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Lista de obras de Mary Jo Ondrechen

A Tale of Two Isomerases: Compact versus Extended Active Sites in Ketosteroid Isomerase and Phosphoglucose Isomerase

artículo científico publicado el 4 de octubre de 2011

Active site prediction for comparative model structures with thematics

artículo científico publicado en 2005

Biochemical functional predictions for protein structures of unknown or uncertain function

artículo científico publicado en 2015

Crystal structure of a metal-dependent phosphoesterase (YP_910028.1) from Bifidobacterium adolescentis: Computational prediction and experimental validation of phosphoesterase activity

artículo científico publicado en 2011

Design and evaluation of xanthine based adenosine receptor antagonists: potential hypoxia targeted immunotherapies

artículo científico publicado en 2013

Effects of non-catalytic, distal amino acid residues on activity of E. coli DinB (DNA polymerase IV).

artículo científico publicado en 2012

Functional classification of protein 3D structures from predicted local interaction sites

artículo científico publicado el 1 de diciembre de 2010

Future directions in protein function prediction.

artículo científico publicado en 2002

High-performance prediction of functional residues in proteins with machine learning and computed input features.

artículo científico publicado en 2011

Homology Modeling Inspired Synthesis of 5-HT2A Receptor Inhibitors: A Diazepine Analogue of the Atypical Antipsychotic JL13.

artículo científico publicado en 2017

Identification of functional subclasses in the DJ-1 superfamily proteins

artículo científico publicado en 2007

Identification of residues in DmsD for twin-arginine leader peptide binding, defined through random and bioinformatics-directed mutagenesis.

artículo científico publicado en 2008

Local structure based method for prediction of the biochemical function of proteins: Applications to glycoside hydrolases.

artículo científico publicado en 2015

POOL server: machine learning application for functional site prediction in proteins.

artículo científico publicado en 2012

Partial order optimum likelihood (POOL): maximum likelihood prediction of protein active site residues using 3D Structure and sequence properties

artículo científico publicado en 2009

Pharmacological validation of Trypanosoma brucei phosphodiesterases B1 and B2 as druggable targets for African sleeping sickness

artículo científico publicado en 2011

Prediction of Active Site and Distal Residues in E. coli DNA Polymerase III alpha Polymerase Activity

artículo científico publicado en 2018

Prediction of active sites for protein structures from computed chemical properties.

artículo científico publicado en 2005

Prediction of distal residue participation in enzyme catalysis

artículo científico publicado en 2015

Probing remote residues important for catalysis in Escherichia coli ornithine transcarbamoylase

artículo científico publicado en 2020

Protein function annotation with Structurally Aligned Local Sites of Activity (SALSAs)

artículo científico publicado en 2013

Selective prediction of interaction sites in protein structures with THEMATICS.

artículo científico publicado en 2007

Synthesis and evaluation of 2-halogenated-1,1-bis(4-hydroxyphenyl)-2-(3-hydroxyphenyl)-ethylenes as potential estrogen receptor-targeted radiodiagnostic and radiotherapeutic agents.

artículo científico publicado en 2015

The human Aurora kinase inhibitor danusertib is a lead compound for anti-trypanosomal drug discovery via target repurposing.

artículo científico publicado en 2012