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A new reference implementation of the PSICQUIC web service

scientific article published on 13 May 2013

A travel guide to Cytoscape plugins

artículo científico publicado en 2012

Active Interaction Mapping Reveals the Hierarchical Organization of Autophagy

artículo científico

CyREST: Turbocharging Cytoscape Access for External Tools via a RESTful API.

artículo científico publicado en 2015

Cytoscape tools for the web age: D3.js and Cytoscape.js exporters

artículo científico publicado en 2014

DDOT: A Swiss Army Knife for Investigating Data-Driven Biological Ontologies

artículo científico publicado en 2019

Evidence mining and novelty assessment of protein-protein interactions with the ConsensusPathDB plugin for Cytoscape

artículo científico publicado en 2010

Functional genomic screen for modulators of ciliogenesis and cilium length

artículo científico publicado en 2010

Integration of biological networks and gene expression data using Cytoscape

artículo científico publicado en 2007

Interpretation of cancer mutations using a multiscale map of protein systems

artículo científico publicado en 2021

KEGGscape: a Cytoscape app for pathway data integration

artículo científico publicado en 2014

NDEx IQuery: a multi-method network gene set analysis leveraging the Network Data Exchange

scientific article published in 2023

NDEx, the Network Data Exchange

artículo científico publicado en 2015

NDEx: Accessing Network Models and Streamlining Network Biology Workflows

NeXO Web: the NeXO ontology database and visualization platform.

artículo científico publicado en 2013

PSICQUIC and PSISCORE: accessing and scoring molecular interactions

artículo científico publicado en 2011

PiNGO: a Cytoscape plugin to find candidate genes in biological networks.

artículo científico publicado en 2011

Systems biology analysis reveals role of MDM2 in diabetic nephropathy

artículo científico publicado en 2016

The 2nd DBCLS BioHackathon: interoperable bioinformatics Web services for integrated applications

artículo científico publicado en 2011

The 3rd DBCLS BioHackathon: improving life science data integration with Semantic Web technologies

artículo científico publicado en 2013

The Cytoscape Automation app article collection.

artículo científico publicado en 2018

The Cytoscape app article collection.

artículo científico publicado en 2014

The DBCLS BioHackathon: standardization and interoperability for bioinformatics web services and workflows. The DBCLS BioHackathon Consortium*

artículo científico publicado en 2010

Using deep learning to model the hierarchical structure and function of a cell

artículo científico publicado en 2018

cyNeo4j: connecting Neo4j and Cytoscape

artículo científico publicado en 2015

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