico publicado en 2015

Criticality and scaling in evolutionary ecology

artículo científico publicado en 1999

Criticality in Pareto Optimal Grammars?

artículo científico publicado en 2020

Data completeness—the Achilles heel of drug-target networks

article by Jordi Mestres et al published September 2008 in Nature Biotechnology

Design principles of stripe-forming motifs: the role of positive feedback

artículo científico publicado en 2014

Distributed biological computation with multicellular engineered networks

artículo científico publicado en 2010

Distributed computation: the new wave of synthetic biology devices

artículo científico publicado en 2012

Distributed robustness in cellular networks: insights from synthetic evolved circuits

artículo científico publicado en 2009

Diversity, competition, extinction: the ecophysics of language change

artículo científico publicado en 2010

Dynamic signaling in the Hog1 MAPK pathway relies on high basal signal transduction.

artículo científico publicado en 2009

Ecological chaos

scientific article published in Nature

Ecological complexity and the biosphere: the next 30 years

artículo científico publicado en 2022

Ecological networks and their fragility

artículo científico publicado en 2006

Ecology: scaling laws in the drier

artículo científico publicado en 2007

Effects of habitat destruction in a prey-predator metapopulation model

artículo científico publicado en 1998

Emergence of Zipf's law in the evolution of communication

scientific article published on 28 March 2011

Emergence of multicellularity in a model of cell growth, death and aggregation under size-dependent selection ⬇️

artículo científico publicado en 2015

Emergence of proto-organisms from bistable stochastic differentiation and adhesion

artículo científico publicado en 2016

Emergent chemical behavior in variable-volume protocells.

artículo científico publicado en 2015

Engineering self-organized criticality in living cells

Evolution and self-assembly of protocells

artículo científico publicado en 2008

Evolution of Brains and Computers: The Roads Not Taken

artículo científico publicado en 2022

Evolvability of feed-forward loop architecture biases its abundance in transcription networks

artículo científico publicado en 2012

Evolving complexity: how tinkering shapes cells, software and ecological networks

artículo científico publicado en 2020

Evolving protein interaction networks through gene duplication

article

Exploiting delayed transitions to sustain semiarid ecosystems after catastrophic shifts

artículo científico publicado en 2018

Exploring the randomness of directed acyclic networks

artículo científico publicado en 2010

External morphology explains the success of biological invasions

artículo científico publicado en 2014

Extinction and self-organized criticality in a model of large-scale evolution

artículo científico publicado en 1996

Extinction: bad genes or weak chaos?

article

Extinctions and taxonomy in a trophic model of coevolution

artículo científico publicado en 2000

Field theory for a reaction-diffusion model of quasispecies dynamics

scientific article published on 24 October 2001

Gap percolation in rainforests

scholarly article by Richard V. Solé et al published July 2005 in Oikos

Gene network dynamics and the evolution of development

scientific article published on 01 December 2000

Gene networks capable of pattern formation: from induction to reaction-diffusion

artículo científico publicado en 2000

Generic Darwinian selection in catalytic protocell assemblies

artículo científico publicado en 2007

Genetic instability as a driver for immune surveillance

scientific article published on 11 December 2019

Global ecosystem thresholds driven by aridity

artículo científico publicado en 2020

Habitat Fragmentation and Extinction Thresholds in Spatially Explicit Models

article

Habitat fragmentation and biodiversity collapse in neutral communities

artículo científico publicado en 2004

How to make a synthetic multicellular computer

artículo científico publicado en 2014

Human synthetic lethal inference as potential anti-cancer target gene detection

artículo científico publicado en 2009

Implementation of Complex Biological Logic Circuits Using Spatially Distributed Multicellular Consortia

artículo científico publicado en 2016

In Silico Transitions to Multicellularity

Information catastrophe in RNA viruses through replication thresholds.

artículo científico publicado en 2005

Information theory, predictability and the emergence of complex life

artículo científico publicado en 2018

Introduction. Artificial protocells.

artículo científico publicado en 2007

Language networks: Their structure, function, and evolution

Language: syntax for free?

artículo científico publicado en 2005

Least effort and the origins of scaling in human language

artículo científico publicado en 2003

Life cycle of a minimal protocell--a dissipative particle dynamics study

artículo científico publicado en 2007

Liquid brains, solid brains.

artículo científico publicado en 2019

Local and Ensemble Dynamics of Linked Populations: Reply to Ruxton

artículo científico publicado en 1994

Mean-field stochastic theory for species-rich assembled communities

artículo científico publicado en 2000

Measuring chaos from spatial information

Measuring the hierarchy of feedforward networks

scientific article published on 01 March 2011

Metapopulation dynamics and spatial heterogeneity in cancer

artículo científico publicado en 2002

Microbial biotechnology as a tool to restore degraded drylands

artículo científico publicado en 2017

Minimal model of self-replicating nanocells: a physically embodied information-free scenario

artículo científico publicado en 2007

Model of Droplet Dynamics in the Argentine Ant Linepithema Humile(Mayr) ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2001

