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A Simple Algorithm for Computing the Lempel Ziv Factorization

A comparison of index-based lempel-Ziv LZ77 factorization algorithms

article

BOND: Basic OligoNucleotide Design ⬇️

artículo científico publicado el 27 de febrero de 2013

Computing Longest Previous Factor in linear time and applications

Computing the Longest Previous Factor

Correcting Illumina data

artículo científico publicado en 2014

DELPHI: accurate deep ensemble model for protein interaction sites prediction

artículo científico publicado en 2020

E-MEM: efficient computation of maximal exact matches for very large genomes

artículo científico publicado en 2014

Fast computation of neighbor seeds

artículo científico publicado en 2009

HISEA: HIerarchical SEed Aligner for PacBio data

artículo científico publicado en 2017

HiTEC: accurate error correction in high-throughput sequencing data

artículo científico publicado en 2010

LASER: Large genome ASsembly EvaluatoR

artículo científico publicado en 2015

Maximal repetitions in strings

Multiple spaced seeds for homology search

artículo científico publicado en 2007

Predicting Protein-Protein Interactions Using SPRINT

artículo científico publicado en 2020

RACER: Rapid and accurate correction of errors in reads

artículo científico publicado en 2013

Repetitions in strings: Algorithms and combinatorics

SAGE2: Parallel Human Genome Assembly

artículo científico publicado en 2017

SAGE: String-overlap Assembly of GEnomes

artículo científico publicado en 2014

SHRiMP2: Sensitive yet Practical Short Read Mapping ⬇️

artículo científico publicado el 28 de enero de 2011

SPRINT: ultrafast protein-protein interaction prediction of the entire human interactome

artículo científico publicado en 2017

The “runs” conjecture

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