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A high-throughput de novo sequencing approach for shotgun proteomics using high-resolution tandem mass spectrometry.

artículo científico publicado en 2010

Characterization of the 70S Ribosome from Rhodopseudomonas palustris using an integrated "top-down" and "bottom-up" mass spectrometric approach

artículo científico publicado en 2004

Characterizing a model human gut microbiota composed of members of its two dominant bacterial phyla

scholarly article

Community proteomics of a natural microbial biofilm

artículo científico publicado en 2005

Comparative Omics and Trait Analyses of Marine Pseudoalteromonas Phages Advance the Phage OTU Concept

artículo científico publicado en 2017

Comparative shotgun proteomic analysis of Clostridium acetobutylicum from butanol fermentation using glucose and xylose

artículo científico publicado en 2011

Comparative temporal proteomics of a response regulator (SO2426)-deficient strain and wild-type Shewanella oneidensis MR-1 during chromate transformation

artículo científico publicado en 2009

Cultivation and quantitative proteomic analyses of acidophilic microbial communities

artículo científico publicado en 2009

Cytochrome 572 is a conspicuous membrane protein with iron oxidation activity purified directly from a natural acidophilic microbial community

artículo científico publicado en 2008

Differential accumulation of form I RubisCO in Rhodopseudomonas palustris CGA010 under Photoheterotrophic growth conditions with reduced carbon sources.

artículo científico publicado en 2009

Ecological distribution and population physiology defined by proteomics in a natural microbial community.

artículo científico publicado en 2010

Enigmatic, ultrasmall, uncultivated Archaea.

artículo científico publicado en 2010

Environmental proteomics of microbial plankton in a highly productive coastal upwelling system ⬇️

artículo científico publicado el 11 de noviembre de 2010

Evaluation of "shotgun" proteomics for identification of biological threat agents in complex environmental matrixes: experimental simulations.

artículo científico publicado en 2005

Expressed peptide tags: an additional layer of data for genome annotation

artículo científico publicado en 2006

Global molecular and morphological effects of 24-hour chromium(VI) exposure on Shewanella oneidensis MR-1.

artículo científico publicado en 2006

Global transcriptomic and proteomic responses of Dehalococcoides ethenogenes strain 195 to fixed nitrogen limitation

artículo científico publicado en 2011

Heterotrophic archaea contribute to carbon cycling in low-pH, suboxic biofilm communities

artículo científico publicado en 2012

Identification of biofilm matrix-associated proteins from an acid mine drainage microbial community.

artículo científico publicado en 2011

Implications of strain- and species-level sequence divergence for community and isolate shotgun proteomic analysis.

artículo científico publicado en 2007

Integrated metagenomics/metaproteomics reveals human host-microbiota signatures of Crohn's disease

artículo científico publicado en 2012

Life-style and genome structure of marine Pseudoalteromonas siphovirus B8b isolated from the northwestern Mediterranean Sea

artículo científico publicado en 2015

MASPIC: intensity-based tandem mass spectrometry scoring scheme that improves peptide identification at high confidence

artículo científico publicado en 2005

Mass spectrometric approaches for characterizing bacterial proteomes.

artículo científico publicado en 2004

Metal affinity enrichment increases the range and depth of proteome identification for extracellular microbial proteins

artículo científico publicado en 2012

Molecular dynamics of the Shewanella oneidensis response to chromate stress

artículo científico publicado en 2006

Phage-induced expression of CRISPR-associated proteins is revealed by shotgun proteomics in Streptococcus thermophilus

artículo científico publicado en 2012

ProRata: A quantitative proteomics program for accurate protein abundance ratio estimation with confidence interval evaluation.

artículo científico publicado en 2006

Proteogenomic approaches for the molecular characterization of natural microbial communities

artículo científico publicado en 2005

Proteogenomic monitoring of Geobacter physiology during stimulated uranium bioremediation

artículo científico publicado en 2009

Proteome changes in the initial bacterial colonist during ecological succession in an acid mine drainage biofilm community

artículo científico publicado en 2011

Proteomic analysis of Clostridium acetobutylicum in butanol production from lignocellulosic biomass

artículo científico publicado en 2011

Shotgun metaproteomics of the human distal gut microbiota

article

Shotgun proteomic monitoring of Clostridium acetobutylicum during stationary phase of butanol fermentation using xylose and comparison with the exponential phase

artículo científico publicado en 2012

Strain-resolved community proteomics reveals recombining genomes of acidophilic bacteria.

artículo científico publicado en 2007

Strategies for metagenomic-guided whole-community proteomics of complex microbial environments

artículo científico publicado en 2011

Sustainable syntrophic growth of Dehalococcoides ethenogenes strain 195 with Desulfovibrio vulgaris Hildenborough and Methanobacterium congolense: global transcriptomic and proteomic analyses

artículo científico publicado en 2011

The probability distribution for a random match between an experimental-theoretical spectral pair in tandem mass spectrometry

artículo científico publicado en 2005

Transcriptomic and proteomic characterization of the Fur modulon in the metal-reducing bacterium Shewanella oneidensis

artículo científico publicado en 2004

Twelve previously unknown phage genera are ubiquitous in global oceans

artículo científico publicado en 2013

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