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Lista de obras de

A network-based approach to quantifying the impact of biologically active substances

artículo científico publicado en 2011

Assessment of network perturbation amplitudes by applying high-throughput data to causal biological networks

artículo científico publicado en 2012

Biological Expression Language

A domain specific language for causal, correlative, and associative biological relations

Causal reasoning identifies mechanisms of sensitivity for a novel AKT kinase inhibitor, GSK690693.

artículo científico publicado en 2010

DDOT: A Swiss Army Knife for Investigating Data-Driven Biological Ontologies

artículo científico publicado en 2019

Decoding of persistent multiscale structures in complex biological networks

artículo científico publicado en 2020

Deep distributed computing to reconstruct extremely large lineage trees

artículo científico publicado en 2022

Dynamic post-translational modification profiling of Mycobacterium tuberculosis-infected primary macrophages

artículo científico publicado en 2020

Functional Landscape of SARS-CoV-2 Cellular Restriction

artículo científico publicado en 2020

HiDeF: identifying persistent structures in multiscale 'omics data

scientific article published on 07 January 2021

Interpretation of cancer mutations using a multiscale map of protein systems

artículo científico publicado en 2021

Modeling of RAS complexes supports roles in cancer for less studied partners

artículo científico

Multiscale community detection in Cytoscape

scientific article published on 23 October 2020

NDEx 2.0: A Clearinghouse for Research on Cancer Pathways.

artículo científico publicado en 2017

NDEx IQuery: a multi-method network gene set analysis leveraging the Network Data Exchange

scientific article published in 2023

NDEx, the Network Data Exchange

artículo científico publicado en 2015

NDEx: A Community Resource for Sharing and Publishing of Biological Networks

artículo científico publicado en 2017

NeXO Web: the NeXO ontology database and visualization platform.

artículo científico publicado en 2013

Network propagation in the cytoscape cyberinfrastructure.

artículo científico publicado en 2017

On Crowd-verification of Biological Networks

artículo científico publicado en 2013

Reverse causal reasoning: applying qualitative causal knowledge to the interpretation of high-throughput data

artículo científico publicado en 2013

The Minimum Information about a Molecular Interaction Causal Statement (MI2CAST)

artículo científico publicado en 2020

Thought Graph: Generating Thought Process for Biological Reasoning

artículo científico publicado en 2024

ndexr - an R package to interface with the Network Data Exchange.

artículo científico publicado en 2017

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