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Lista de obras de Marina Rodnina

A Common Structural Motif in Elongation Factor Ts and Ribosomal Protein L7/12 May Be Involved in the Interaction with Elongation Factor Tu

scientific article published on 01 February 2001

A kinetic safety gate controlling the delivery of unnatural amino acids to the ribosome

artículo científico publicado en 2013

A uniform response to mismatches in codon-anticodon complexes ensures ribosomal fidelity

artículo científico publicado en 2006

ATPase Strongly Bound to Higher Eukaryotic Ribosomes

artículo científico publicado en 1994

Active role of elongation factor G in maintaining the mRNA reading frame during translation

scientific article published on 20 December 2019

Activities of the peptidyl transferase center of ribosomes lacking protein L27.

artículo científico publicado en 2015

Amicoumacin a inhibits translation by stabilizing mRNA interaction with the ribosome

artículo científico publicado en 2014

Aminoacyl-tRNA-charged eukaryotic elongation factor 1A is the bona fide substrate for Legionella pneumophila effector glucosyltransferases

artículo científico publicado en 2011

An antimicrobial peptide that inhibits translation by trapping release factors on the ribosome.

artículo científico publicado en 2017

An elongation factor G-induced ribosome rearrangement precedes tRNA-mRNA translocation

artículo científico publicado en 2003

An uncharged amine in the transition state of the ribosomal peptidyl transfer reaction

artículo científico publicado en 2008

Arginines 29 and 59 of elongation factor G are important for GTP hydrolysis or translocation on the ribosome

artículo científico publicado en 2000

Arrangement of tRNAs in pre- and posttranslocational ribosomes revealed by electron cryomicroscopy

artículo científico publicado en 1997

Biochemistry. Translocation in action

artículo científico publicado en 2013

Broad range of missense error frequencies in cellular proteins

Changed in translation: mRNA recoding by -1 programmed ribosomal frameshifting

artículo científico

Choreography of molecular movements during ribosome progression along mRNA.

artículo científico publicado en 2016

Co-Translational Folding Trajectory of the HemK Helical Domain

artículo científico publicado en 2018

Co-translational insertion and topogenesis of bacterial membrane proteins monitored in real time

scientific article published on 20 April 2020

Co-translational protein folding: progress and methods

artículo científico publicado en 2016

Codon Reading by tRNAAla with Modified Uridine in the Wobble Position

artículo científico publicado en 2007

Codon-dependent conformational change of elongation factor Tu preceding GTP hydrolysis on the ribosome.

artículo científico publicado en 1995

Colicin E3 cleavage of 16S rRNA impairs decoding and accelerates tRNA translocation on Escherichia coli ribosomes

artículo científico publicado en 2008

Colicins and their potential in cancer treatment

artículo científico publicado en 2006

Complete kinetic mechanism of elongation factor Tu-dependent binding of aminoacyl-tRNA to the A site of the E. coli ribosome

artículo científico publicado en 1998

Conditional Switch between Frameshifting Regimes upon Translation of dnaX mRNA.

artículo científico publicado en 2017

Conformation of 4.5S RNA in the signal recognition particle and on the 30S ribosomal subunit

artículo científico publicado en 2005

Conformation of the signal recognition particle in ribosomal targeting complexes

artículo científico publicado en 2008

Conformational changes in the bacterial SRP receptor FtsY upon binding of guanine nucleotides and SRP.

artículo científico publicado en 2000

Conformational changes of the small ribosomal subunit during elongation factor G-dependent tRNA-mRNA translocation

artículo científico publicado en 2004

Conformational switch in the decoding region of 16S rRNA during aminoacyl-tRNA selection on the ribosome.

artículo científico publicado en 2000

Conformationally Restricted Elongation Factor G Retains GTPase Activity but Is Inactive in Translocation on the Ribosome

artículo científico publicado en 2000

Conformations of the signal recognition particle protein Ffh from Escherichia coli as determined by FRET.

artículo científico publicado en 2005

Conservation of bacterial protein synthesis machinery: initiation and elongation in Mycobacterium smegmatis

artículo científico publicado en 2008

Contacts of elongation factor G with the small ribosomal subunit: cross-linking approach

artículo científico publicado en 2003

Control of phosphate release from elongation factor G by ribosomal protein L7/12.

artículo científico publicado en 2005

Cotranslational Folding of Proteins on the Ribosome

scientific article published on 07 January 2020

Cotranslational protein folding on the ribosome monitored in real time.

