Filtros de búsqueda

Lista de obras de Jonathan Eisen

1,003 reference genomes of bacterial and archaeal isolates expand coverage of the tree of life

artículo científico

11+ things everyone needs to know about microbes

2019 Novel Coronavirus (COVID-19) Pandemic: Built Environment Considerations To Reduce Transmission

scientific article published on 07 April 2020

A case for evolutionary genomics and the comprehensive examination of sequence biodiversity.

artículo científico publicado en 2000

A cut above: discovery of an alternative excision repair pathway in bacteria

artículo científico publicado en 2002

A genomic analysis of the archaeal system Ignicoccus hospitalis-Nanoarchaeum equitans

artículo científico publicado en 2008

A microbial survey of the International Space Station (ISS).

artículo científico publicado en 2017

A phylogenomic study of DNA repair genes, proteins, and processes

artículo científico publicado en 1999

A phylogenomic study of the MutS family of proteins ⬇️

artículo científico publicado el 15 de septiembre de 1998

A phylogeny-driven genomic encyclopaedia of Bacteria and Archaea

artículo científico publicado en 2009

A science renga

artículo científico publicado en 1998

A simple, fast, and accurate method of phylogenomic inference

artículo científico publicado en 2008

Accounting for alignment uncertainty in phylogenomics

artículo científico publicado en 2012

Acidithiobacillus ferrooxidans metabolism: from genome sequence to industrial applications

artículo científico publicado en 2008

Adaptations to nitrogen availability drive ecological divergence of chemosynthetic symbionts

artículo científico publicado en 2024

Adaptations to submarine hydrothermal environments exemplified by the genome of Nautilia profundicola

artículo científico publicado en 2009

Additional Draft Genome Sequences of Escherichia coli Strains Isolated from Septic Patients

artículo científico publicado en 2016

Aggregating, tagging and integrating biodiversity research

artículo científico publicado en 2011

An automated phylogenetic tree-based small subunit rRNA taxonomy and alignment pipeline (STAP).

artículo científico publicado en 2008

An integrated pipeline for de novo assembly of microbial genomes

artículo científico publicado en 2012

Analysis of Deinococcus radiodurans's transcriptional response to ionizing radiation and desiccation reveals novel proteins that contribute to extreme radioresistance

scientific journal article

Ancestral Absence of Electron Transport Chains in Patescibacteria and DPANN

scientific article published on 17 August 2020

Assembling the marine metagenome, one cell at a time

artículo científico publicado en 2009

Assessing evolutionary relationships among microbes from whole-genome analysis

artículo científico publicado en 2000

Author Correction: Metagenome-assembled genomes provide new insight into the microbial diversity of two thermal pools in Kamchatka, Russia

scientific article published on 21 February 2020

Author Correction: Roadmap for naming uncultivated Archaea and Bacteria

artículo científico publicado en 2020

Automated and Accurate Estimation of Gene Family Abundance from Shotgun Metagenomes

artículo científico publicado en 2015

Automated and accurate estimation of gene family abundance from shotgun metagenomes

article

Bacteria isolated from Bengal cat (Felis catus × Prionailurus bengalensis) anal sac secretions produce volatile compounds potentially associated with animal signaling

artículo científico publicado en 2019

Bacterial communities of diverse Drosophila species: ecological context of a host-microbe model system

artículo científico publicado en 2011

Badomics words and the power and peril of the ome-meme ⬇️

artículo científico publicado el 12 de julio de 2012

BioTorrents: a file sharing service for scientific data

artículo científico publicado en 2010

Brouhaha over the other yeast

artículo científico publicado en 2002

Characterization of bacterial communities associated with deep-sea corals on Gulf of Alaska seamounts

artículo científico publicado en 2006

Characterization of shifts of koala (Phascolarctos cinereus) intestinal microbial communities associated with antibiotic treatment.

artículo científico publicado en 2018

Characterization of the microbiome and volatile compounds in anal gland secretions from domestic cats (Felis catus) using metagenomics and metabolomics

artículo científico publicado en 2023

Cloning and characterization of HARP/SMARCAL1: a prokaryotic HepA-related SNF2 helicase protein from human and mouse

scientific journal article

Community-Level Differences in the Microbiome of Healthy Wild Mallards and Those Infected by Influenza A Viruses

artículo científico publicado en 2017

Comparative Genomics of the Genus Porphyromonas Identifies Adaptations for Heme Synthesis within the Prevalent Canine Oral Species Porphyromonas cangingivalis

artículo científico publicado en 2015

Comparative genomics and understanding of microbial biology

artículo científico publicado en 2000

Comparative genomics of emerging human ehrlichiosis agents

artículo científico publicado en 2006

Comparative studies of resistin expression and phylogenomics in human and mouse

artículo científico publicado en 2003

Comparison of the genome of the oral pathogen Treponema denticola with other spirochete genomes

artículo científico publicado en 2004

Complete Genome Sequence of Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265

artículo científico publicado en 2014

Complete Genome Sequence of Dolosigranulum pigrum from a Patient with Interstitial Lung Disease Using Single-Molecule Real-Time Sequencing Technology

artículo científico

Complete Genome Sequence of Neisseria meningitidis Serogroup B Strain MC58

artículo científico publicado en 2000

Complete Genome Sequence of a Paenalcaligenes hominis Strain Isolated from a Paraplegic Patient with Neurogenic Bladder Using Single-Molecule Real-Time Sequencing Technology

artículo científico

Complete Genome Sequence of the Extreme Thermophile Dictyoglomus thermophilum H-6-12

artículo científico publicado en 2014

Complete Genome Sequence of the Oral Pathogenic Bacterium Porphyromonas gingivalis Strain W83.

artículo científico publicado en 2004

Complete genome sequence and comparative analysis of the metabolically versatile Pseudomonas putida KT2440

artículo científico publicado en 2002

Complete genome sequence and comparative analysis of the metabolically versatile Pseudomonas putida KT2440

article by K. E. Nelson et al published July 2003 in Environmental Microbiology

Complete genome sequence and comparative genomic analysis of an emerging human pathogen, serotype V Streptococcus agalactiae

artículo científico publicado en 2002

Complete genome sequence of 'Thermobaculum terrenum' type strain (YNP1).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Acetohalobium arabaticum type strain (Z-7288)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Acidaminococcus fermentans type strain (VR4).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Acidimicrobium ferrooxidans type strain (ICP).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Actinosynnema mirum type strain (101).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Alicyclobacillus acidocaldarius type strain (104-IA)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Aminobacterium colombiense type strain (ALA-1).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Anaerococcus prevotii type strain (PC1).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Arcanobacterium haemolyticum type strain (11018)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Archaeoglobus profundus type strain (AV18)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Arcobacter nitrofigilis type strain (CI)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Atopobium parvulum type strain (IPP 1246)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Bacteroides helcogenes type strain (P 36-108).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Bacteroides salanitronis type strain (BL78).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Beutenbergia cavernae type strain (HKI 0122).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Brachybacterium faecium type strain (Schefferle 6-10).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Brachyspira murdochii type strain (56-150)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Calditerrivibrio nitroreducens type strain (Yu37-1)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Candidatus Ruthia magnifica

