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Lista de obras de Randy Read

A critical examination of the recently reported crystal structures of the human SMN protein.

artículo científico publicado en 2016

A log-likelihood-gain intensity target for crystallographic phasing that accounts for experimental error

artículo científico publicado en 2016

A mosquitocidal toxin with a ricin-like cell-binding domain.

artículo científico publicado en 1995

A multiple-start Monte Carlo docking method.

artículo científico publicado en 1992

A new generation of crystallographic validation tools for the protein data bank

artículo científico publicado en 2011

A new pentameric structure of rotavirus NSP4 revealed by molecular replacement

artículo científico publicado en 2012

A redox switch in angiotensinogen modulates angiotensin release

artículo científico publicado en 2010

AMPylation targets the rate-limiting step of BiP's ATPase cycle for its functional inactivation.

artículo científico publicado en 2017

ANS complex of St John's wort PR-10 protein with 28 copies in the asymmetric unit: a fiendish combination of pseudosymmetry with tetartohedral twinning

artículo científico publicado en 2015

Ab initio solution of macromolecular crystal structures without direct methods

artículo científico publicado en 2017

Accumulating Evidence Suggests That Several AB-Toxins Subvert the Endoplasmic Reticulum-Associated Protein Degradation Pathway To Enter Target Cells ⬇️

artículo científico publicado el 16 de septiembre de 1997

Accurate prediction of protein structures and interactions using a three-track neural network

artículo científico publicado en 2021

Advances, interactions, and future developments in the CNS, Phenix, and Rosetta structural biology software systems

artículo científico publicado en 2013

Aerolysin and pertussis toxin share a common receptor-binding domain

artículo científico publicado en 1997

Allosteric Modulation of Hormone Release from Thyroxine and Corticosteroid-binding Globulins

artículo científico publicado en 2011

An oligomeric state-dependent switch in the ER enzyme FICD regulates AMPylation and deAMPylation of BiP

artículo científico publicado en 2019

Application of DEN refinement and automated model building to a difficult case of molecular-replacement phasing: the structure of a putative succinyl-diaminopimelate desuccinylase from Corynebacterium glutamicum

artículo científico publicado en 2012

Application of the complex multivariate normal distribution to crystallographic methods with insights into multiple isomorphous replacement phasing.

artículo científico publicado en 2003

Assessing the utility of <scp>CASP14</scp> models for molecular replacement

artículo científico publicado en 2021

Assessment of CASP7 predictions in the high accuracy template-based modeling category

artículo científico publicado en 2007

Automated identification of elemental ions in macromolecular crystal structures

artículo científico publicado en 2014

Automated server predictions in CASP7

artículo científico publicado en 2007

Automated structure determination with phenix

Automated structure solution with the PHENIX suite

artículo científico publicado en 2008

Automating crystallographic structure solution and refinement of protein-ligand complexes.

artículo científico publicado en 2013

Azasugar inhibitors as pharmacological chaperones for Krabbe disease

artículo científico publicado en 2015

Biophysical methods: Bigger, better, faster and automatically too?

Book Review

Case-controlled structure validation

artículo científico publicado en 2009

Combining Crystallographic and Structure-Modeling Approaches in Macromolecular Crystallography

scholarly article by Thomas C. Terwilliger et al published January 2014 in Biophysical Journal

Coping with strong translational noncrystallographic symmetry and extreme anisotropy in molecular replacement with Phaser: human Rab27a

artículo científico publicado en 2019

Critical evaluation of comparative model building of Streptomyces griseus trypsin.

artículo científico publicado en 1984

Crystal structure of double helical hexitol nucleic acids

artículo científico publicado en 2002

Crystal structure of rab11 in complex with rab11 family interacting protein 2

artículo científico publicado en 2006

Crystal structures of BMPRII extracellular domain in binary and ternary receptor complexes with BMP10

artículo científico publicado en 2022

Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of verotoxin-1 B-subunit

artículo científico publicado en 1991

Crystallography: crystallographic evidence for deviating C3b structure

artículo científico publicado en 2007

Decision-making in structure solution using Bayesian estimates of map quality: the PHENIX AutoSol wizard

artículo científico publicado en 2009

Density modification of cryo-EM maps

artículo científico publicado en 2020

Detecting outliers in non-redundant diffraction data.