artículo científico publicado en 2015

Coupling of GTP hydrolysis by elongation factor G to translocation and factor recycling on the ribosome

artículo científico publicado en 2002

Decomposition of time-dependent fluorescence signals reveals codon-specific kinetics of protein synthesis

Decomposition of time-dependent fluorescence signals reveals codon-specific kinetics of protein synthesis

scientific article published on 01 December 2018

Deducing the kinetics of protein synthesis in vivo from the transition rates measured in vitro

artículo científico publicado en 2014

Delayed release of inorganic phosphate from elongation factor Tu following GTP hydrolysis on the ribosome

artículo científico publicado en 2006

Different substrate-dependent transition states in the active site of the ribosome.

artículo científico publicado en 2011

Directional transition from initiation to elongation in bacterial translation.

artículo científico publicado en 2015

Distinct functions of elongation factor G in ribosome recycling and translocation

artículo científico publicado en 2009

Distortion of tRNA upon near-cognate codon recognition on the ribosome

artículo científico publicado en 2011

Domain rearrangement of SRP protein Ffh upon binding 4.5S RNA and the SRP receptor FtsY

artículo científico publicado en 2005

Dual use of GTP hydrolysis by elongation factor G on the ribosome

artículo científico publicado en 2013

Dynamic switch of the signal recognition particle from scanning to targeting.

artículo científico publicado en 2012

Dynamics of ribosomes and release factors during translation termination in E. coli.

artículo científico publicado en 2018

EF-G-induced ribosome sliding along the noncoding mRNA.

artículo científico publicado en 2019

EF-P is essential for rapid synthesis of proteins containing consecutive proline residues

artículo científico publicado en 2012

Effect of Fusidic Acid on the Kinetics of Molecular Motions During EF-G-Induced Translocation on the Ribosome.

artículo científico publicado en 2017

Elongation factor G-induced structural change in helix 34 of 16S rRNA related to translocation on the ribosome ⬇️

artículo científico publicado el 1 de diciembre de 2001

Elongation factor P: Function and effects on bacterial fitness

artículo científico publicado en 2013

Elongation factor Tu, a GTPase triggered by codon recognition on the ribosome: mechanism and GTP consumption

artículo científico publicado en 1995

Energetic contribution of tRNA hybrid state formation to translocation catalysis on the ribosome.

artículo científico publicado en 2000

Energy barriers and driving forces in tRNA translocation through the ribosome

artículo científico publicado en 2013

Entropic Contribution of Elongation Factor P to Proline Positioning at the Catalytic Center of the Ribosome

artículo científico publicado en 2015

Essential mechanisms in the catalysis of peptide bond formation on the ribosome.

artículo científico publicado en 2005

Essential role of histidine 84 in elongation factor Tu for the chemical step of GTP hydrolysis on the ribosome

artículo científico publicado en 2003

Essential structural elements in tRNA(Pro) for EF-P-mediated alleviation of translation stalling

artículo científico publicado en 2016

Evolution of the protein stoichiometry in the L12 stalk of bacterial and organellar ribosomes

artículo científico publicado en 2013

Evolutionary optimization of speed and accuracy of decoding on the ribosome

artículo científico publicado en 2011

Exploration of the conserved A+C wobble pair within the ribosomal peptidyl transferase center using affinity purified mutant ribosomes

artículo científico publicado en 2004

Fluctuations between multiple EF-G-induced chimeric tRNA states during translocation on the ribosome

artículo científico publicado en 2015

Form follows function: structure of an elongation factor G-ribosome complex

artículo científico publicado en 1998

GTP hydrolysis by EF-G synchronizes tRNA movement on small and large ribosomal subunits

artículo científico publicado en 2014

GTPase activation of elongation factors Tu and G on the ribosome

artículo científico publicado en 2002

GTPases of translational apparatus

artículo científico publicado en 2005

Gradual compaction of the nascent peptide during cotranslational folding on the ribosome

artículo científico publicado en 2020

High-efficiency translational bypassing of non-coding nucleotides specified by mRNA structure and nascent peptide

artículo científico publicado en 2014

How ribosomes make peptide bonds

artículo científico publicado en 2006

Impact of methylations of m2G966/m5C967 in 16S rRNA on bacterial fitness and translation initiation

artículo científico publicado en 2012

Importance of tRNA interactions with 23S rRNA for peptide bond formation on the ribosome: studies with substrate analogs

artículo científico publicado en 2007

Important contribution to catalysis of peptide bond formation by a single ionizing group within the ribosome.