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Capnocytophaga ochracea type strain (VPI 2845).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Catenulispora acidiphila type strain (ID 139908).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Caulobacter crescentus

artículo científico publicado en 2001

Complete genome sequence of Cellulomonas flavigena type strain (134).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Cellulophaga algicola type strain (IC166)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Cellulophaga lytica type strain (LIM-21).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Chitinophaga pinensis type strain (UQM 2034).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Conexibacter woesei type strain (ID131577).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Coraliomargarita akajimensis type strain (04OKA010-24).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Coriobacterium glomerans type strain (PW2(T)) from the midgut of Pyrrhocoris apterus L. (red soldier bug).

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of Cryptobacterium curtum type strain (12-3)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Deinococcus maricopensis type strain (LB-34). ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Denitrovibrio acetiphilus type strain (N2460)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Desulfarculus baarsii type strain (2st14).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Desulfobulbus propionicus type strain (1pr3)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Desulfohalobium retbaense type strain (HR(100)).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Desulfomicrobium baculatum type strain (X)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Desulfotomaculum acetoxidans type strain (5575)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Desulfurococcus mucosus type strain (O7/1). ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Dyadobacter fermentans type strain (NS114)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Eggerthella lenta type strain (IPP VPI 0255).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Ferrimonas balearica type strain (PAT).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Geodermatophilus obscurus type strain (G-20)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Gordonia bronchialis type strain (3410).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Haliangium ochraceum type strain (SMP-2)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Haliscomenobacter hydrossis type strain (O)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Halogeometricum borinquense type strain (PR3)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Halomicrobium mukohataei type strain (arg-2)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Halorhabdus utahensis type strain (AX-2)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Haloterrigena turkmenica type strain (4k)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Hydrogenobacter thermophilus type strain (TK-6)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Ignisphaera aggregans type strain (AQ1.S1)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Ilyobacter polytropus type strain (CuHbu1). ⬇️

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Intrasporangium calvum type strain (7 KIP).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Isosphaera pallida type strain (IS1B).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Jiangella gansuensis strain YIM 002T (DSM 44835T), the type species of the genus Jiangella and source of new antibiotic compounds

artículo científico publicado en 2017

Complete genome sequence of Jonesia denitrificans type strain (Prevot 55134)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Kangiella koreensis type strain (SW-125).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Kribbella flavida type strain (IFO 14399).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Kytococcus sedentarius type strain (541).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Leadbetterella byssophila type strain (4M15).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Leptotrichia buccalis type strain (C-1013-b).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Mahella australiensis type strain (50-1 BON).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Marivirga tractuosa type strain (H-43) ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Meiothermus ruber type strain (21)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Meiothermus silvanus type strain (VI-R2)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Methanoplanus petrolearius type strain (SEBR 4847)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Methanothermus fervidus type strain (V24S)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Nakamurella multipartita type strain (Y-104).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Nitratifractor salsuginis type strain (E9I37-1).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Nocardiopsis dassonvillei type strain (IMRU 509).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Oceanithermus profundus type strain (506) ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Odoribacter splanchnicus type strain (1651/6). ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Olsenella uli type strain (VPI D76D-27C)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Paludibacter propionicigenes type strain (WB4).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Pedobacter heparinus type strain (HIM 762-3).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Pirellula staleyi type strain (ATCC 27377)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Planctomyces brasiliensis type strain (DSM 5305(T)), phylogenomic analysis and reclassification of Planctomycetes including the descriptions of Gimesia gen. nov., Planctopirus gen. nov. and Rubinisphaera gen. nov. and eme

artículo científico publicado en 2014

Complete genome sequence of Planctomyces limnophilus type strain (Mü 290).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Rhodothermus marinus type strain (R-10).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Riemerella anatipestifer type strain (ATCC 11845).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Riemerella anatipestifer type strain (ATCC 11845T)

article

Complete genome sequence of Saccharomonospora viridis type strain (P101).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Sanguibacter keddieii type strain (ST-74)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Sebaldella termitidis type strain (NCTC 11300).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Segniliparus rotundus type strain (CDC 1076)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Slackia heliotrinireducens type strain (RHS 1)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Sphaerobacter thermophilus type strain (S 6022)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Spirochaeta smaragdinae type strain (SEBR 4228).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Spirosoma linguale type strain (1)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Stackebrandtia nassauensis type strain (LLR-40K-21).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Streptobacillus moniliformis type strain (9901)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Streptosporangium roseum type strain (NI 9100).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Sulfurimonas autotrophica type strain (OK10).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Sulfurospirillum deleyianum type strain (5175).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Syntrophobotulus glycolicus type strain (FlGlyR).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Syntrophobotulus glycolicus type strain (FlGlyRT)

article

Complete genome sequence of Syntrophothermus lipocalidus type strain (TGB-C1)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermaerobacter marianensis type strain (7p75a)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermanaerovibrio acidaminovorans type strain (Su883).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Thermobispora bispora type strain (R51).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermocrinis albus type strain (HI 11/12)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermomonospora curvata type strain (B9).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Thermosediminibacter oceani type strain (JW/IW-1228P)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermosphaera aggregans type strain (M11TL)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Treponema succinifaciens type strain (6091).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Truepera radiovictrix type strain (RQ-24)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Tsukamurella paurometabola type strain (no. 33).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Veillonella parvula type strain (Te3)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Vulcanisaeta distributa type strain (IC-017)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Weeksella virosa type strain (9751).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Xylanimonas cellulosilytica type strain (XIL07)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of the Q-fever pathogen Coxiella burnetii

artículo científico publicado en 2003

Complete genome sequence of the acetate-degrading sulfate reducer Desulfobacca acetoxidans type strain (ASRB2).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the aerobic CO-oxidizing thermophile Thermomicrobium roseum

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of the aerobic, heterotroph Marinithermus hydrothermalis type strain (T1(T)) from a deep-sea hydrothermal vent chimney

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the aquatic bacterium Runella slithyformis type strain (LSU 4(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the bile-resistant pigment-producing anaerobe Alistipes finegoldii type strain (AHN2437(T)).