artículo científico publicado en 1999

Detection of translational noncrystallographic symmetry in Patterson functions

artículo científico publicado en 2021

Domain definition and target classification for CASP7

scholarly article by Neil D. Clarke published in January 2007

Erratum: Corrigendum: Mutations in FRMD7, a newly identified member of the FERM family, cause X-linked idiopathic congenital nystagmus

scholarly article published in Nature Genetics

Evaluation of model refinement in CASP13

artículo científico publicado en 2019

Evaluation of template-based modeling in CASP13

scientific article published on 20 August 2019

Exome sequencing identifies NBEAL2 as the causative gene for gray platelet syndrome

artículo científico publicado en 2011

Expanding beyond biological crystallography.

artículo científico publicado en 2016

Experimental phasing: best practice and pitfalls

artículo científico publicado en 2010

Exploiting distant homologues for phasing through the generation of compact fragments, local fold refinement and partial solution combination.

artículo científico publicado en 2018

Factors influencing estimates of coordinate error for molecular replacement

scientific article published on 01 January 2020

Findable Accessible Interoperable Re-usable (FAIR) diffraction data are coming to protein crystallography

artículo científico publicado en 2019

Findable Accessible Interoperable Re-usable (FAIR) diffraction data are coming to protein crystallography

Findable Accessible Interoperable Re-usable (FAIR) diffraction data are coming to protein crystallography

Findable Accessible Interoperable Re-usable (FAIR) diffraction data are coming to protein crystallography

artículo científico publicado en 2019

Fitting electron density by systematic search.

artículo científico publicado en 1992

Fragment-based modeling of NAD binding to the catalytic subunits of diphtheria and pertussis toxins

scientific article published on 01 May 1998

From poor resolution to rich insight

artículo científico publicado en 2010

G-actin provides substrate-specificity to eukaryotic initiation factor 2α holophosphatases

artículo científico publicado en 2015

Graphical tools for macromolecular crystallography in PHENIX

artículo científico publicado en 2012

Gyre and gimble: a maximum-likelihood replacement for Patterson correlation refinement.

artículo científico publicado en 2018

High-resolution structure prediction and the crystallographic phase problem

artículo científico publicado en 2007

How changes in affinity of corticosteroid-binding globulin modulate free cortisol concentration

artículo científico publicado en 2013

How serpins transport hormones and regulate their release

artículo científico publicado en 2016

How vitronectin binds PAI-1 to modulate fibrinolysis and cell migration

artículo científico publicado en 2003

Immunoprophylactic potential of cloned Shiga toxin 2 B subunit

artículo científico publicado en 2000

Improved AlphaFold modeling with implicit experimental information

artículo científico publicado en 2022

Improved crystallographic models through iterated local density-guided model deformation and reciprocal-space refinement

artículo científico publicado en 2012

Improved estimates of coordinate error for molecular replacement.

artículo científico publicado en 2013

Improved molecular replacement by density- and energy-guided protein structure optimization

artículo científico publicado en 2011

Improvement of cryo-EM maps by density modification

artículo científico publicado en 2020

Improvement of molecular-replacement models with Sculptor

artículo científico publicado en 2011

Improving experimental phases for strong reflections prior to density modification

artículo científico publicado en 2013

Incorporation of prior phase information strengthens maximum-likelihood structure refinement

artículo científico publicado en 1998

Insights into Hunter syndrome from the structure of iduronate-2-sulfatase

artículo científico publicado en 2017

Insights into Krabbe disease from structures of galactocerebrosidase

artículo científico publicado en 2011

Intensity statistics in the presence of translational noncrystallographic symmetry