artículo científico publicado en 2002

Important role of the tetraloop region of 4.5S RNA in SRP binding to its receptor FtsY.

artículo científico publicado en 2001

Inactivation of the elongation factor Tu by mosquitocidal toxin-catalyzed mono-ADP-ribosylation

artículo científico publicado en 2002

Induced fit in initial selection and proofreading of aminoacyl-tRNA on the ribosome

artículo científico publicado en 1999

Initial binding of the elongation factor Tu.GTP.aminoacyl-tRNA complex preceding codon recognition on the ribosome.

artículo científico publicado en 1996

Interaction of Guanine Nucleotides with the Signal Recognition Particle from Escherichia coli ⬇️

artículo científico publicado el 3 de noviembre de 1998

Interaction of helix D of elongation factor Tu with helices 4 and 5 of protein L7/12 on the ribosome

artículo científico publicado en 2004

Interaction of tRNA with the A and P sites of rabbit-liver 80S ribosomes and their 40S subunits

artículo científico publicado en 1989

Involvement of helix 34 of 16 S rRNA in decoding and translocation on the ribosome.

artículo científico publicado en 2006

Kinetic Analysis of Interaction of Eukaryotic Release Factor 3 with Guanine Nucleotides

scientific article published in Journal of Biological Chemistry

Kinetic Checkpoint at a Late Step in Translation Initiation

artículo científico publicado en 2008

Kinetic control of translation initiation in bacteria ⬇️

artículo científico publicado el 19 de abril de 2012

Kinetic determinants of high-fidelity tRNA discrimination on the ribosome

artículo científico publicado en 2004

Kinetic mechanism of elongation factor Ts-catalyzed nucleotide exchange in elongation factor Tu.

artículo científico publicado en 2002

Kinetics of Spontaneous and EF-G-Accelerated Rotation of Ribosomal Subunits

artículo científico publicado en 2016

Kinetics of the interactions between yeast elongation factors 1A and 1Balpha, guanine nucleotides, and aminoacyl-tRNA.

artículo científico publicado en 2007

Large-scale movement of elongation factor G and extensive conformational change of the ribosome during translocation

artículo científico publicado en 2000

Late events of translation initiation in bacteria: a kinetic analysis

artículo científico publicado en 2000

Lateral gate dynamics of the bacterial translocon during cotranslational membrane protein insertion

artículo científico publicado en 2021

Lateral opening of the bacterial translocon on ribosome binding and signal peptide insertion

artículo científico publicado en 2014

Long-range signalling in activation of the translational GTPase EF-Tu

artículo científico publicado en 2009

Major reorientation of tRNA substrates defines specificity of dihydrouridine synthases

artículo científico publicado en 2015

Mechanism of EF-Ts-Catalyzed Guanine Nucleotide Exchange in EF-Tu: Contribution of Interactions Mediated by Helix B of EF-Tu†

artículo científico publicado en 2007

Mechanism of elongation factor (EF)-Ts-catalyzed nucleotide exchange in EF-Tu. Contribution of contacts at the guanine base

artículo científico publicado en 2001

Mechanism of elongation factor G function in tRNA translocation on the ribosome.

artículo científico publicado en 2001

Mechanism of peptide bond formation on the ribosome

artículo científico publicado en 2006

Mechanism of ribosome rescue by alternative ribosome-rescue factor B

artículo científico publicado en 2020

Mechanism of tRNA translocation on the ribosome

artículo científico publicado en 2001

Modulation of the rate of peptidyl transfer on the ribosome by the nature of substrates

artículo científico publicado en 2008

Mutations at the accommodation gate of the ribosome impair RF2-dependent translation termination

artículo científico publicado en 2010

NSUN3 and ABH1 modify the wobble position of mt-tRNAMet to expand codon recognition in mitochondrial translation

scientific journal article

Non-canonical Binding Site for Bacterial Initiation Factor 3 on the Large Ribosomal Subunit

artículo científico publicado en 2017

Number of tRNA binding sites on 80 S ribosomes and their subunits

artículo científico publicado en 1988

Optimization of speed and accuracy of decoding in translation

artículo científico publicado en 2010

Partitioning between recoding and termination at a stop codon-selenocysteine insertion sequence

artículo científico publicado en 2015

Peptide bond formation does not involve acid-base catalysis by ribosomal residues

scientific article published on 30 April 2006

Peptide bond formation on the ribosome: structure and mechanism

artículo científico publicado en 2003

Programmed -1 frameshifting by kinetic partitioning during impeded translocation

artículo científico publicado en 2014

Protein Elongation, Co-translational Folding and Targeting

artículo científico publicado en 2016

Protein synthesis meets ABC ATPases: new roles for Rli1/ABCE1.