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of the broad-host-range vibriophage KVP40: comparative genomics of a T4-related bacteriophage

artículo científico publicado en 2003

Complete genome sequence of the extremely halophilic Halanaerobium praevalens type strain (GSL)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the facultatively anaerobic, appendaged bacterium Muricauda ruestringensis type strain (B1(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the gliding freshwater bacterium Fluviicola taffensis type strain (RW262).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the gliding, heparinolytic Pedobacter saltans type strain (113)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the halophilic bacterium Spirochaeta africana type strain (Z-7692(T)) from the alkaline Lake Magadi in the East African Rift

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of the hyperthermophilic chemolithoautotroph Pyrolobus fumarii type strain (1A)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the moderate thermophile Anaerobaculum mobile type strain (NGA(T)).

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of the moderately thermophilic mineral-sulfide-oxidizing firmicute Sulfobacillus acidophilus type strain (NAL(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the oral pathogenic Bacterium porphyromonas gingivalis strain W83

artículo científico publicado en 2003

Complete genome sequence of the orange-red pigmented, radioresistant Deinococcus proteolyticus type strain (MRP(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the sulfur compounds oxidizing chemolithoautotroph Sulfuricurvum kujiense type strain (YK-1(T))

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the termite hindgut bacterium Spirochaeta coccoides type strain (SPN1(T)), reclassification in the genus Sphaerochaeta as Sphaerochaeta coccoides comb. nov. and emendations of the family Spirochaetaceae and the genus Spha

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the thermophilic sulfate-reducing ocean bacterium Thermodesulfatator indicus type strain (CIR29812(T))

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the thermophilic sulfur-reducer Desulfurobacterium thermolithotrophum type strain (BSA(T)) from a deep-sea hydrothermal vent

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the thermophilic sulfur-reducer Hippea maritima type strain (MH(2))

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the thermophilic, hydrogen-oxidizing Bacillus tusciae type strain (T2) and reclassification in the new genus, Kyrpidia gen. nov. as Kyrpidia tusciae comb. nov. and emendation of the family Alicyclobacillaceae da Costa and

artículo científico publicado en 2011

CompostBin: A DNA Composition-Based Algorithm for Binning Environmental Shotgun Reads

article

Correction for Dietz et al., "2019 Novel Coronavirus (COVID-19) Pandemic: Built Environment Considerations To Reduce Transmission"

scientific article published on 05 May 2020

Correction: A microbial survey of the International Space Station (ISS).

artículo científico publicado en 2018

Correction: An Automated Phylogenetic Tree-Based Small Subunit rRNA Taxonomy and Alignment Pipeline (STAP).

artículo científico publicado en 2008

Correction: Comparative Genomics of Emerging Human Ehrlichiosis Agents.

artículo científico publicado en 2006

Correction: Life in Hot Carbon Monoxide: The Complete Genome Sequence of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901.

artículo científico publicado en 2006

Corrigendum: Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea

artículo científico publicado en 2018

Corrigendum: Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea

article

DNA sequence of both chromosomes of the cholera pathogen Vibrio cholerae

artículo científico publicado en 2000

Deep-sea hydrothermal vent bacteria related to human pathogenic Vibrio species

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequence of Arthrobacter sp. Strain UCD-GKA (Phylum Actinobacteria).

artículo científico publicado en 2017

Draft Genome Sequence of Bacillus safensis JPL-MERTA-8-2, Isolated from a Mars-Bound Spacecraft

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequence of Bacillus vietnamensis Strain UCD-SED5 (Phylum Firmicutes).

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequence of Burkholderia gladioli Strain UCD-UG_CHAPALOTE (Phylum Proteobacteria).

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequence of Cobetia sp. UCD-24C, Isolated from Roots and Leaves of the Seagrass Zostera marina

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequence of Curtobacterium flaccumfaciens Strain UCD-AKU (Phylum Actinobacteria).

artículo científico publicado en 2013

Draft Genome Sequence of Curtobacterium sp. Strain UCD-KPL2560 (Phylum Actinobacteria).

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequence of Dietzia sp. Strain UCD-THP (Phylum Actinobacteria).

artículo científico publicado en 2013

Draft Genome Sequence of Enterobacter sp. Strain UCD-UG_FMILLET (Phylum Proteobacteria).

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequence of Enterococcus faecalis Strain UCD-PD3

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequence of Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Klebsiella pneumoniae Isolated from a Patient in Lebanon

artículo científico publicado en 2014

Draft Genome Sequence of Gordonia sp. Strain UCD-TK1 (Phylum Actinobacteria).

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequence of Klebsiella pneumoniae KGM-IMP216 Harboring blaCTX-M-15, blaDHA-1, blaTEM-1B, blaNDM-1, blaSHV-28, and blaOXA-1, Isolated from a Patient in Lebanon

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequence of Klebsiella pneumoniae UCD-JA29 Isolated from a Patient with Sepsis

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequence of Kocuria sp. Strain UCD-OTCP (Phylum Actinobacteria).

artículo científico publicado en 2013

Draft Genome Sequence of Leucobacter sp. Strain UCD-THU (Phylum Actinobacteria).

artículo científico publicado en 2013

Draft Genome Sequence of Microbacterium sp. Strain UCD-TDU (Phylum Actinobacteria).

artículo científico publicado en 2013

Draft Genome Sequence of Planomicrobium glaciei UCD-HAM (Phylum Firmicutes).

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequence of Porphyrobacter mercurialis (sp. nov.) Strain Coronado

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequence of Propionibacterium avidum Strain UCD-PD2 Isolated from a Feline Anal Sac.

artículo científico publicado en 2017

Draft Genome Sequence of Pseudoalteromonas tetraodonis Strain UCD-SED8 (Phylum Gammaproteobacteria).

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequence of Tatumella sp. Strain UCD-D_suzukii (Phylum Proteobacteria) Isolated from Drosophila suzukii Larvae

artículo científico publicado en 2014

Draft Genome Sequence of Tenacibaculum soleae UCD-KL19.

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequence of the Arsenate-Respiring Bacterium Chrysiogenes arsenatis Strain DSM 11915.

artículo científico publicado en 2013

Draft Genome Sequence of the Endosymbiont "Candidatus Ruthia magnifica" UCD-CM (Phylum Proteobacteria).

artículo científico publicado en 2014

Draft Genome Sequence of the Pyridinediol-Fermenting Bacterium Synergistes jonesii 78-1

artículo científico publicado en 2014

Draft Genome Sequences of Acinetobacter baumannii Strains Harboring the blaNDM-1 Gene Isolated in Lebanon from Civilians Wounded during the Syrian Civil War.

