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Lista de obras de Xiaodong Zhang

A link between sequence conservation and domain motion within the AAA+ family

artículo científico publicado en 2004

A new labeling method for methyl transverse relaxation-optimized spectroscopy NMR spectra of alanine residues

artículo científico publicado en 2007

A structural and dynamic model for the assembly of Replication Protein A on single-stranded DNA

scientific article published in Nature Communications

ATP-dependent transcriptional activation by bacterial PspF AAA+protein.

artículo científico publicado en 2004

Activity map of the Escherichia coli RNA polymerase bridge helix

artículo científico publicado en 2011

Analysis of nucleotide binding to P97 reveals the properties of a tandem AAA hexameric ATPase

scientific journal article

Automated assignment in selectively methyl-labeled proteins.

artículo científico publicado en 2009

BRCT domain interactions in the heterodimeric DNA repair protein XRCC1-DNA ligase III

artículo científico publicado en 2001

Bacterial enhancer-binding proteins: unlocking sigma54-dependent gene transcription

artículo científico publicado en 2006

Biological microscopy and soft X-ray optics at Stony Brook

artículo científico publicado en 1996

Chemical contrast in X-ray microscopy and spatially resolved XANES spectroscopy of organic specimens

artículo científico publicado el 6 de noviembre de 1992

Conformational changes in the AAA ATPase p97-p47 adaptor complex

artículo científico publicado en 2006

Coupling AAA protein function to regulated gene expression

artículo científico

Coupling nucleotide hydrolysis to transcription activation performance in a bacterial enhancer binding protein.

artículo científico publicado en 2007

Coupling sigma factor conformation to RNA polymerase reorganisation for DNA melting

artículo científico publicado en 2009

Crosstalk within a functional INO80 complex dimer regulates nucleosome sliding

artículo científico publicado en 2017

Cryo-EM structures of the human INO80 chromatin-remodeling complex

artículo científico publicado en 2017

Crystal Structures of Multidrug Binding Protein TtgR in Complex with Antibiotics and Plant Antimicrobials

artículo científico publicado en 2007

Crystal structure of MexZ, a key repressor responsible for antibiotic resistance in Pseudomonas aeruginosa

artículo científico publicado en 2010

Crystal structure of TtgV in complex with its DNA operator reveals a general model for cooperative DNA binding of tetrameric gene regulators

artículo científico publicado en 2010

Detailed structural insights into the p97-Npl4-Ufd1 interface

artículo científico publicado en 2007

Diffraction-limited imaging in a scanning transmission x-ray microscope

artículo científico publicado en 1991

Dissecting the ATP hydrolysis pathway of bacterial enhancer-binding proteins

artículo científico publicado en 2008

Distinct conformations of the protein complex p97-Ufd1-Npl4 revealed by electron cryomicroscopy

artículo científico publicado en 2012

Domain Cross-talk during Effector Binding to the Multidrug Binding TTGR Regulator

artículo científico publicado en 2010

Domain movements of the enhancer-dependent sigma factor drive DNA delivery into the RNA polymerase active site: insights from single molecule studies ⬇️

scientific article published on 19 February 2014

Essential roles of three enhancer sites in sigma54-dependent transcription by the nitric oxide sensing regulatory protein NorR.

artículo científico publicado en 2009

Exposure strategies for polymethyl methacrylate from in situ x-ray absorption near edge structure spectroscopy

artículo científico publicado en 1995

Foot-and-mouth disease virus 2C is a hexameric AAA+ protein with a coordinated ATP hydrolysis mechanism

artículo científico publicado en 2010

From signal perception to signal transduction: ligand-induced dimeric switch of DctB sensory domain in solution

artículo científico publicado en 2010

Functional roles of the pre-sensor I insertion sequence in an AAA+ bacterial enhancer binding protein

artículo científico publicado en 2009

Going through the motions: The ATPase cycle of p97

artículo científico publicado en 2006

IHF-binding sites inhibit DNA loop formation and transcription initiation

scientific article published on 24 April 2009

Insights into adaptor binding to the AAA protein p97.

artículo científico publicado en 2008

Inter-ring rotations of AAA ATPase p97 revealed by electron cryomicroscopy.

artículo científico

Interactions between the nucleosome histone core and Arp8 in the INO80 chromatin remodeling complex

artículo científico publicado en 2012

Intramolecular signal transmission in a tetrameric repressor of the IclR family

artículo científico publicado en 2011

Letter to the Editor: Complete Backbone Resonance Assignments of p47: The 41kDa Adaptor Protein of the AAA ATPase p97

artículo científico publicado en 2004

Machinery of protein folding and unfolding

artículo científico publicado en 2002

Mapping and measuring DNA to protein ratios in mammalian sperm head by XANES imaging.

artículo científico publicado en 1996

Mechanism of auto-inhibition and activation of Mec1ATR checkpoint kinase

scientific article published on 09 November 2020

Mechanism of homotropic control to coordinate hydrolysis in a hexameric AAA+ ring ATPase

artículo científico publicado en 2008

Mechanisms for activating bacterial RNA polymerase

artículo científico publicado en 2010

Mechanisms of ATPases--a multi-disciplinary approach

artículo científico publicado en 2004

Mechanochemical ATPases and transcriptional activation.