Modeling the effector - regulatory T cell cross-regulation reveals the intrinsic character of relapses in Multiple Sclerosis

artículo científico publicado en 2011

Modelling lipid competition dynamics in heterogeneous protocell populations ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Monomeric bistability and the role of autoloops in gene regulation

artículo científico publicado en 2009

Multiple infection dynamics has pronounced effects on the fitness of RNA viruses

article

NEURAL NETWORKS AS SOURCES OF CHAOTIC MOTOR ACTIVITY IN ANTS AND HOW COMPLEXITY DEVELOPS AT THE SOCIAL SCALE

Nested subgraphs of complex networks

Network morphospace

artículo científico

Network motifs in computational graphs: a case study in software architecture

artículo científico publicado en 2005

Network topology and self-consistency in language games

scientific article published on 04 January 2006

Neutral fitness landscapes in signalling networks.

artículo científico publicado en 2007

Neutrality and robustness in evo-devo: emergence of lateral inhibition

artículo científico publicado en 2008

Noise and periodic modulations in neural excitable media

artículo científico publicado en 1999

Nonequilibrium Entropic Bounds for Darwinian Replicators

scientific article published on 31 January 2018

Nonequilibrium dynamics in lattice ecosystems: Chaotic stability and dissipative structures

article

ON THE FRACTAL NATURE OF ECOLOGICAL AND MACROEVOLUTIONARY DYNAMICS

article

On Forest Spatial Dynamics with Gap Formation

article

On Singularities and Black Holes in Combination-Driven Models of Technological Innovation Networks

artículo científico publicado en 2016

On the basic computational structure of gene regulatory networks

artículo científico publicado en 2009

On the origins of hierarchy in complex networks

artículo científico publicado en 2013

Pattern formation and optimization in army ant raids

artículo científico publicado en 2000

Patterns in syntactic dependency networks

artículo científico publicado en 2004

Percolation in insect nest networks: evidence for optimal wiring

artículo científico publicado en 2009

Perturbations and indirect effects in complex food webs

Phase transitions in Pareto optimal complex networks ⬇️

artículo científico publicado en 2015

Phase transitions in random networks: Simple analytic determination of critical points

artículo científico publicado en 1997

Phase transitions in virology

Phenotypic and dynamical transitions in model genetic networks. I. Emergence of patterns and genotype-phenotype relationships

scientific article published on 01 March 2001

Phenotypic and dynamical transitions in model genetic networks. II. Application to the evolution of segmentation mechanisms

artículo científico publicado en 2001

Phenotypic diversity and chaos in a minimal cell model

artículo científico publicado en 2005

Population Cycles and Spatial Patterns in Snowshoe Hares: an Individual-Oriented Simulation

Population dynamics of synthetic terraformation motifs.

artículo científico publicado en 2018

Preface

Press perturbations and indirect effects in real food webs

artículo científico publicado en 2009

Protocell self-reproduction in a spatially extended metabolism-vesicle system

artículo científico publicado en 2006

Punctuated equilibrium in the large-scale evolution of programming languages

artículo científico publicado en 2015

Reciprocal specialization in ecological networks

artículo científico publicado en 2009

Recovery after mass extinction: evolutionary assembly in large-scale biosphere dynamics

artículo científico publicado en 2002

Red queen dynamics, competition and critical points in a model of RNA virus quasispecies

artículo científico publicado en 1999

Replication mode and landscape topology differentially affect RNA virus mutational load and robustness

artículo científico publicado en 2009

Reply from J. Bascompte and R.V. Sole

artículo científico publicado en 1995

Reply from R.V. Solé, S.C. Manrubia, M.J. Benton, S. Kauffman and P. Bak

artículo científico publicado en 1999

Rethinking complexity: modelling spatiotemporal dynamics in ecology.

artículo científico publicado en 1995

Robustness of the European power grids under intentional attack

artículo científico publicado en 2008

Scaling in a network model of a multispecies ecosystem

Self-Organization Patterns in Wasp and Open Source Communities

artículo científico publicado en 2006

Self-organization versus hierarchy in open-source social networks

artículo científico publicado en 2007

Self-organized criticality in Monte Carlo simulated ecosystems

Self-organized criticality in rainforest dynamics

Self-organized instability in complex ecosystems.

