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Lista de obras de

A comprehensive comparison of comparative RNA structure prediction approaches

artículo científico publicado en 2004

A genome-wide survey of sRNAs in the symbiotic nitrogen-fixing alpha-proteobacterium Sinorhizobium meliloti

artículo científico publicado en 2010

A silent exonic SNP in kdm3a affects nucleic acids structure but does not regulate experimental autoimmune encephalomyelitis

artículo científico publicado en 2013

Abstract shape analysis of RNA.

artículo científico

Abstract shapes of RNA

artículo científico publicado en 2004

Ambivalent covariance models

artículo científico publicado en 2015

Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics

artículo científico publicado en 2006

Complete probabilistic analysis of RNA shapes

artículo científico publicado en 2006

Consensus shapes: an alternative to the Sankoff algorithm for RNA consensus structure prediction

artículo científico publicado en 2005

Conveyor: a workflow engine for bioinformatic analyses.

artículo científico publicado en 2011

Design, implementation and evaluation of a practical pseudoknot folding algorithm based on thermodynamics

artículo científico publicado en 2004

Effective ambiguity checking in biosequence analysis

artículo científico publicado en 2005

Efficient computation of absent words in genomic sequences

artículo científico publicado en 2008

Evaluating the predictability of conformational switching in RNA.

artículo científico publicado en 2004

Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes

artículo científico publicado en 2004

Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices

artículo científico publicado en 2006

Faster computation of exact RNA shape probabilities

artículo científico publicado en 2010

Fine-tuning structural RNA alignments in the twilight zone

artículo científico publicado en 2010

GUUGle: a utility for fast exact matching under RNA complementary rules including G-U base pairing

artículo científico publicado en 2006

GenDB--an open source genome annotation system for prokaryote genomes

artículo científico publicado en 2003

GeneFisher-P: variations of GeneFisher as processes in Bio-jETI.

artículo científico publicado en 2008

Genome-wide profiling of Hfq-binding RNAs uncovers extensive post-transcriptional rewiring of major stress response and symbiotic regulons in Sinorhizobium meliloti.

artículo científico publicado en 2014

Global mapping of transcription start sites and promoter motifs in the symbiotic α-proteobacterium Sinorhizobium meliloti 1021.

artículo científico publicado en 2013

Introduction to RNA secondary structure comparison

artículo científico publicado en 2014

Introduction to stochastic context free grammars

artículo científico

Local similarity in RNA secondary structures.

artículo científico publicado en 2003

Locomotif: from graphical motif description to RNA motif search

artículo científico publicado en 2007

Lost in folding space? Comparing four variants of the thermodynamic model for RNA secondary structure prediction

artículo científico publicado en 2011

Pareto optimization in algebraic dynamic programming

artículo científico publicado en 2015

Personalized cloud-based bioinformatics services for research and education: use cases and the elasticHPC package.

artículo científico publicado en 2012

Pure multiple RNA secondary structure alignments: a progressive profile approach

artículo científico publicado en 2004

RNA-related tools on the Bielefeld Bioinformatics Server

artículo científico publicado en 2003

Riboregulation in plant-associated α-proteobacteria

artículo científico publicado en 2014

Semantics and ambiguity of stochastic RNA family models

artículo científico

Shape based indexing for faster search of RNA family databases

artículo científico publicado en 2008

The RNA shapes studio

artículo científico publicado en 2014

Thermodynamic matchers for the construction of the cuckoo RNA family

artículo científico publicado en 2015

Two interactive Bioinformatics courses at the Bielefeld University Bioinformatics Server

artículo científico publicado en 2008

Versatile and declarative dynamic programming using pair algebras

artículo científico publicado en 2005

WAMI: a web server for the analysis of minisatellite maps

artículo científico publicado en 2010

XML schemas for common bioinformatic data types and their application in workflow systems

artículo científico publicado en 2006

XenDB: full length cDNA prediction and cross species mapping in Xenopus laevis

artículo científico publicado en 2005

e2g: an interactive web-based server for efficiently mapping large EST and cDNA sets to genomic sequences

artículo científico publicado en 2004

pknotsRG: RNA pseudoknot folding including near-optimal structures and sliding windows

artículo científico publicado en 2007

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