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequences of Dermacoccus nishinomiyaensis Strains UCD-KPL2534 and UCD-KPL2528 Isolated from an Indoor Track Facility

artículo científico publicado en 2017

Draft Genome Sequences of Escherichia coli Strains Isolated from Septic Patients

artículo científico publicado en 2014

Draft Genome Sequences of Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Escherichia coli Strains Isolated from Patients in Lebanon

artículo científico publicado en 2014

Draft Genome Sequences of Pseudomonas moraviensis UCD-KL30, Vibrio ostreicida UCD-KL16, Colwellia sp. Strain UCD-KL20, Shewanella sp. Strain UCD-KL12, and Shewanella sp. Strain UCD-KL21, Isolated from Seagrass

artículo científico publicado en 2017

Draft Genome Sequences of Streptococcus pyogenes Strains Associated with Throat and Skin Infections in Lebanon

artículo científico publicado en 2014

Draft Genome Sequences of Two Pseudoalteromonas Strains Isolated from Roots and Leaf Blades of the Seagrass Zostera marina

artículo científico

Draft Genome Sequences of Two Pseudoalteromonas porphyrae Strains Isolated from Seagrass Sediment

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequences of Two Vibrio splendidus Strains, Isolated from Seagrass Sediment

artículo científico

Draft genome sequence of an Actinobacterium, Brachybacterium muris strain UCD-AY4.

artículo científico publicado en 2013

Draft genome sequences of 26 porphyromonas strains isolated from the canine oral microbiome

artículo científico publicado en 2015

Draft genome sequences of eight bacteria isolated from the indoor environment: Staphylococcus capitis strain H36, S. capitis strain H65, S. cohnii strain H62, S. hominis strain H69, Microbacterium sp. strain H83, ...

artículo científico publicado en 2017

Drivers of bacterial beta-diversity depend on spatial scale

artículo científico publicado en 2011

Effects of preservation method on canine (Canis lupus familiaris) fecal microbiota

scholarly article published 3 May 2018

Effects of preservation method on canine (Canis lupus familiaris) fecal microbiota

scholarly article published 3 May 2018

Effects of preservation method on canine (Canis lupus familiaris) fecal microbiota.

artículo científico publicado en 2018

Elements of the Health Care Proxy Act

article

Environmental Shotgun Sequencing: Its Potential and Challenges for Studying the Hidden World of Microbes

Environmental control on the distribution of metabolic strategies of benthic microbial mats in Lake Fryxell, Antarctica

artículo científico publicado en 2020

Environmental genome shotgun sequencing of the Sargasso Sea

artículo científico publicado en 2004

Environmental shotgun sequencing: its potential and challenges for studying the hidden world of microbes

artículo científico publicado en 2007

Erratum to “Comparative studies of resistin expression and phylogenomics in human and mouse” [Biochem. Biophys. Res. Commun. 310 (2003) 927–935]

scholarly article published in Biochemical and Biophysical Research Communications

Erratum to: Complete genome sequence of Atopobium parvulum type strain (IPP 1246).

artículo científico publicado en 2010

Erratum to: Complete genome sequence of Pirellula staleyi type strain (ATCC 27377)

artículo científico publicado en 2010

Erratum: 1,003 reference genomes of bacterial and archaeal isolates expand coverage of the tree of life

scholarly article published in Nature Biotechnology

Evidence for lateral gene transfer between Archaea and Bacteria from genome sequence of Thermotoga maritima

artículo científico publicado en 1999

Evidence for symmetric chromosomal inversions around the replication origin in bacteria

artículo científico publicado en 2000

Evolution of sensory complexity recorded in a myxobacterial genome

artículo científico publicado en 2006

Evolution of the SNF2 family of proteins: subfamilies with distinct sequences and functions

artículo científico publicado en 1995

Expert failure: re-evaluating research assessment

artículo científico publicado en 2013

Extraordinary phylogenetic diversity and metabolic versatility in aquifer sediment.

artículo científico publicado en 2013

Faculty of 1000 evaluation for A Sanger/pyrosequencing hybrid approach for the generation of high-quality draft assemblies of marine microbial genomes

Faculty of 1000 evaluation for A phylogenomic approach to microbial evolution

Faculty of 1000 evaluation for A simple algorithm to infer gene duplication and speciation events on a gene tree

article

Faculty of 1000 evaluation for An RNA ligase from Deinococcus radiodurans

Faculty of 1000 evaluation for Automated protein subfamily identification and classification

Faculty of 1000 evaluation for Biochemical and molecular characterisation of Tetrahymena thermophila extracellular cysteine proteases

Faculty of 1000 evaluation for Convergent evolution of MutS and topoisomerase II for clamping DNA crossovers and stacked Holliday junctions

Faculty of 1000 evaluation for Convergent evolution of chromosomal sex-determining regions in the animal and fungal kingdoms

Faculty of 1000 evaluation for Discovery-based science education: functional genomic dissection in Drosophila by undergraduate researchers

Faculty of 1000 evaluation for Distribution, expression, and motif variability of ankyrin domain genes in Wolbachia pipientis

article

Faculty of 1000 evaluation for Effects of size and temperature on metabolic rate

Faculty of 1000 evaluation for Evidence that plant-like genes in Chlamydia species reflect an ancestral relationship between Chlamydiaceae, cyanobacteria, and the chloroplast

article

Faculty of 1000 evaluation for Evolutionary analysis of Arabidopsis, cyanobacterial, and chloroplast genomes reveals plastid phylogeny and thousands of cyanobacterial genes in the nucleus

article

Faculty of 1000 evaluation for Evolutionary origins of genomic repertoires in bacteria

Faculty of 1000 evaluation for Genetic manipulation of carotenoid biosynthesis in the green sulfur bacterium Chlorobium tepidum

Faculty of 1000 evaluation for Genome sequence of the endocellular obligate symbiont of tsetse flies, Wigglesworthia glossinidia

Faculty of 1000 evaluation for High allelic diversity in the methyltransferase gene of a phase variable type III restriction-modification system has implications for the fitness of Haemophilus influenzae

article

Faculty of 1000 evaluation for Identification of a DNA nonhomologous end-joining complex in bacteria

Faculty of 1000 evaluation for Identification of multiple distinct Snf2 subfamilies with conserved structural motifs

Faculty of 1000 evaluation for Marine T4-type bacteriophages, a ubiquitous component of the dark matter of the biosphere

scholarly article published 15 September 2005

Faculty of 1000 evaluation for Mechanisms of evolution in Rickettsia conorii and R. prowazekii

Faculty of 1000 evaluation for Meiotic arrest and aneuploidy in MLH3-deficient mice