artículo científico publicado en 2002

Self-similarity in rain forests: Evidence for a critical state

article

Self-similarity of extinction statistics in the fossil record

scientific article published in Nature

Self-synchronization and task fulfilment in ant colonies

artículo científico publicado en 2000

Simple genomes, complex interactions: epistasis in RNA virus

artículo científico publicado en 2010

Simple model of recovery dynamics after mass extinction

article

Simple quasispecies models for the survival-of-the-flattest effect: The role of space

artículo científico publicado en 2007

Spatial dynamics of synthetic microbial mutualists and their parasites

artículo científico publicado en 2017

Spatial patterns in ant colonies.

artículo científico publicado en 2002

Spatial self-organization in hybrid models of multicellular adhesion ⬇️

artículo científico publicado en 2016

Spatially Induced Bifurcations in Single-Species Population Dynamics

article

Spatially induced nestedness in a neutral model of phage-bacteria networks

artículo científico publicado en 2017

Spatiotemporal patterns in nature

artículo científico publicado en 1998

Specialized or flexible feed-forward loop motifs: a question of topology

artículo científico publicado en 2009

Spiral waves, chaos and multiple attractors in lattice models of interacting populations

Spontaneous emergence of modularity in cellular networks

artículo científico publicado en 2008

Stability and complexity of spatially extended two-species competition

article

Statistical physics of liquid brains

scientific article published on 01 June 2019

Superdiffusion and encounter rates in diluted, low dimensional worlds

Synthetic Biology for Terraformation Lessons from Mars, Earth, and the Microbiome

artículo científico publicado en 2020

Synthetic Lateral Inhibition in Periodic Pattern Forming Microbial Colonies

artículo científico publicado en 2021

Synthetic Turing protocells: vesicle self-reproduction through symmetry-breaking instabilities

artículo científico publicado en 2007

Synthetic associative learning in engineered multicellular consortia.

artículo científico publicado en 2017

Synthetic biology: Biocircuits in synchrony

artículo científico publicado en 2014

Synthetic circuit designs for earth terraformation

artículo científico publicado en 2015

Synthetic collective intelligence.

artículo científico publicado en 2016

Synthetic criticality in cellular brains

artículo científico publicado en 2021

Synthetic protocell biology: from reproduction to computation

artículo científico publicado en 2007

Synthetic soil crusts against green-desert transitions: a spatial model

scientific article published on 26 August 2020

Synthetic transitions: towards a new synthesis

artículo científico publicado en 2016

Task partitioning in a ponerine ant.

artículo científico publicado en 2002

Tempo and mode of plant RNA virus escape from RNA interference-mediated resistance

artículo científico publicado en 2011

The DivGame Simulator: a stochastic cellular automata model of rainforest dynamics

article

The architecture of mutualistic networks as an evolutionary spandrel.

artículo científico publicado en 2017

The causes of epistasis in genetic networks

artículo científico publicado en 2011

The ecology of cancer differentiation therapy

scientific article published on 09 December 2020

The fittest versus the flattest: experimental confirmation of the quasispecies effect with subviral pathogens.

artículo científico publicado en 2006

The major synthetic evolutionary transitions

artículo científico publicado en 2016

The morphospace of language networks.

artículo científico publicado en 2018

The small world of human language ⬇️

artículo científico publicado el 7 de noviembre de 2001

The topology of drug-target interaction networks: implicit dependence on drug properties and target families

artículo científico publicado en 2009

Topological patterns in street networks of self-organized urban settlements

Topological properties of food webs: from real data to community assembly models

article by Jose M. Montoya & Richard V. Solé published September 2003 in Oikos

Topology and evolution of technology innovation networks

scientific article published on 28 November 2007

Topology of technology graphs: Small world patterns in electronic circuits ⬇️

artículo científico publicado el 24 de septiembre de 2001

Topology, tinkering and evolution of the human transcription factor network

artículo científico publicado en 2005

Toward Synthetic Spatial Patterns in Engineered Cell Populations with Chemotaxis

artículo científico publicado en 2016

Towards a mathematical theory of meaningful communication.

artículo científico publicado en 2014

Tumour neoantigen heterogeneity thresholds provide a time window for combination immunotherapy

artículo científico publicado en 2020

Ultrasound approach tracks gut microbes

artículo científico publicado en 2018

Universality of Zipf's law.

artículo científico publicado en 2010

Using information theory to decode network coevolution

artículo científico publicado en 2020

Variability in mutational fitness effects prevents full lethal transitions in large quasispecies populations

artículo científico publicado en 2014

When metabolism meets topology: Reconciling metabolite and reaction networks

artículo científico publicado en 2010

Why are cellular switches Boolean? General conditions for multistable genetic circuits

artículo científico publicado en 2009

Zipf's Law, unbounded complexity and open-ended evolution

scientific article published on 01 December 2018

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