artículo científico publicado en 2002

Micro-XANES: Chemical contrast in the scanning transmission X-ray microscope

artículo científico publicado en 1994

Modus operandi of the bacterial RNA polymerase containing the sigma54 promoter-specificity factor

artículo científico publicado en 2008

Molecular basis of nucleotide-dependent substrate engagement and remodeling by an AAA+ activator

artículo científico publicado en 2014

Motions and negative cooperativity between p97 domains revealed by cryo-electron microscopy and quantised elastic deformational model

artículo científico publicado en 2003

Mutational analysis of dimeric linkers in peri- and cytoplasmic domains of histidine kinase DctB reveals their functional roles in signal transduction.

artículo científico publicado en 2014

New results in soft X-ray microscopy

artículo científico publicado en 1994

Nitric oxide-responsive interdomain regulation targets the σ54-interaction surface in the enhancer binding protein NorR

artículo científico publicado en 2010

Organization of an activator-bound RNA polymerase holoenzyme

artículo científico publicado en 2008

PhhR binds to target sequences at different distances with respect to RNA polymerase in order to activate transcription

artículo científico publicado en 2009

RNA polymerase and transcription elongation factor Spt4/5 complex structure

artículo científico publicado en 2010

Regulation of p97 in the ubiquitin-proteasome system by the UBX protein-family.

artículo científico

Sigma54-dependent transcription activator phage shock protein F of Escherichia coli: a fragmentation approach to identify sequences that contribute to self-association

artículo científico publicado en 2004

Soft x‐ray microscopy with coherent x rays (invited)

artículo científico publicado en 1992

Solution structure and interaction surface of the C-terminal domain from p47: a major p97-cofactor involved in SNARE disassembly

artículo científico publicado en 2001

Structural and functional implications of phosphorylation and acetylation in the regulation of the AAA+ protein p97.

scientific article published on February 2010

Structural basis of the interaction between the AAA ATPase p97/VCP and its adaptor protein p47

scientific journal article

Structural basis of the nucleotide driven conformational changes in the AAA+ domain of transcription activator PspF.

artículo científico publicado en 2006

Structural basis of transcription inhibition by the DNA mimic protein Ocr of bacteriophage T7

scientific article published on 10 February 2020

Structural insights into the activity of enhancer-binding proteins.

artículo científico publicado en 2005

Structural insights into the p97-Ufd1-Npl4 complex.

artículo científico publicado en 2007

Structure and mechanism of action of the BRCA2 breast cancer tumor suppressor

artículo científico publicado en 2014

Structure of an XRCC1 BRCT domain: a new protein-protein interaction module

artículo científico publicado en 1998

Structure of the AAA ATPase p97

artículo científico publicado en 2000

Structure of the haemagglutinin-esterase-fusion glycoprotein of influenza C virus

artículo científico publicado en 1998

Structure of the whole cytosolic region of ATP-dependent protease FtsH.

artículo científico publicado en 2006

Structure, dynamics and interactions of p47, a major adaptor of the AAA ATPase, p97.

artículo científico publicado en 2004

Structure-based mechanism of lipoteichoic acid synthesis by Staphylococcus aureus LtaS

artículo científico publicado en 2009

Structures and organisation of AAA+ enhancer binding proteins in transcriptional activation

artículo científico publicado en 2006

The 'glutamate switch' provides a link between ATPase activity and ligand binding in AAA+ proteins

artículo científico publicado en 2008

The ATP hydrolyzing transcription activator phage shock protein F of Escherichia coli: identifying a surface that binds sigma 54.

artículo científico publicado en 2003

The BRCA1 C-terminal domain: structure and function.

artículo científico publicado en 2000

The TetR family of transcriptional repressors.

artículo científico publicado en 2005

The crystal structure of murine p97/VCP at 3.6A

artículo científico publicado en 2003

The localization and phosphorylation of p47 are important for Golgi disassembly-assembly during the cell cycle

artículo científico publicado en 2003

The multidrug efflux regulator TtgV recognizes a wide range of structurally different effectors in solution and complexed with target DNA: evidence from isothermal titration calorimetry

artículo científico publicado en 2005

The p97-FAF1 protein complex reveals a common mode of p97 adaptor binding

artículo científico publicado en 2014

The role of the N-domain in the ATPase activity of the mammalian AAA ATPase p97/VCP.

artículo científico publicado en 2012

Transcriptional control of the main aromatic hydrocarbon efflux pump in Pseudomonas

artículo científico publicado en 2011

Transcriptional regulation by the dedicated nitric oxide sensor, NorR: a route towards NO detoxification

artículo científico publicado en 2011

Trapping of a Transcription Complex Using a New Nucleotide Analogue: AMP Aluminium Fluoride

artículo científico publicado en 2008

TtgV bound to a complex operator site represses transcription of the promoter for the multidrug and solvent extrusion TtgGHI pump.

artículo científico publicado en 2004

TtgV represses two different promoters by recognizing different sequences

artículo científico publicado en 2008

VCIP135, a novel essential factor for p97/p47-mediated membrane fusion, is required for Golgi and ER assembly in vivo

artículo científico publicado en 2002

Visualizing the organization and reorganization of transcription complexes for gene expression.

artículo científico publicado en 2008

X-ray crystallographic determination of the structure of the influenza C virus haemagglutinin-esterase-fusion glycoprotein

artículo científico publicado en 1999

p37 is a p97 adaptor required for Golgi and ER biogenesis in interphase and at the end of mitosis

artículo científico publicado en 2006

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