Faculty of 1000 evaluation for Metagenomic DNA fragments that affect Escherichia coli mutational pathways

scholarly article published 8 August 2006

Faculty of 1000 evaluation for Microbial diversity in the deep sea and the underexplored "rare biosphere"

Faculty of 1000 evaluation for Microbial ecology of four coral atolls in the Northern Line Islands

Faculty of 1000 evaluation for Nine mutants of Chlorobium tepidum each unable to synthesize a different chlorosome protein still assemble functional chlorosomes

Faculty of 1000 evaluation for Origins and evolution of the recA/RAD51 gene family: evidence for ancient gene duplication and endosymbiotic gene transfer

article

Faculty of 1000 evaluation for Population genomics: whole-genome analysis of polymorphism and divergence in Drosophila simulans

Faculty of 1000 evaluation for Preserving genome integrity: the DdrA protein of Deinococcus radiodurans R1

Faculty of 1000 evaluation for Prevalence and evolution of core photosystem II genes in marine cyanobacterial viruses and their hosts

article

Faculty of 1000 evaluation for Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology

article published in 2002

Faculty of 1000 evaluation for Symbiosis insights through metagenomic analysis of a microbial consortium

Faculty of 1000 evaluation for Ten species in one: DNA barcoding reveals cryptic species in the neotropical skipper butterfly Astraptes fulgerator

article

Faculty of 1000 evaluation for Textpresso: an ontology-based information retrieval and extraction system for biological literature

Faculty of 1000 evaluation for The 1.2-megabase genome sequence of Mimivirus

Faculty of 1000 evaluation for The Wolbachia genome of Brugia malayi: endosymbiont evolution within a human pathogenic nematode

Faculty of 1000 evaluation for The bacterial catalase from filarial DNA preparations derives from common pseudomonad contaminants and not from Wolbachia endosymbionts

Faculty of 1000 evaluation for The metagenomics RAST server - a public resource for the automatic phylogenetic and functional analysis of metagenomes

scholarly article published 20 September 2008

Faculty of 1000 evaluation for The methionine salvage pathway in Bacillus subtilis

Faculty of 1000 evaluation for The role of endosymbiotic Wolbachia bacteria in the pathogenesis of river blindness

Faculty of 1000 evaluation for The uvrA, uvrB and uvrC genes are required for repair of ultraviolet light induced DNA photoproducts in Halobacterium sp. NRC-1

article

Faculty of 1000 evaluation for Trends between gene content and genome size in prokaryotic species with larger genomes

article

Faculty of 1000 evaluation for UniFrac--an online tool for comparing microbial community diversity in a phylogenetic context

scholarly article published 24 September 2006

Forensic analysis of the microbiome of phones and shoes

artículo científico publicado en 2015

Functional biogeography of ocean microbes revealed through non-negative matrix factorization

artículo científico publicado en 2012

Fungi, bacteria and oomycota opportunistically isolated from the seagrass, Zostera marina

artículo científico publicado en 2020

Gastrogenomic delights: a movable feast

artículo científico publicado en 1997

Gastrogenomics

artículo científico publicado en 2001

Gene conservation among endospore-forming bacteria reveals additional sporulation genes in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2012

Gene synteny and evolution of genome architecture in trypanosomatids

article

Genes Required for the Anti-fungal Activity of a Bacterial Endophyte Isolated from a Corn Landrace Grown Continuously by Subsistence Farmers Since 1000 BC.

artículo científico publicado en 2016

Genetic and physical mapping of DNA replication origins in Haloferax volcanii

artículo científico publicado en 2007

Genetic and physical mapping of DNA replication origins in Haloferax volcanii

Genome Analysis of Streptococcus pyogenes Associated with Pharyngitis and Skin Infections

artículo científico publicado en 2016

Genome Sequence of a Multidrug-Resistant Strain of Bacillus pumilus, CB01, Isolated from the Feces of an American Crow, Corvus brachyrhynchos

artículo científico publicado en 2016

Genome Sequence of a Sulfate-Reducing Thermophilic Bacterium, Thermodesulfobacterium commune DSM 2178T (Phylum Thermodesulfobacteria)

artículo científico publicado en 2015

Genome Sequence of the PCE-Dechlorinating Bacterium Dehalococcoides ethenogenes

artículo científico publicado en 2005

Genome Sequence of the Radioresistant Bacterium Deinococcus radiodurans R1

artículo científico publicado en 1999

Genome Sequence of the Sulfate-Reducing Thermophilic Bacterium Thermodesulfovibrio yellowstonii Strain DSM 11347T (Phylum Nitrospirae)

artículo científico publicado en 2015

Genome data: what do we learn?

artículo científico publicado en 2000

Genome of Geobacter sulfurreducens: Metal Reduction in Subsurface Environments

artículo científico publicado en 2003

Genome of Thermotoga maritima MSB8.

artículo científico publicado en 2001

Genome sequence of Frateuria aurantia type strain (Kondô 67(T)), a xanthomonade isolated from Lilium auratium Lindl

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of Silicibacter pomeroyi reveals adaptations to the marine environment

artículo científico publicado en 2004

Genome sequence of the Antarctic rhodopsins-containing flavobacterium Gillisia limnaea type strain (R-8282(T)).

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the Thermotoga thermarum type strain (LA3(T)) from an African solfataric spring

artículo científico publicado en 2014

Genome sequence of the dissimilatory metal ion–reducing bacterium Shewanella oneidensis

artículo científico publicado en 2002

Genome sequence of the filamentous, gliding Thiothrix nivea neotype strain (JP2(T))

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of the flexirubin-pigmented soil bacterium Niabella soli type strain (JS13-8(T))

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the free-living aerobic spirochete Turneriella parva type strain (H(T)), and emendation of the species Turneriella parva

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of the homoacetogenic bacterium Holophaga foetida type strain (TMBS4(T)).

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum

artículo científico publicado en 2002

Genome sequence of the moderately thermophilic halophile Flexistipes sinusarabici strain (MAS10)

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of the moderately thermophilic sulfur-reducing bacterium Thermanaerovibrio velox type strain (Z-9701(T)) and emended description of the genus Thermanaerovibrio

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of the moderately thermophilic, amino-acid-degrading and sulfur-reducing bacterium Thermovirga lienii type strain (Cas60314(T)).

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the mud-dwelling archaeon Methanoplanus limicola type strain (DSM 2279(T)), reclassification of Methanoplanus petrolearius as Methanolacinia petrolearia and emended descriptions of the genera Methanoplanus and Methanolacinia

artículo científico publicado en 2014

Genome sequence of the orange-pigmented seawater bacterium Owenweeksia hongkongensis type strain (UST20020801(T)).