artículo científico publicado en 2010

Purification of fMet-tRNA(fMet) by fast protein liquid chromatography.

artículo científico publicado en 1994

Purine bases at position 37 of tRNA stabilize codon-anticodon interaction in the ribosomal A site by stacking and Mg2+-dependent interactions

artículo científico publicado en 2004

Quality control of mRNA decoding on the bacterial ribosome

artículo científico publicado el 1 de enero de 2012

Rapid peptide bond formation on isolated 50S ribosomal subunits

artículo científico publicado en 2006

Real-time assembly landscape of bacterial 30S translation initiation complex.

artículo científico publicado en 2012

Recent mechanistic insights into eukaryotic ribosomes

artículo científico publicado en 2009

Recognition and selection of tRNA in translation

artículo científico publicado en 2005

Review: Translational GTPases

artículo científico publicado en 2016

Ribosomal RNA is the target for oxazolidinones, a novel class of translational inhibitors

artículo científico publicado en 1999

Ribosome clearance by FusB-type proteins mediates resistance to the antibiotic fusidic acid

artículo científico publicado en 2012

Ribosome dynamics and tRNA movement by time-resolved electron cryomicroscopy

artículo científico publicado en 2010

Ribosome dynamics during decoding

scientific article published on March 2017

Ribosome interactions of aminoacyl-tRNA and elongation factor Tu in the codon-recognition complex

artículo científico publicado en 2002

Ribosome rearrangements at the onset of translational bypassing

artículo científico publicado en 2017

Ribosome-bound Get4/5 facilitates the capture of tail-anchored proteins by Sgt2 in yeast

scientific article published on 04 February 2021

Ribosome-induced tuning of GTP hydrolysis by a translational GTPase

artículo científico publicado en 2014

Role and timing of GTP binding and hydrolysis during EF-G-dependent tRNA translocation on the ribosome

artículo científico publicado en 2006

Role of Domains 4 and 5 in Elongation Factor G Functions on the Ribosome

artículo científico publicado en 2000

Sequence of steps in ribosome recycling as defined by kinetic analysis.

artículo científico publicado en 2005

Signal recognition particle binds to translating ribosomes before emergence of a signal anchor sequence

artículo científico publicado en 2017

Signal sequence-independent membrane targeting of ribosomes containing short nascent peptides within the exit tunnel

artículo científico publicado en 2008

Single-step purification of specific tRNAs by hydrophobic tagging.

artículo científico publicado en 2006

Site-directed mutagenesis of Thermus thermophilus elongation factor Tu. Replacement of His85, Asp81 and Arg300.

artículo científico

Small synthetic molecule-stabilized RNA pseudoknot as an activator for -1 ribosomal frameshifting

Spontaneous reverse movement of mRNA-bound tRNA through the ribosome

artículo científico publicado en 2007

Stimulation of the GTPase Activity of Translation Elongation Factor G by Ribosomal Protein L7/12

scientific article published in Journal of Biological Chemistry

Streptomycin interferes with conformational coupling between codon recognition and GTPase activation on the ribosome.

artículo científico publicado en 2004

Structural and functional investigation of a putative archaeal selenocysteine synthase

artículo científico publicado en 2005

Structural basis for the function of the ribosomal L7/12 stalk in factor binding and GTPase activation

artículo científico publicado en 2005

Structural basis for the inhibition of the eukaryotic ribosome

artículo científico publicado en 2014

Structural dynamics of ribosomal RNA during decoding on the ribosome

artículo científico publicado en 2002

Structural mechanism of GTPase-powered ribosome-tRNA movement

artículo científico publicado en 2021

Structure of ratcheted ribosomes with tRNAs in hybrid states

artículo científico publicado en 2008

Structure of the E. coli ribosome-EF-Tu complex at <3 Å resolution by Cs-corrected cryo-EM

artículo científico publicado en 2015

Synchronous tRNA movements during translocation on the ribosome are orchestrated by elongation factor G and GTP hydrolysis

artículo científico publicado en 2014

Synonymous Codons Direct Cotranslational Folding toward Different Protein Conformations

artículo científico publicado en 2016

Ten remarks on peptide bond formation on the ribosome.