artículo científico publicado en 2013

Interpretation of ensembles created by multiple iterative rebuilding of macromolecular models

artículo científico publicado en 2007

Iterative model building, structure refinement and density modification with the PHENIX AutoBuild wizard

artículo científico publicado en 2008

Iterative-build OMIT maps: map improvement by iterative model building and refinement without model bias

artículo científico publicado en 2008

Liberating crystallographers

scientific article published on 01 September 2005

Likelihood-based experimental phasing in phaser

scholarly article published 2007

Likelihood-based molecular replacement in phaser

scholarly article published 2007

Likelihood-based molecular-replacement solution for a highly pathological crystal with tetartohedral twinning and sevenfold translational noncrystallographic symmetry

artículo científico publicado en 2014

Likelihood-enhanced fast rotation functions

artículo científico publicado en 2004

Likelihood-enhanced fast translation functions

artículo científico publicado en 2005

Local error estimates dramatically improve the utility of homology models for solving crystal structures by molecular replacement

artículo científico publicado en 2015

Macromolecular X-ray structure determination using weak, single-wavelength anomalous data

artículo científico publicado en 2014

Macromolecular structure determination using X-rays, neutrons and electrons: recent developments in Phenix

scientific article published on 02 October 2019

Maximum-likelihood determination of anomalous substructures

artículo científico publicado en 2018

Measuring and using information gained by observing diffraction data

artículo científico publicado en 2020

Methylation-state-specific recognition of histones by the MBT repeat protein L3MBTL2

artículo científico publicado en 2009

Model morphing and sequence assignment after molecular replacement

artículo científico publicado en 2013

Modeling the Carbohydrate-Binding Specificity of Pig Edema Toxin†

artículo científico publicado en 1998

Molecular Mechanism of Z α1-Antitrypsin Deficiency

artículo científico publicado en 2016

Molecular pathology of X linked retinoschisis: mutations interfere with retinoschisin secretion and oligomerisation

artículo científico publicado en 2006

Mutations in FRMD7, a newly identified member of the FERM family, cause X-linked idiopathic congenital nystagmus

artículo científico publicado en 2006

New Section Editor of Acta Cryst. D

artículo científico publicado en 2020

New ways of looking at experimental phasing.

artículo científico publicado en 2003

Noncrystallographic symmetry averaging in phase refinement and extension

scientific article published on 01 January 1997

Not your average density.

artículo científico publicado en 1997

Novel pentameric structure of the diarrhea-inducing region of the rotavirus enterotoxigenic protein NSP4.

artículo científico publicado en 2011

On the application of the expected log-likelihood gain to decision making in molecular replacement.

artículo científico publicado en 2018

Outcome of the First wwPDB Hybrid/Integrative Methods Task Force Workshop

artículo científico publicado en 2015

Outcome of the First wwPDB/CCDC/D3R Ligand Validation Workshop

artículo científico publicado en 2016

Overview of the CCP4 suite and current developments

artículo científico publicado en 2011

PHENIX: a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution

artículo científico publicado en 2010

PHENIX: building new software for automated crystallographic structure determination

artículo científico publicado en 2002

Phaser.MRage: automated molecular replacement

artículo científico publicado en 2013

Phasercrystallographic software

artículo científico publicado en 2007

Phasertng: directed acyclic graphs for crystallographic phasing

artículo científico publicado en 2021

Preliminary crystallographic studies of glycosomal glyceraldehyde phosphate dehydrogenase from Trypanosoma brucei brucei

scientific article published on 01 April 1987

Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of murine interleukin-5

artículo científico publicado en 1994

Real-space refinement in PHENIX for cryo-EM and crystallography

artículo científico publicado en 2018

Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography

artículo científico publicado en 2009

Refined crystal structure of the molecular complex of Streptomyces griseus protease B, a serine protease, with the third domain of the ovomucoid inhibitor from turkey

artículo científico publicado en 1982

Responses to `Atomic resolution': a badly abused term in structural biology.