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the phylogenetically isolated spirochete Leptonema illini type strain (3055(T)).

scientific article published on 25 May 2013

Genome sequence of the thermophilic fresh-water bacterium Spirochaeta caldaria type strain (H1(T)), reclassification of Spirochaeta caldaria, Spirochaeta stenostrepta, and Spirochaeta zuelzerae in the genus Treponema as Treponema caldaria comb. nov.

artículo científico publicado en 2013

Genome sequences of Chlamydia trachomatis MoPn and Chlamydia pneumoniae AR39.

artículo científico publicado en 2000

Genome sequencing and multifaceted taxonomic analysis of novel strains of violacein-producing bacteria and non-violacein-producing close relatives

artículo científico publicado en 2023

Genome-Scale Analysis of Programmed DNA Elimination Sites in Tetrahymena thermophila

artículo científico publicado en 2011

Genomic Encyclopedia of Bacterial and Archaeal Type Strains, Phase III: the genomes of soil and plant-associated and newly described type strains

artículo científico publicado en 2015

Genomic Encyclopedia of Type Strains, Phase I: The one thousand microbial genomes (KMG-I) project

artículo científico publicado en 2013

Genomic analysis of Hyphomonas neptunium contradicts 16S rRNA gene-based phylogenetic analysis: implications for the taxonomy of the orders 'Rhodobacterales' and Caulobacterales

artículo científico publicado en 2005

Genomic attributes of extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli isolated from patients in Lebanon

artículo científico publicado en 2017

Genomic encyclopedia of bacteria and archaea: sequencing a myriad of type strains

artículo científico publicado en 2014

Genomic insights into methanotrophy: the complete genome sequence of Methylococcus capsulatus (Bath)

artículo científico publicado en 2004

Genomic perspective on the photobiology of Halobacterium species NRC-1, a phototrophic, phototactic, and UV-tolerant haloarchaeon.

artículo científico publicado en 2001

Genomics of emerging infectious disease: A PLoS collection

artículo científico publicado en 2009

Global-Scale Structure of the Eelgrass Microbiome

artículo científico publicado en 2017

Global-scale structure of the eelgrass microbiome

Going to extremes

artículo científico publicado en 1999

Growth of 48 built environment bacterial isolates on board the International Space Station (ISS)

Growth of 48 built environment bacterial isolates on board the International Space Station (ISS)

Growth of 48 built environment bacterial isolates on board the International Space Station (ISS).

artículo científico publicado en 2016

Gut Check: The evolution of an educational board game

artículo científico publicado en 2017

High-quality-draft genome sequence of the yellow-pigmented flavobacterium Joostella marina type strain (En5(T)).

artículo científico publicado en 2013

Horizontal gene transfer among microbial genomes: new insights from complete genome analysis

artículo científico publicado en 2000

Host-associated microbiomes drive structure and function of marine ecosystems

artículo científico publicado en 2019

Human gut microbiome adopts an alternative state following small bowel transplantation

artículo científico publicado en 2009

Identification of a fourth family of lycopene cyclases in photosynthetic bacteria

artículo científico publicado en 2007

Improving the coverage of the cyanobacterial phylum using diversity-driven genome sequencing

artículo científico publicado en 2012

In silico-initiated cloning and molecular characterization of a novel human member of the L1 gene family of neural cell adhesion molecules

artículo científico publicado en 1998

Incorporating 16S gene copy number information improves estimates of microbial diversity and abundance

artículo científico publicado en 2012

Insights into the evolution of Darwin's finches from comparative analysis of the Geospiza magnirostris genome sequence

artículo científico publicado en 2013

Insights into the evolution of oxygenic photosynthesis from a phylogenetically novel, low-light cyanobacterium

scholarly article published 1 June 2018

Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter

artículo científico publicado en 2013

Introducing W.A.T.E.R.S.: a workflow for the alignment, taxonomy, and ecology of ribosomal sequences

artículo científico publicado en 2010

Isolation and sequence-based characterization of a koala symbiont: Lonepinella koalarum

artículo científico publicado en 2020

Lateral gene transfer or viral colonization?

scientific article published in Science

Life in hot carbon monoxide: the complete genome sequence of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901

artículo científico publicado en 2005

Longitudinal course of body-focused repetitive behaviors in obsessive-compulsive disorder.

artículo científico publicado en 2015

MIxS-BE: a MIxS extension defining a minimum information standard for sequence data from the built environment.

artículo científico publicado en 2013

Macronuclear genome sequence of the ciliate Tetrahymena thermophila, a model eukaryote

artículo científico publicado en 2006

Male-specific lethal 2, a dosage compensation gene of Drosophila, undergoes sex-specific regulation and encodes a protein with a RING finger and a metallothionein-like cysteine cluster.

scientific article published on June 1995

Marine probiotics: increasing coral resistance to bleaching through microbiome manipulation

scientific article published on 05 December 2018

Mauve assembly metrics

artículo científico publicado en 2011

Meeting report: the terabase metagenomics workshop and the vision of an Earth microbiome project

artículo científico publicado en 2010

Metabolic complementarity and genomics of the dual bacterial symbiosis of sharpshooters

artículo científico publicado en 2006

Metagenome-assembled genomes provide new insight into the microbial diversity of two thermal pools in Kamchatka, Russia

scientific article published on 28 February 2019

Metagenomic methylation patterns resolve bacterial genomes of unusual size and structural complexity

artículo científico publicado en 2022

Metagenomic sequencing of an in vitro-simulated microbial community

artículo científico publicado en 2010

MicrobeDB: a locally maintainable database of microbial genomic sequences.

artículo científico publicado en 2012

Microbial Mat Communities along an Oxygen Gradient in a Perennially Ice-Covered Antarctic Lake

artículo científico publicado en 2015

Microbial communities in sediment from Zostera marina patches, but not the Z. marina leaf or root microbiomes, vary in relation to distance from patch edge

artículo científico publicado en 2017

Microbial genes in the human genome: lateral transfer or gene loss?

artículo científico publicado en 2001

Microbial genome sequencing

artículo científico publicado en 2000

Microbial genome sequencing 2000: new insights into physiology, evolution and expression analysis

artículo científico publicado en 2000

Microbial resistance to disinfectants in animal shelters [project]

Microbial resistance to disinfectants in animal shelters [proposal]