artículo científico publicado en 2005

The "allosteric three-site model" of elongation cannot be confirmed in a well-defined ribosome system from Escherichia coli

artículo científico publicado en 1996

The Cryo-EM structure of a complete 30S translation initiation complex from Escherichia coli

artículo científico publicado en 2011

The G222D mutation in elongation factor Tu inhibits the codon-induced conformational changes leading to GTPase activation on the ribosome

artículo científico publicado en 1996

The G2447A mutation does not affect ionization of a ribosomal group taking part in peptide bond formation

artículo científico publicado en 2003

The crystal structure of unmodified tRNAPhe from Escherichia coli

artículo científico publicado en 2010

The importance of P-loop and domain movements in EF-Tu for guanine nucleotide exchange.

artículo científico publicado en 2006

The importance of structural transitions of the switch II region for the functions of elongation factor Tu on the ribosome

artículo científico publicado en 2001

The ins and outs of translation

artículo científico publicado en 2007

The nucleotide-binding site of bacterial translation initiation factor 2 (IF2) as a metabolic sensor

artículo científico publicado en 2006

The pathway to GTPase activation of elongation factor SelB on the ribosome

artículo científico publicado en 2016

The ribosomal peptidyl transferase

artículo científico publicado en 2007

The ribosome as a molecular machine: the mechanism of tRNA–mRNA movement in translocation ⬇️

artículo científico publicado el 1 de abril de 2011

The ribosome as a versatile catalyst: reactions at the peptidyl transferase center ⬇️

artículo científico publicado el 24 de mayo de 2013

The ribosome as an entropy trap

artículo científico publicado en 2004

The ribosome goes Nobel

artículo científico publicado en 2010

The ribosome in action: Tuning of translational efficiency and protein folding

artículo científico publicado en 2016

The ribosome's response to codon-anticodon mismatches.

artículo científico publicado en 2006

The ribosome-bound initiation factor 2 recruits initiator tRNA to the 30S initiation complex

artículo científico publicado en 2010

The signal recognition particle binds to protein L23 at the peptide exit of the Escherichia coli ribosome

artículo científico publicado en 2003

Thermodynamic and kinetic framework of selenocysteyl-tRNASec recognition by elongation factor SelB

artículo científico publicado en 2009

Thermodynamic control of -1 programmed ribosomal frameshifting

artículo científico publicado en 2019

Thermodynamics of the GTP-GDP-operated Conformational Switch of Selenocysteine-specific Translation Factor SelB ⬇️

artículo científico publicado el 27 de junio de 2012

Thio-Modification of tRNA at the Wobble Position as Regulator of the Kinetics of Decoding and Translocation on the Ribosome

artículo científico publicado en 2017

Thiostrepton inhibits the turnover but not the GTPase of elongation factor G on the ribosome.

artículo científico publicado en 1999

Timing of GTP binding and hydrolysis by translation termination factor RF3.

artículo científico publicado en 2013

Towards understanding selenocysteine incorporation into bacterial proteins

artículo científico publicado en 2007

Transient conformational states of aminoacyl-tRNA during ribosome binding catalyzed by elongation factor Tu.

artículo científico publicado en 1994

Transient kinetics, fluorescence, and FRET in studies of initiation of translation in bacteria

artículo científico publicado en 2007

Translation error clusters induced by aminoglycoside antibiotics

artículo científico publicado en 2021

Translation in Prokaryotes

artículo científico publicado en 2018

Translation initiation in bacterial polysomes through ribosome loading on a standby site on a highly translated mRNA.

artículo científico publicado en 2018

Translational elongation factor G: a GTP-driven motor of the ribosome.

artículo científico publicado en 2000

Translocation as continuous movement through the ribosome

artículo científico publicado en 2016

Trigger factor binds to ribosome-signal-recognition particle (SRP) complexes and is excluded by binding of the SRP receptor

artículo científico publicado en 2004

Two tRNA-binding sites in addition to A and P sites on eukaryotic ribosomes

artículo científico publicado en 1992

Visualization of elongation factor Tu on the Escherichia coli ribosome.

artículo científico publicado en 1997

Visualization of translation termination intermediates trapped by the Apidaecin 137 peptide during RF3-mediated recycling of RF1

artículo científico publicado en 2018

Visualizing the protein synthesis machinery: new focus on the translational GTPase elongation factor Tu

scholarly article

Yeast translation elongation factor eEF3 promotes late stages of tRNA translocation

artículo científico publicado en 2021

tRNA tKUUU, tQUUG, and tEUUC wobble position modifications fine-tune protein translation by promoting ribosome A-site binding.

artículo científico publicado en 2013

tRNA wobble modifications and protein homeostasis

artículo científico publicado en 2016

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