artículo científico publicado en 2017

Severe diffraction anisotropy, rotational pseudosymmetry and twinning complicate the refinement of a pentameric coiled-coil structure of NSP4 of rotavirus

artículo científico publicado en 2012

Simple algorithm for a maximum-likelihood SAD function.

artículo científico publicado en 2004

Solution structure of the Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus K3 N-terminal domain reveals a Novel E2-binding C4HC3-type RING domain.

artículo científico publicado en 2004

Solving serpin crystal structures

artículo científico publicado en 2011

Strengthening molecular replacement with maximum likelihood in Beast

article by Randy Read published January 2003 in Crystallography Reviews

Structural Basis for Benzothiazinone-Mediated Killing of Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado en 2012

Structural basis for the specificity of renin-mediated angiotensinogen cleavage.

artículo científico publicado en 2018

Structural basis of GM-CSF and IL-2 sequestration by the viral decoy receptor GIF.

artículo científico publicado en 2016

Structural biology. Crystal structure of the CRISPR RNA-guided surveillance complex from Escherichia coli

artículo científico publicado en 2014

Structural insights into the redox-switch mechanism of the MarR/DUF24-type regulator HypR

artículo científico publicado en 2012

Structural mechanism for the carriage and release of thyroxine in the blood

artículo científico publicado en 2006

Structural snapshots illustrate the catalytic cycle of β-galactocerebrosidase, the defective enzyme in Krabbe disease

artículo científico publicado en 2013

Structure and oligomerization of the periplasmic domain of GspL from the type II secretion system of Pseudomonas aeruginosa

artículo científico publicado en 2018

Structure of Gremlin-2 in Complex with GDF5 Gives Insight into DAN-Family-Mediated BMP Antagonism

artículo científico publicado en 2016

Structure of a serpin-protease complex shows inhibition by deformation

artículo científico publicado en 2000

Structure of human saposin A at lysosomal pH.

artículo científico publicado en 2015

Swiveling domain mechanism in pyruvate phosphate dikinase

artículo científico publicado en 2007

Temperature-responsive release of thyroxine and its environmental adaptation in Australians

article

The <i>CCP</i>4 suite: integrative software for macromolecular crystallography

scientific article published in 2023

The Phenix software for automated determination of macromolecular structures

artículo científico publicado en 2011

The S-to-R transition of corticosteroid-binding globulin and the mechanism of hormone release

artículo científico publicado en 2008

The active conformation of plasminogen activator inhibitor 1, a target for drugs to control fibrinolysis and cell adhesion

artículo científico publicado en 1999

The application of multivariate statistical techniques improves single-wavelength anomalous diffraction phasing.

artículo científico publicado en 2003

The identification of three biologically relevant globotriaosyl ceramide receptor binding sites on the Verotoxin 1 B subunit

artículo científico publicado en 1999

Three new Co-editors appointed to Acta Crystallographica Section D, Structural Biology

artículo científico publicado en 2020

Towards engineering hormone-binding globulins as drug delivery agents

artículo científico publicado en 2014

Transcriptional diversity during lineage commitment of human blood progenitors

artículo científico publicado en 2014

Using SAD data in Phaser

artículo científico publicado en 2011

X-ray diffraction reveals the intrinsic difference in the physical properties of membrane and soluble proteins.

artículo científico publicado en 2017

X-ray structure determination using low-resolution electron microscopy maps for molecular replacement

artículo científico publicado en 2015

X-ray structure of lipoamide dehydrogenase from Azotobacter vinelandii determined by a combination of molecular and isomorphous replacement techniques

scientific article published on 01 March 1989

[7] Model phases: Probabilities and bias

article

phenix.mr_rosetta: molecular replacement and model rebuilding with Phenix and Rosetta

artículo científico publicado en 2012

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