Microbiome Responses to Fecal Microbiota Transplantation in Cats with Chronic Digestive Issues

artículo científico publicado en 2023

Microbiome succession during ammonification in eelgrass bed sediments

artículo científico publicado en 2017

Microbiome succession during ammonification in eelgrass bed sediments

Microbiome succession during ammonification in eelgrass bed sediments

Microscale sulfur cycling in the phototrophic pink berry consortia of the Sippewissett Salt Marsh

artículo científico publicado en 2014

Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea.

artículo científico publicado en 2017

Modeling bacterial evolution with comparative-genome-based marker systems: application to Mycobacterium tuberculosis evolution and pathogenesis

artículo científico publicado en 2003

Natural experiments and long-term monitoring are critical to understand and predict marine host-microbe ecology and evolution

publication published on 19 August 2021

New evolutionary frontiers from unusual virus genomes

artículo científico publicado en 2005

Nitrogen fixation in a landrace of maize is supported by a mucilage-associated diazotrophic microbiota

artículo científico publicado en 2018

Non-contiguous finished genome sequence and contextual data of the filamentous soil bacterium Ktedonobacter racemifer type strain (SOSP1-21).

artículo científico publicado en 2011

Non-contiguous finished genome sequence of Aminomonas paucivorans type strain (GLU-3).

artículo científico publicado en 2010

Non-contiguous finished genome sequence of Bacteroides coprosuis type strain (PC139). ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Non-contiguous finished genome sequence of the opportunistic oral pathogen Prevotella multisaccharivorax type strain (PPPA20).

artículo científico publicado en 2011

On the taxonomic status of the intracellular bacterium Wolbachia pipientis: should this species name include the intracellular bacteria of filarial nematodes?

artículo científico publicado en 2007

Open science and reporting animal studies: who's accountable?

artículo científico publicado en 2014

PHYLOGENETIC DIVERSITY OF THE MICROBIAL MATS IN LAKE FRYXELL, ANTARCTICA

article

PLoS Biology 2.0

artículo científico publicado en 2008

Patellamide A and C biosynthesis by a microcin-like pathway in Prochloron didemni, the cyanobacterial symbiont of Lissoclinum patella ⬇️

artículo científico publicado en 2005

Permanent draft genome sequence of Dethiosulfovibrio peptidovorans type strain (SEBR 4207)

artículo científico publicado en 2010

Permanent draft genome sequence of the gliding predator Saprospira grandis strain Sa g1 (= HR1).

artículo científico publicado en 2012

Phosphate transporters in marine phytoplankton and their viruses: cross-domain commonalities in viral-host gene exchanges

artículo científico publicado en 2011

PhylOTU: a high-throughput procedure quantifies microbial community diversity and resolves novel taxa from metagenomic data.

artículo científico publicado en 2011

PhyloSift: phylogenetic analysis of genomes and metagenomes

artículo científico publicado en 2014

Phylogenetic analysis and gene functional predictions: phylogenomics in action

artículo científico publicado en 2002

Phylogenetic relationships of chemoautotrophic bacterial symbionts of Solemya velum say (Mollusca: Bivalvia) determined by 16S rRNA gene sequence analysis

artículo científico publicado en 1992

Phylogenetically driven sequencing of extremely halophilic archaea reveals strategies for static and dynamic osmo-response

artículo científico publicado en 2014

Phylogenomics of the reproductive parasite Wolbachia pipientis wMel: a streamlined genome overrun by mobile genetic elements

artículo científico publicado en 2004

Phylogenomics: Improving Functional Predictions for Uncharacterized Genes by Evolutionary Analysis ⬇️

artículo científico publicado el 1 de marzo de 1998

Phylogenomics: intersection of evolution and genomics

artículo científico publicado en 2003

Phylogeny of Bacterial and Archaeal Genomes Using Conserved Genes: Supertrees and Supermatrices ⬇️

artículo científico publicado el 25 de abril de 2013

Play up your lab’s leadership in open science!

Porphyrobacter mercurialis sp. nov., isolated from a stadium seat and emended description of the genus Porphyrobacter

artículo científico publicado en 2015

Prokaryotic Super Program Advisory Committee DOE Joint Genome Institute, Walnut Creek, CA, March 27, 2013.

artículo científico publicado en 2013

Questioning the fetal microbiome illustrates pitfalls of low-biomass microbial studies

artículo científico publicado en 2023

Recent Outbreaks of Shigellosis in California Caused by Two Distinct Populations of Shigella sonnei With Increased Virulence or Fluoroquinolone Resistance

Recent Outbreaks of Shigellosis in California Caused by Two Distinct Populations of Shigella sonnei with either Increased Virulence or Fluoroquinolone Resistance.

artículo científico publicado en 2016

Reconstruction of Metagenome-Assembled Genomes from Aquaria

publication published on 05 August 2021

Recovery of 52 bacterial genomes from the fecal microbiome of the domestic cat ( <i>Felis catus</i> ) using Hi-C proximity ligation and shotgun metagenomics

artículo científico publicado en 2023

Refined annotation and assembly of the Tetrahymena thermophila genome sequence through EST analysis, comparative genomic hybridization, and targeted gap closure

artículo científico publicado en 2008

Reply to McDonald, "Protections against the Risk of Airborne SARS-CoV-2 Infection"

artículo científico publicado en 2020

Research priorities for harnessing plant microbiomes in sustainable agriculture.

artículo científico publicado en 2017

Roadmap for naming uncultivated Archaea and Bacteria

artículo científico publicado en 2020

Rokubacteria: Genomic Giants among the Uncultured Bacterial Phyla

artículo científico publicado en 2017

Root hair-endophyte stacking (RHESt) in an ancient Afro-Indian crop creates an unusual physico-chemical barrier to trap pathogen(s)

Root-hair endophyte stacking in finger millet creates a physicochemical barrier to trap the fungal pathogen Fusarium graminearum

artículo científico publicado en 2016

Second gene for gonadotropin-releasing hormone in humans

artículo científico publicado en 1998

Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 1999

Sequence and analysis of the Arabidopsis genome.

artículo científico publicado en 2001

Sequence and drug susceptibility of subtype C reverse transcriptase from human immunodeficiency virus type 1 seroconverters in Zimbabwe

artículo científico publicado en 1997

Sequence characterization and comparative analysis of three plasmids isolated from environmental Vibrio spp.

artículo científico publicado en 2007

Sequence similarity of putative transposases links the maize Mutator autonomous element and a group of bacterial insertion sequences

artículo científico publicado en 1994

Sequenced strains must be saved from extinction

artículo científico publicado en 2001

Sequencing and analysis of a 63 kb bacterial artificial chromosome insert from the Wolbachia endosymbiont of the human filarial parasite Brugia malayi

artículo científico publicado en 2002

Sequencing of seven haloarchaeal genomes reveals patterns of genomic flux

artículo científico publicado en 2012

Sifting through genomes with iterative-sequence clustering produces a large, phylogenetically diverse protein-family resource.

artículo científico publicado en 2012

Stalking the fourth domain in metagenomic data: searching for, discovering, and interpreting novel, deep branches in marker gene phylogenetic trees

artículo científico publicado en 2011

Strain- and plasmid-level deconvolution of a synthetic metagenome by sequencing proximity ligation products

artículo científico publicado en 2014

Strain- and plasmid-level deconvolution of a synthetic metagenome by sequencing proximity ligation products

Strain- and plasmid-level deconvolution of a synthetic metagenome by sequencing proximity ligation products

Structure, variation, and assembly of the root-associated microbiomes of rice

artículo científico publicado en 2015

Swabs to Genomes: A Comprehensive Workflow

article published in 2014

Swabs to genomes: a comprehensive workflow

artículo científico publicado en 2015

Swabs to genomes: a comprehensive workflow

Swabs to genomes: a comprehensive workflow

Systematic identification of gene families for use as "markers" for phylogenetic and phylogeny-driven ecological studies of bacteria and archaea and their major subgroups

artículo científico publicado en 2013

TIGRFAMs: a protein family resource for the functional identification of proteins

artículo científico publicado en 2001

Taking the first steps towards a standard for reporting on phylogenies: Minimum Information About a Phylogenetic Analysis (MIAPA)

artículo científico publicado en 2006

Taxonomic, Genomic, and Functional Variation in the Gut Microbiomes of Wild Spotted Hyenas Across 2 Decades of Study

artículo científico publicado en 2023

Ten questions concerning the microbiomes of buildings

Teredinibacter waterburyi sp. nov., a marine, cellulolytic endosymbiotic bacterium isolated from the gills of the wood-boring mollusc Bankia setacea (Bivalvia: Teredinidae) and emended description of the genus Teredinibacter

artículo científico publicado en 2020

The Brucella suis genome reveals fundamental similarities between animal and plant pathogens and symbionts

artículo científico publicado en 2002

The Calyptogena magnifica chemoautotrophic symbiont genome.

artículo científico publicado en 2007

The Cloacal Microbiome of Five Wild Duck Species Varies by Species and Influenza A Virus Infection Status

article

The Genetic Data Environment

The Genetic Data Environment. A user modifiable and expandable multiple sequence analysis package

artículo científico publicado en 1997

The Green Berry Consortia of the Sippewissett Salt Marsh: Millimeter-Sized Aggregates of Diazotrophic Unicellular Cyanobacteria

artículo científico publicado en 2017

The RecA protein as a model molecule for molecular systematic studies of bacteria: comparison of trees of RecAs and 16S rRNAs from the same species

artículo científico publicado en 1995

The Sorcerer II Global Ocean Sampling expedition: expanding the universe of protein families

artículo científico publicado en 2007

The Sorcerer II Global Ocean Sampling expedition: northwest Atlantic through eastern tropical Pacific

artículo científico publicado en 2007

The United States Culture Collection Network (USCCN): Enhancing Microbial Genomics Research through Living Microbe Culture Collections.

artículo científico publicado en 2015

The age of the Arabidopsis thaliana genome duplication

artículo científico publicado en 2003

The complete genome of Teredinibacter turnerae T7901: an intracellular endosymbiont of marine wood-boring bivalves (shipworms)

artículo científico publicado en 2009

The complete genome sequence of Chlorobium tepidum TLS, a photosynthetic, anaerobic, green-sulfur bacterium

artículo científico publicado en 2002

The complete genome sequence of Haloferax volcanii DS2, a model archaeon

artículo científico publicado en 2010

The emergence of microbiome centres

artículo científico publicado en 2020

The genome of the intracellular bacterium of the coastal bivalve, Solemya velum: a blueprint for thriving in and out of symbiosis

artículo científico publicado en 2014

The genome of the natural genetic engineer Agrobacterium tumefaciens C58

artículo científico publicado en 2001

The genome sequence of Bacillus anthracis Ames and comparison to closely related bacteria

artículo científico publicado en 2003

The genome sequence of Methanohalophilus mahii SLP(T) reveals differences in the energy metabolism among members of the Methanosarcinaceae inhabiting freshwater and saline environments

artículo científico publicado en 2010

The genome sequence of the anaerobic, sulfate-reducing bacterium Desulfovibrio vulgaris Hildenborough

artículo científico publicado en 2004

The impact of Helicobacter pylori infection on the gastric microbiota of the rhesus macaque

artículo científico publicado en 2013

The microbes we eat: abundance and taxonomy of microbes consumed in a day's worth of meals for three diet types

artículo científico publicado en 2014

The phylogenetic diversity of metagenomes

artículo científico publicado en 2011

The phylogenetic relationships of Chlorobium tepidum and Chloroflexus aurantiacus based upon their RecA sequences

artículo científico publicado en 1998

The value of complete microbial genome sequencing (you get what you pay for).

artículo científico publicado en 2002

There and back again: metagenome-assembled genomes provide new insights into two thermal pools in Kamchatka, Russia

ThinkLab as a vetting system for traditional grants

Towards Automated Phylogenomic Inference

Transcriptomes of post-mitotic neurons identify the usage of alternative pathways during adult and embryonic neuronal differentiation

artículo científico publicado en 2015

Unsuspected diversity among marine aerobic anoxygenic phototrophs

artículo científico publicado en 2002

Use of HAPPY mapping for the higher order assembly of the Tetrahymena genome

artículo científico publicado en 2006

What does the term microbiome mean? And where did it come from? A bit of a surprise .

scholarly article published 2015

Whole genome sequence analysis reveals the broad distribution of the RtxA type 1 secretion system and four novel putative type 1 secretion systems throughout the Legionella genus

artículo científico publicado en 2020

Whole genome sequencing of extended-spectrum β-lactamase producing Klebsiella pneumoniae isolated from a patient in Lebanon

artículo científico publicado en 2015

Whole-genome comparison of Mycobacterium tuberculosis clinical and laboratory strains

artículo científico publicado en 2002

Yeast communities of diverse Drosophila species: comparison of two symbiont groups in the same hosts

artículo científico publicado en 2012

microBEnet: lessons learned from building an interdisciplinary scientific community in the online sphere

artículo científico publicado en 2014

recA mutations that reduce the constitutive coprotease activity of the RecA1202(Prtc) protein: possible involvement of interfilament association in proteolytic and recombination activities

artículo científico publicado en 1993

Dominio Público Uruguay está sostenido por:

Acerca de Dominio Público Uruguay

Ayuda